معلومة

8.4D: التصنيف والتسمية - علم الأحياء

8.4D: التصنيف والتسمية - علم الأحياء



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

التسمية هي مجموعة القواعد والأعراف التي تحكم أسماء الأصناف.

أهداف التعلم

  • التعرف على العوامل المرتبطة بالتصنيف العام والتسميات المستخدمة لتصنيف الكائنات الحية الدقيقة

النقاط الرئيسية

  • يتم تنظيم الأسماء (التسمية) المعطاة إلى بدائيات النوى من خلال المدونة الدولية لتسميات البكتيريا (الكود البكتيريولوجي).
  • التصنيف هو تجميع الكائنات الحية في مجموعات أكثر شمولًا بشكل تدريجي على أساس علم التطور والنمط الظاهري ، في حين أن التسمية هي تطبيق القواعد الرسمية لتسمية الكائنات الحية.
  • تتم كتابة الأسماء التصنيفية بخط مائل (أو تسطيرها بخط اليد) مع الحرف الأول majuscule ، باستثناء نعوت الأنواع والأنواع الفرعية.

الشروط الاساسية

  • التسمية: التسمية ذات الحدين (وتسمى أيضًا التسمية ذات الحدين أو التسميات الثنائية) هي نظام رسمي لتسمية أنواع الكائنات الحية من خلال إعطاء كل اسم مكون من جزأين ، وكلاهما يستخدم أشكالًا نحوية لاتينية ، على الرغم من أنه يمكن أن يعتمد على كلمات من لغات أخرى . يُطلق على هذا الاسم اسم ذي الحدين (والذي يمكن اختصاره إلى "ذي الحدين" فقط) ، أو اسمًا علميًا أو اسمًا علميًا ؛ بشكل غير رسمي ، يطلق عليه أيضًا اسم لاتيني.
  • بدائيات النوى: (/proʊkæri.oʊts/، pro-kah-ree-otes or / proʊkæriəts /، pro-kah-ree-ts) مجموعة من الكائنات الحية التي تفتقر خلاياها إلى نواة الخلية (karyon) ، أو أي عضيات أخرى مرتبطة بالغشاء. معظم بدائيات النوى هي كائنات وحيدة الخلية ، على الرغم من أن القليل منها مثل البكتيريا الفطرية لها مراحل متعددة الخلايا في دورات حياتها.
  • الكود البكتريولوجي: الكود الدولي لتسميات البكتيريا (ICNB) أو الكود البكتيريولوجي (BC) يحكم الأسماء العلمية للبكتيريا ، بما في ذلك العتائق. يشير إلى قواعد تسمية أصناف البكتيريا ، وفقًا لترتيبها النسبي. على هذا النحو هو أحد رموز التسمية في علم الأحياء.

التسمية هي مجموعة القواعد والأعراف التي تحكم أسماء الأصناف. إنه تطبيق القواعد الرسمية لتسمية الكائنات الحية. التصنيف هو تجميع الكائنات الحية في مجموعات تدريجية أكثر شمولاً على أساس علم التطور والنمط الظاهري. على الرغم من عدم وجود تصنيف رسمي وكامل لبدائيات النوى ، فإن الأسماء (المصطلحات) المعطاة لبدائيات النوى تنظمها المدونة الدولية لتسميات البكتيريا (الكود البكتيري) ، وهو كتاب يحتوي على اعتبارات عامة ومبادئ وقواعد ومذكرات ونصائح مختلفة بطريقة مماثلة لمدونات التسميات للمجموعات الأخرى.

تمت مراجعة الأصناف التي تم وصفها بشكل صحيح في دليل بيرجي لعلم الجراثيم النظامي ، والذي يهدف إلى المساعدة في تحديد الأنواع ويعتبر أعلى سلطة. نسخة على الإنترنت من الخطوط العريضة التصنيفية للبكتيريا والعتائق متاحة. تتم كتابة الأسماء التصنيفية بخط مائل (أو تسطيرها بخط اليد) مع الحرف الأول majuscule باستثناء نعوت الأنواع والأنواع الفرعية. على الرغم من كونها شائعة في علم الحيوان ، فإن الأسماء الحشو (مثل بيسون بيسون) غير مقبولة ولا يمكن إعادة استخدام أسماء الأصناف المستخدمة في علم الحيوان أو علم النبات أو علم الفطريات للبكتيريا (علم النبات وعلم الحيوان يشتركان في الأسماء).

بالنسبة للبكتيريا ، يجب أن تحمل الأسماء الصالحة اسمًا لاتينيًا أو نيولاتينيًا ويمكن فقط استخدام الأحرف اللاتينية الأساسية (w و j ضمناً ، راجع تاريخ الأبجدية اللاتينية لهما) ، وبالتالي لا يتم قبول الواصلات واللهجات والحروف الأخرى ويجب ترجمتها بشكل صحيح (على سبيل المثال ß = ss). اليونانية القديمة المكتوبة بالأبجدية اليونانية ، يجب ترجمتها إلى الأبجدية اللاتينية.

