معلومة

خريطة الجينات إلى eQTL / pQTL

خريطة الجينات إلى eQTL / pQTL


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

من بين 192 جينًا مستهدفًا ، هناك 79 جينة مرتبطة بـ eQTL أو pQTL في حالة غذائية واحدة على الأقل.

عبارة عن سطر بحثي بعنوان "تشريح جيني متعدد الطبقات وأوميكس لنشاط الميتوكوندريا في مجموعة مرجعية للماوس"

بقدر ما أعرف أن eQTL هو SNP (نمط وراثي معين) يؤثر على التعبير الجيني. كيف يمكنني تعيين الجين إذن إلى eQTL؟ الجين هو تسلسل على جينوم مرجعي. الأنماط الجينية لجين معين هي مجرد اختلافات في تسلسل هذا الجين المحدد. لذا ، لا يمكن أن يكون الجين نفسه eQTL ، يمكن أن يكون النمط الجيني المحدد (مع اختلاف) ، أليس كذلك؟

لذا ، كيف يمكن أن يتم تعيين جين واحد (لنقل GENE22 ، الموقع: 10-100) إلى eQTL (SNP ضمن GENE22 ، الموقع: 12) في حالة غذائية واحدة ولكن لم يتم تعيينه لـ eQTL في حالة غذائية أخرى إذا كنا لا يزالون يتحدثون عن نفس الجين ونفس موقع eQTL؟ لذلك ، لست متأكدًا تمامًا مما يقصدونه أو ما الذي رسموه هناك.


تأخذ قائمة SNPs وقائمة بقيم التعبير الجيني وتقوم بتوصيلها بشيء مثل هذا: http://www.bios.unc.edu/research/genomic_software/Matrix_eQTL/

لذا ، كيف يمكن أن يتم تعيين جين واحد (لنقل GENE22 ، الموقع: 10-100) إلى eQTL (SNP ضمن GENE22 ، الموقع: 12) في حالة غذائية واحدة ولكن لم يتم تعيينه لـ eQTL في حالة غذائية أخرى إذا كنا لا يزالون يتحدثون عن نفس الجين ونفس موقع eQTL؟ لذلك ، لست متأكدًا تمامًا مما يقصدونه أو ما الذي رسموه هناك.

يرتبط SNP بتغييرات مستوى التعبير في هذا الجين لحالة غذائية واحدة ولكن نفس SNP لا يرتبط بتغييرات مستوى التعبير في حالة غذائية أخرى. من الممكن ألا يظهر SNP أبدًا في عينات من الحالة الغذائية الأخرى.


شاهد الفيديو: QTL Analysis Explanation and Example (يونيو 2022).


تعليقات:

  1. Arwyroe

    كاتب ، هل أنت من موسكو بأي فرصة؟

  2. Gardacage

    ذهبت بطريق الخطأ إلى المنتدى وشاهدت هذا الموضوع. يمكنني مساعدتك بالنصيحة. معا يمكننا إيجاد حل.

  3. Derrian

    حسنًا ، شكرًا جزيلاً لك على مساعدتك في هذا الأمر.

  4. Arashimuro

    أنا ضليعة في هذا. يمكنني المساعدة في حل المشكلة. معًا يمكننا الوصول إلى الإجابة الصحيحة.

  5. Kermode

    أنصحك أن تأتي في موقع حيث يوجد الكثير من المعلومات حول موضوع مثير للاهتمام لك. لن اندم.

  6. Veryl

    إنه رأي رائع ، مسلية إلى حد ما



اكتب رسالة