تمت تسمية العديد من الأنواع على اسم أشخاص ، سواء كان مكتشفًا أو شخصًا مشهورًا في مجال علم الأحياء الدقيقة ، على سبيل المثال السالمونيلا بعد D.E. السلمون ، الذي اكتشفه (وإن كان باسم "Bacillus typhi"). بالنسبة للصفة العامة ، يجب أن تكون جميع الأسماء المشتقة من الأشخاص في الحالة الترشيحية للإناث ، إما عن طريق تغيير النهاية إلى -a أو إلى المصغر -ella ، اعتمادًا على الاسم. بالنسبة للصفة المحددة ، يمكن تحويل الأسماء إما إلى شكل صفة (إضافة -nus (m.) ، -na (f.) ، -num (n.) وفقًا لجنس اسم الجنس) أو المضاف إليه الاسم اللاتيني.

تمت تسمية العديد من الأنواع (الاسم المحدد) على اسم المكان الذي توجد فيه أو تم العثور عليه (على سبيل المثال Borrelia burgdorferi). يتم إنشاء أسمائهم من خلال تكوين صفة من خلال ضم اسم المنطقة إلى النهاية -ensis (m. أو f.) أو ense (n.) بالاتفاق مع جنس اسم الجنس ، ما لم توجد صفة لاتينية كلاسيكية للمكان . ومع ذلك ، لا ينبغي استخدام أسماء الأماكن كأسماء في الحالة المضافة.

بالنسبة إلى بدائيات النوى (البكتيريا والعتائق) ، لا يتم استخدام المملكة المرتبة (على الرغم من أن بعض المؤلفين يشيرون إلى الشعبة على أنها ممالك). إذا تم وضع نوع جديد أو معدل في رتب جديدة ، وفقًا للقاعدة 9 من القانون البكتريولوجي ، يتم تشكيل الاسم بإضافة لاحقة مناسبة إلى جذع اسم النوع جنس. بالنسبة للفئة الفرعية والفئة ، يتم اتباع التوصية عمومًا ، مما يؤدي إلى جمع محايد ، ولكن بعض الأسماء لا تتبع ذلك وبدلاً من ذلك تضع في الاعتبار قواعد اللغة اليونانية اللاتينية (مثل صيغ الجمع الأنثوية Thermotogae و Aquificae و Chlamydiae ، وصيغ الجمع الذكورية Chloroflexi ، Bacilli ، و Deinococci ، والجمعيات اليونانية Spirochaetes ، Gemmatimonadetes ، و Chrysiogenetes).

لا يغطي القانون البكتريولوجي Phyla ، ومع ذلك ، يتبع المجتمع العلمي عمومًا تصنيف Ncbi و Lpsn ، حيث يكون اسم الشعبة عمومًا هو الجمع من النوع الجنس ، باستثناء Firmicutes و Cyanobacteria و Proteobacteria ، الأسماء لا تنبع من اسم جنس. يتم تجاهل التصنيف الأعلى الذي اقترحه كافاليير سميث بشكل عام من قبل مجتمع علم التطور الجزيئي (انظر أعلاه).


منهجي (التصنيف) وتصنيف الحيوانات

مصطلح علم اللاهوت النظامي مشتق من الكلمة اليونانية اللاتينية - systema - كما هو مطبق على أنظمة التصنيف التي طورها علماء الطبيعة الأوائل ، ولا سيما لينيوس.

وفقًا لسيمبسون ، علم اللاهوت النظامي هو الدراسة العلمية لأنواع الكائنات الحية وتنوعها وأي وجميع العلاقات فيما بينها. تشمل علم اللاهوت النظامي التصنيف والتعرف والتصنيف والتسمية وجميع الجوانب الأخرى للتعامل مع أنواع مختلفة من الكائنات الحية والبيانات المتراكمة عنها مدرجة أيضًا في علم اللاهوت النظامي.

أصل وتطور علم اللاهوت النظامي:

بدأ أصل وتطور علم اللاهوت النظامي والحضارة الإنسانية في وقت واحد ، أي أن حضارة الإنسان هي المنهجيات أو بعبارة أخرى نقول إنه في حياتنا اليومية أولئك الذين يحافظون على منازلهم بشكل منهجي يعني أنهم متحضرين. مع تطور المعرفة ، بدأوا في تسمية النباتات والحيوانات وفقًا لاختيارهم.

يأتي دليل التصنيف الأقدم من الفيدا والأوبنشاد (1500 قبل الميلاد إلى 600 قبل الميلاد). في الفيدا والأوبنشاد ، تُستخدم العديد من المصطلحات الفنية في وصف النباتات وأجزاء النبات ، شكليًا وتشريحًا.

تم جمع ودراسة النباتات ذات الأهمية الطبية. ساهم شاراكا وسوسروتا ، العالمان الهنود البارزون والأطباء الأيورفيدا ، كثيرًا في معرفتنا بتنوع الكائنات الحية وفائدتها.

يعد Vrikshayurveda (علم النباتات والحياة النباتية) من أكثر الأعمال البعيدة التي تتناول الحياة النباتية بطريقة علمية ، والتي جمعتها بارا سارة ، حتى قبل بداية العصر المسيحي ، والتي شكلت أساس التدريس النباتي والدراسات الطبية في الهند القديمة.

قام العديد من العلماء اليونانيين الأوائل خاصة أبقراط (460-377 قبل الميلاد) وديموقريطس (465-370 قبل الميلاد) بعمل ملاحظات على الحيوانات ولكن تصنيفهم لم يكن مفيدًا. درس أرسطو في وقت لاحق (384-322 قبل الميلاد) أيضًا الكائنات الحية ، أي النباتات والحيوانات وأعطى بيانًا بشأن التصنيف: & # 8220 يمكن تمييز الحيوانات حسب طريقة عيشها وعملها وعاداتها وأجزاء جسمها & # 8221.

وصنف المجموعات الرئيسية من الحيوانات كطيور وأسماك وحشرات وحيتان. أرسطو يسمى & # 8220 والد التصنيف البيولوجي. & # 8221 يُعرف ثيوفراستوس (370-385 قبل الميلاد) الذي كان تلميذ أفلاطون ثم أرسطو ، باسم & # 8220 والد علم النبات & # 8221، تصنف جميع النباتات على أساس الشكل والملمس وتقسيمها إلى أشجار وشجيرات وتحت الشجيرات والأعشاب.

كان تصنيفه مصطنعًا تمامًا وفي بلده & # 8220 هيستوريا بلانتاروم & # 8221 قام بتصنيف ووصف 480 نبتة.

تعرّف Albertus Magnus (1193-1280) على الاختلافات بمساعدة العدسات الخام بين أحادي الفلقة وثنائيات الفلقة واعترف بتصنيف ثيوفراستوس. تعرف الألماني أوتو برونفيلس (1464-1554) لأول مرة على مجموعة نباتات Perfecti و Imperfect بناءً على وجود الأزهار أو عدم وجودها على التوالي.

صنف جيروم بوك (1498-1554) ، وهو ألماني آخر ، النباتات إلى أشجار وشجيرات وأعشاب. Andrea Cesalpino (1519-1603) صنفت النباتات تصنيفًا على أساس العادة وقسمتها على صفات الثمار والبذور.

صنف غاسبارد بوهين (1560-1624) النباتات على أساس الملمس والشكل. كان أول من اكتشف التسمية ذات الحدين على الرغم من أنه يُنسب عادةً إلى Linnaeus. في تاريخ علم اللاهوت النظامي ، قام جون راي (1627-1705) بعمل رائع. قبله كان التصنيف لا أساس له ولم يكن هناك أي خلفية علمية قوية. سافر جون راي كثيرًا في أوروبا مع فرانسيس ويلوجبي (1635-1672).

لم يكتفوا بملاحظة وجمع النباتات والحيوانات ، بل خططوا أيضًا لتصنيفها. لسوء الحظ ، توفي ويلوجبي قبل الأوان وبعد ذلك نشر جون راي كتابه Historia Generalis Plantarum في ثلاثة مجلدات بين عامي 1668 و 1704. في هذا الكتاب ، وصف جون راي بدقة وبتفاصيل دقيقة وفهرس أكثر من 18000 نبات.

كان أول شخص أدرك الفرق بين الجنس والأنواع ومن خلال تقييم كل من أوجه التشابه والاختلاف في الحيوانات وصل إلى تصنيف طبيعي أعلى من الأشخاص السابقين.

بعد جون راي ، كان أبرز رجل في مجال التصنيف كارولوس لينيوس (1707-1778) الذي غالبًا ما يشار إليه باسم & # 8220 والد التصنيف & # 8221 لمساهمته البارزة في هذا المجال. زار لينيوس العديد من الدول الأوروبية وأجرى ملاحظات دقيقة على النباتات والحيوانات.

نشر مخطط التصنيف الخاص به في كتابه الشهير Systema Naturae عام 1753. نُشرت الطبعة العاشرة من هذا الكتاب في عام 1758 وكان الأول من يناير من ذلك العام يمثل بداية التطبيق المتسق لما يُعرف باسم & # 8220 نظام الحدين للتسمية & # 8221.

هذا النظام الذي يقدم مبادئ تسمية الكائن الحي بكلمتين ، اقترحه لينيوس لأول مرة ويتبع عالميًا اليوم. أصبح عمل لينيوس هذا أساس علم اللاهوت النظامي. كما وضع حدودًا واضحة للأنواع.

كتب جان بابتيست مونيه دي لامارك (1744-1829) فلور فرانسواز عام 1778 حيث وضع مبادئ مفهومه للتصنيف الطبيعي. شرح تشارلز داروين (1809-1882) ، أحد دعاة التطور العظيم ، على أساس دراساته المكثفة وبمساعدة الأدلة المقنعة التي تم جمعها في رحلة بيجل ، أصل الأنواع من خلال الانتقاء الطبيعي.

لم تؤثر نظريات التطور الخاصة بلامارك وداروين بشكل كبير على علم اللاهوت النظامي الكلاسيكي لينيون فحسب ، بل رفضت تمامًا أيضًا فكرة ما قبل لامارك عن ثبات الأنواع. قدم إرنست هيكل (1866) طريقة تمثيل نسالة الأشجار عن طريق الأشجار أو المخططات المتفرعة.

قدم السير جوليان هكسلي (1940) المصطلح الجديد & # 8220 النظاميات الجديدة & # 8221 الذي يدمج نتائج الدراسات الحديثة في مختلف فروع علوم الحياة في علم اللاهوت النظامي الذي يعدل بعض الأفكار القديمة لعلم اللاهوت النظامي الكلاسيكي. يعتمد تعريف الأنواع اليوم على السكان لأن تطور علم الوراثة السكاني الذي أثر بدوره على زيادة تطوير النظم النظامية السكانية.

فائدة النظاميات (التصنيف):

لا يمكن إجراء أي مسح بيئي علمي دون تحديد دقيق لجميع الأنواع ذات الأهمية البيئية. اعتماد مماثل على علم اللاهوت النظامي صحيح بالنسبة لمجالات العلوم الأخرى. حتى علماء الأحياء التجريبية تعلموا تقدير ضرورة التصنيف السليم. يمكن لمنظمي النظام أن يملأوا العديد من الفجوات في معرفتنا.

هناك أكثر من مليون نوع من الحيوانات وأكثر من نصف مليون نوع من النباتات موصوفة في المحيط الحيوي. بالإضافة إلى ذلك ، يجب أن يكون هناك عدد كبير من الأنواع النباتية والحيوانية التي لم يتم وصفها بعد. بدون معرفة علم اللاهوت النظامي ، لا يمكن اكتشاف أنواع جديدة من النباتات والحيوانات ولا يمكننا معرفة الكثير عن الكائنات الحية المحيطة بنا.

لذلك ، هناك ضرورة كبيرة أو فائدة للمنهجيات.

نظامالتصنيف:

هناك ثلاثة أنظمة تصنيفات مختلفة تم اقتراحها حتى الآن من قبل خبراء تصنيف مختلفين.

1. نظام التصنيف الاصطناعي:

يعتمد هذا النوع من التصنيف على سمات الملاءمة دون علاقة بتصنيف أهمية النشوء والتطور استنادًا إلى الأحرف المقدمة خطأً للإشارة إلى علاقة النشوء والتطور أيضًا التصنيف بناءً على معيار واحد تم اختياره بشكل تعسفي ، بدلاً من تطور مجمل الأحرف المعروفة باسم التصنيف الاصطناعي.

تم اعتماد نظام التصنيف هذا من قبل بليني في القرن الأول الميلادي للحيوانات على أساس الموائل ، مثل الأرض والهواء والماء.

وبناءً عليه تم تصنيف الحيوانات إلى فئتين على أساس قدرتها على الطيران:

(ط) الحيوانات التي يمكنها الطيران و

(2) الحيوانات التي لا تستطيع الطيران.

في المجموعة الأولى ، تم وضع الحيوانات غير ذات الصلة مثل الفراشات والطيور والخفافيش معًا.

تصنيف النباتات على أساس العادة إلى:

(4) الأشجار أيضًا مصطنعة.

المعايير المستخدمة في هذا التصنيف ، على الرغم من بساطتها وسهولة متابعتها ، إلا أنها تعسفية ولا تعكس أي علاقة طبيعية موجودة بين الكائنات الحية. علاوة على ذلك ، فإنه يؤدي إلى تجمع غير متجانس للكائنات غير ذات الصلة تحت عنوان واحد ولا ينصف مجموع خصائص الكائن الحي.

كان النظام الذي اعتمده Linnaeus مصطنعًا أيضًا حيث تم تصنيف النباتات على أساس عدد وترتيب الأسدية والكاربيل. يتم الاحتفاظ بأنواع الكائنات الحية وثيقة الصلة بعيدًا في نظام التصنيف هذا.

2. نظام التصنيف الطبيعي:

يمكن تعريف التصنيف الطبيعي على أنه & # 8220 التصنيف على أساس الأحرف التي تشير إلى العلاقات الطبيعية & # 8221. تتفق الكائنات الحية من فئة منهجية طبيعية مع بعضها البعض في العديد من الشخصيات لأنها من نسل سلف واحد مشترك. يعتمد نظام التصنيف الطبيعي على التشابه.

يختلف علماء الحيوان وعلماء النبات في تفسيرهم لتداعيات نظام التصنيف هذا. وفقًا لعلماء الحيوان ، يشتمل نظام التصنيف الطبيعي على اتجاهات التطور والتطور التي تتضح في الكلمة & # 8220 طبيعة & # 8221.

يرى علماء النبات أن النظام الطبيعي لا يشمل بالضرورة اتجاهات التطور في النباتات. هنا اقترحوا & # 8220 نظام الجينات & # 8221 تصنيف منفصل عن & # 8220 نظام طبيعي & # 8221 لتشمل الاتجاهات التطورية في النباتات. ال & # 8220 نظام طبيعي & # 8221 تم اقتراح تصنيف المملكة النباتية من قبل جورج بنثام (1800-1844) وجوزيف دالتون هوكر (1817-1911).

3. نظام التصنيف النشئي:

يعتمد نظام النشوء والتطور على العلاقة التطورية والوراثية للكائنات الحية. إنها تمكننا من معرفة أسلاف أو مشتقات أي نوع. معرفتنا في الوقت الحاضر غير كافية لبناء تصنيف مثالي للتطور ، وتتكون جميع أنظمة النشوء والتطور الحالية من خلال مزيج من الأدلة الطبيعية والتطور.

تم اعتماد هذا النظام من قبل Adolph Engler (1844-1930) و Karl A.E. Prantl و John Hutchinson (1884-1974) في تصنيف النباتات.

التسمية:

يتم تعريف التسمية على أنها نظام تسمية النباتات والحيوانات وغيرها من الأشياء أو مجموعات النباتات والحيوانات والأشياء الأخرى. الأسماء العلمية هي لغة علماء التصنيف. عندما يحدد عالم التصنيف ويصف المجموعة الطبيعية للحيوانات ، فإنه يعطي أسماء علمية مناسبة للمجموعات.

الأسماء الشائعة لا تخدم الغرض لأن حيوانًا معينًا معروف بأسماء مختلفة في أجزاء مختلفة من العالم. على سبيل المثال ، يُعرف الطائر الذي نعرفه باسم gauraiya في الهند وباكستان بأسماء مختلفة في بلدان أخرى ، مثل House sparrow في إنجلترا Pardal في إسبانيا Musch في Holland Suzune في اليابان وما إلى ذلك.

علاوة على ذلك ، يمكن استخدام الاسم الشائع لأنواع مختلفة من الحيوانات. على سبيل المثال ، يتم استخدام اسم kenchua لكل من دودة الأرض و Ascaris. من ناحية أخرى ، يستخدم الاسم العلمي عالميًا لنوع معين أو مجموعة معينة من الحيوانات. على سبيل المثال ، يطلق علماء الحيوان في جميع أنحاء العالم على gauraiya أو House sparrow اسم Passer localus.

للتأكد من أن اسمًا علميًا واحدًا يمثل نوعًا معينًا من الحيوانات في كل مكان وهو الاسم الوحيد لذلك الكائن الحي ، يجب على عالم التصنيف رؤية ما يلي:

(1) لم يتم إعطاء الاسم المختار لحيوان إلى حيوان أو نبات آخر.

(2) تم وصف الحيوانات والنباتات بمثل هذه التفاصيل بحيث يستطيع عالم تصنيف آخر أن يحدد من الوصف بالضبط نوع الحيوان الذي أعطي له الاسم.

(3) وضع الحيوان أو النبات على النحو الواجب في نظام التصنيف الذي يؤسس علاقاته.

التسميات ذات الحدين:

إن تاريخ نظام التسمية ذو الحدين طويل جدًا. قبل قرنين من الزمن قبل المسيح ، استخدم كاتو اسمين للنباتات في كتابه De Re Rustica. لكنه لم يكن يعلم أن الأجناس تتكون عادة من عدة أنواع. في وقت لاحق ، تم تطوير فكرتين مع تطور فكرة التسمية.

كان أحدهما هو ترجمة الأسماء اليونانية الوصفية المستخدمة للأجناس إلى اللاتينية. نتيجة لهذه الترجمة إلى اللاتينية ، يتكون الاسم العام من كلمتين.

كانت تسمى هذه الأسماء العامة الثنائية. كان الاتجاه الآخر هو استخدام عبارات وصفية لأسماء معينة. أدت هذه الميول بالتزامن إلى ظهور نظام متعدد الحدود للتسميات. وفقًا لهذا النظام ، كان اسم النبات مكونًا من عدة كلمات في سلسلة تحمل وصفًا موجزًا ​​للنبات.

على سبيل المثال ، استخدم بنثام اسم Caryophyllum saxatilis ، Folis gramineus umbellatis corymbis لتمثيل Caryophyllum الذي نما على الصخور ، بأوراق شبيهة بالعشب وأزهار في umbellate corymbs. كان هذا نظامًا مرهقًا.

في منتصف القرن السادس عشر ، تم تغيير عدد من الأسماء العامة الثنائية بواسطة Brunfels إلى أسماء فردية. اتبع Dodonaeus و Gaspard Bauhin لاحقًا بشكل عام نظام ذي الحدين ، لكن يُنسب عادةً إلى Linnaeus الذي استخدمه بعد أكثر من مائة عام في كتابه Species Plantarum. وفقًا لهذه التسمية ذات الحدين ، تم اختصار الأسماء الطويلة بحيث يمكن استخدامها بمزيد من الراحة.

يفترض هذا النظام أن كل فرد في مملكة النبات والحيوان يتكون من كلمتين فقط باللاتينية ، الكلمة الأولى تشير إلى الجنس ، والثانية ، الصفة الإضافية ، التي تشير إلى الأنواع الخاصة بهذا الجنس. يُعرف أيضًا باسم نظامين للتسمية أو نظام ثنائي. على سبيل المثال ، جنس الحصان الحديث هو Equus.

من بين أنواعها Equus caballus و Equus asinus. كلمة caballus و asinus الواقفة أعلاه ليس لها معنى في التصنيف فهي ليست أسماء أنواع أو أي شيء آخر. فقط عندما تكون جزءًا من مجموعة ذات الحدين ، فإنها تكون ذات مغزى تصنيفيًا ومن ثم يكون المزيج هو اسم النوع.

في كثير من الأحيان ، يتم إعطاء أسماء محددة للحيوانات والنباتات تكريما لبعض الأشخاص. إذا كان الشخص الذي تم تكريمه رجلاً ينتهي الاسم المحدد به & # 8220i & # 8221. على سبيل المثال ، سميت دودة الأرض ، Lumbricus friendi على اسم القس هـ. فريند. إذا كان المكرم امرأة ينتهي الاسم المحدد & # 8220ae & # 8221. في بعض الأحيان ، يشير الاسم المحدد إلى منطقة محلية (على سبيل المثال ، إنديكا للهندي) أو لون (على سبيل المثال ، النيجر للأسود).

في الأدبيات العلمية ، من الممارسات العامة كتابة اسم محدد متبوعًا باسم الشخص الذي وصف النوع لأول مرة والسنة التي فعل فيها ذلك. على سبيل المثال ، يتم كتابة الاسم العلمي للإنسان على أنه Homo sapiens Linnaeus 1758. إذا تم نقل النوع ، بعد نشره ، إلى أي جنس آخر أو تم تغيير الاسم العام ، يتم كتابة اسم المؤلف الأول & # 8217s بين قوسين (أقواس).

على سبيل المثال ، يعني Panthera leo (Linnaeus) أن الأنواع leo قد تم تعيينها في الأصل من قبل Linnaeus إلى جنس آخر (Felis).

التسمية الثلاثية:

يتم استخدام نظام التسمية هذا لتسمية الأنواع الفرعية. في التصنيف ، تعتبر الأنواع الفرعية فئة أدنى من الأنواع. اسم الأنواع الفرعية هو أيضًا كلمة لاتينية أو لاتينية ويتبع اسم الأنواع التي تنتمي إليها. على سبيل المثال ، الاسم المحدد لغراب المنزل ، والذي يحدث في جميع أنحاء الهند وباكستان وميانمار وسريلانكا هو Corvus splendens.

تختلف الغربان المنزلية في الهند وباكستان وميانمار وسريلانكا مع بعضها البعض في السمات المورفولوجية الدقيقة ، وبالتالي يتم فصلها كنوع فرعي متميز. تم تسمية غراب المنزل الهندي والباكستاني بالاسم الفرعي Corvus Splendens Splendens ، وغراب منزل Myanmarian ، و Corvus splendens insolens ، وغراب المنزل السريلانكي ، Corvus Splendens protegatus.

وبالتالي ، فإن الاسم العلمي الكامل للسلالات الفرعية هو اسم ثلاثي يتكون من ثلاثة أسماء: أسماء الجنس والأنواع والأنواع نفسها.

قواعد التسمية:

في عام 1898 ، نظم المؤتمر الدولي لعلم الحيوان لجنة دولية حول مصطلحات علم الحيوان لصياغة مجموعة من القواعد التي ستكون ملزمة لجميع المنشورات التصنيفية. الهدف من الكود الدولي للتسمية هو تحقيق الاستقرار في تسمية التصنيف ، وتجنب استخدام الأسماء التي قد تسبب الخطأ أو الغموض أو الالتباس.

عادة ما يتم توحيد وتشريع ممارسات التسميات الطبيعية في المؤتمرات الدولية للنباتات والحيوانات. يتم ذلك من أجل ترتيب تسميات الماضي وتقديم مبادئ توجيهية لتسميات المستقبل.

فيما يلي بعض القواعد والتوصيات الشائعة التي يمكن اعتبارها أساسيات مدونة التسمية:

1. نظام التسمية المعتمد هو نظام ذو الحدين للإشارة إلى الاسم المحدد وثلاثية الحدود للاسم الفرعي المحدد.

2. اسم الجنس هو كلمة واحدة في المفرد الاسمي ويجب أن يبدأ بحرف كبير. قد يكون اسم النوع كلمة مفردة أو مركبة ويجب أن يبدأ بحرف صغير.

3. يجب أن يتبع اسم المؤلف ، الذي ينشر الاسم أولاً عند وصفه ، اسم النوع ونادرًا ما يُختصر ويُطبع بالحروف الرومانية.

4. يجب أن تكون الأسماء العلمية للحيوانات والنباتات مختلفة.

5. يجب أن تكون الأسماء في شكل لاتيني أو لاتيني وعادة ما تكون مطبوعة بخط مائل.

6. داخل مملكة الحيوان والنبات ، لا يمكن أن يحمل جنسان نفس الاسم ، وداخل الجنس ، لا يمكن أن يحمل نوعان نفس الاسم.

7. الاسم العام أو المحدد الذي تم نشره لأول مرة هو الاسم الوحيد المعترف به. جميع الأسماء المكررة مترادفات.

8. عندما لا يكون اسم الجنس هو الاسم الذي وضع المؤلف الأصلي نوعًا تحته ، أو إذا تم تغيير الاسم العام ، يتم كتابة اسم المؤلف الأصلي & # 8217s بين قوسين.

9. يتبع تكوين أسماء العائلة والعائلة الفرعية قواعد مختلفة في رموز علم الحيوان والنبات.

10. يجب أن يحتفظ الاسم بالتهجئة الأصلية ، وقد يتم تصحيح الأخطاء الواضحة والخطأ المطبعي في حذف علامات التشكيل.

11. قد يعتمد الاسم على أي جزء من حيوان أو نبات ، أو على أي مرحلة من تاريخ حياة الكائن الحي.

التوصيات:

لعمل أسماء جديدة ، يتم اتباع الاقتراحات التالية:

1. يجب أن يكون الاسم باللاتينية أو يمكن تحويله بسهولة إلى صيغة لاتينية.

2. يجب ألا يقل الاسم عن ثلاثة أحرف وأكثر من اثني عشر حرفًا.

3. يجب أن يكون الاسم سهل اللفظ.

4. يفضل أن يصف الاسم المعطى بعض خصائص الكائن الحي.

5. يجب ألا يكون الاسم مشتقًا من لغتين.

6. يجب ألا يكون الاسم تافهًا.

الإلمام بالتصنيفات:

وفقا لداروين (1850) ، & # 8220 تم العثور على جميع الكائنات العضوية لتشبه بعضها البعض بدرجة تنازلية ، بحيث يمكن تصنيفها في مجموعات تحت المجموعات & # 8221. يمكن تقسيم جميع المجموعات الرئيسية من الحيوانات بشكل فردي إلى مجموعات فرعية أصغر وأصغر.

داخل الفقاريات يمكننا التمييز بين المجموعات الفرعية مثل الطيور والثدييات داخل الثدييات والحيوانات آكلة اللحوم والقوارض داخل الحيوانات آكلة اللحوم ، وتلك التي تشبه الكلاب ، وتلك التي تشبه القطط وما إلى ذلك. إذا أراد المرء إنشاء تصنيف لهذه الأنواع ، فإن هذا التصنيف ليس تعسفيًا.

مهمة التصنيف إذن هي ترسيم هذه المجموعات وترتيبها في تسلسل منظم ، أي التسلسل الهرمي.

التسلسل الهرمي المنهجي:

نظرًا لأن عدد الأنواع الحيوانية والنباتية كبير جدًا ، فلا يمكن معرفتها بشكل فردي بأسمائها أو الإشارة إليها في الأدبيات. استلزم ذلك ترتيبهم في فئات وأصناف من درجات مختلفة. ثم يتم ترتيب هذه الفئات والأصناف بترتيب تصاعدي بحيث تشتمل الفئة الأعلى على فئة أو أكثر من الفئات الأدنى ، بينما تشتمل الأصناف الأعلى على تصنيف واحد أو أكثر.

كان لينيوس أول عالم تصنيف يؤسس تسلسلاً هرميًا محددًا للفئات التصنيفية المعترف بها داخل مملكة الحيوان. هذه هي الفئات والترتيب والجنس والأنواع والأصناف. الأصناف ، التي استخدمها Linnaeus كفئة اختيارية لأنواع مختلفة من المتغيرات غير المحددة ، تم التخلص منها في النهاية أو استبدالها بالأنواع.

كانت هذه الفئات القليلة كافية للتعامل مع عدد قليل من الحيوانات والنباتات المعروفة في ذلك الوقت.

ومع ذلك ، مع زيادة عدد الأنواع المعروفة ومعها معرفتنا بدرجات العلاقة بين هذه الأنواع ، نشأت الحاجة إلى إشارة أكثر دقة للوضع التصنيفي للأنواع وإدراج أنواع إضافية فيما بينها.

يتم تشكيل معظمها من خلال دمج أسماء الفئات الأصلية مع البادئات super أو sub. وهكذا ، هناك رتبة عليا ، وعائلات عليا ، وعائلات فرعية ، وما إلى ذلك. ربما يكون اسم الفئة الجديد الأكثر استخدامًا هو مصطلح قبيلة لفئة بين الجنس والعائلة.

استخدم علماء الحفريات الفقارية أيضًا في الروتين مجموعة الفئة بين الترتيب والفئة. استخدم بعض المؤلفين مصطلحات للتقسيمات الفرعية الإضافية ، مثل cladus و legio و section. استخدم البعض طبقة تحتية تحت الطبقة الفرعية وترتيب الأشعة تحت الرتبة.

الفئات المقبولة بشكل عام هي كما يلي:

يشار إلى النهايات الموحدة لأسماء القبائل والعائلات الفرعية والعائلات والعائلات الفائقة المشار إليها بين قوسين. غالبًا ما تم الهجوم على التسلسل الهرمي المنهجي أو التسلسل الهرمي ليني كما هو معروف بشكل عام ، مع حاجته إلى الترتيب التعسفي باعتباره نظام تصنيف غير علمي.

تم اقتراح طرق بديلة ، مثل المخطط العددي ، ولكنها لم تجد استحسانًا بين خبراء التصنيف ، وذلك أساسًا لسببين التاليين:

(ط) يتطلب تعيين قيم عددية محددة للأنواع معرفة أكبر بكثير بعلاقات الأصناف مما يمكن استنتاجه من الأدلة المتاحة.

(2) من شأن تخصيص مثل هذه القيم تجميد النظام في عائلة مما يحول دون أي تحسين إضافي.

إن ذاتية التسلسل الهرمي ليني هي التي تمنحها المرونة التي يتطلبها عدم اكتمال معرفتنا بالعلاقات. يسمح باقتراح نماذج بديلة للعلاقات ويمنح مؤلفين مختلفين فرصة لاختبار أي توازن معين بين التقسيم والتجميع يسمح بعرض أكبر قدر من المعلومات.

مثل أي نظرية علمية أخرى ستكون مؤقتة إلى الأبد.

التصنيف والفئة:

الأصناف هي مجموعات من الحيوانات بشكل عام مجموعات من الأنواع. إن كلمات الحشرات والأسماك والطيور والثدييات في الحيوانات الطحالب والفطريات والسراخس والطحالب والأعشاب وما إلى ذلك ، في النباتات هي مجموعات الكائنات الحية. هذه هي الأشياء الملموسة للتصنيف. أي مجموعة من هؤلاء السكان تسمى التصنيف.

ولكن في الاستخدام العادي ، يتم التعامل فقط مع الفئات الأساسية (جنس ، عائلة ، ترتيب ، فئة ، حق ، مملكة) على أنها مجموعات. يتم التعامل مع الأصناف الفائقة على جميع المستويات كمجموعات من الأصناف الأساسية (فئة فائقة كمجموعة من الفئات) والأصناف الفرعية على جميع المستويات كتقسيم فرعي للتصنيف الأساسي (ترتيب فرعي كقسم من الترتيب).

بحسب سيمبسون & # 8220A الصنف هو مجموعة من الكائنات الحية الحقيقية المعترف بها كوحدة رسمية على أي مستوى من التصنيف الهرمي. & # 8221

وبحسب ماير ، & # 8220A التصنيف هو مجموعة تصنيفية من أي رتبة مميزة بما يكفي لتكون جديرة بالتخصيص لفئة محددة. & # 8221

مجموعة الحيوانات من الأصناف. يتم وضع كل تصنيف في مستوى ما في التسلسل الهرمي. تعيّن الفئة الرتبة أو المستوى في التصنيف الهرمي. إنها فئة ، كل أعضائها هم جميع الأصناف المعينة رتبة معينة. يمكن أن تكون الفئة أعلى أو أقل من فئة أخرى ، لذلك قد نتحدث عن فئة أعلى.

الفئات لها أسماء ، ولكن هذه مصطلحات وليست أسماء في التسميات البيولوجية. هم مملكة ، حق ، طبقة ، وما إلى ذلك. من الخطأ القول & # 8220 هذا الحيوان ينتمي إلى فئة Mammalia & # 8221، Mammalia هو اسم تصنيف وليس فئة.

التصنيف جالشركات:

صنف:

الأنواع هي أهم فئة في التسلسل الهرمي التصنيفي. إنها الوحدة الأساسية في التصنيف وأيضًا في التطور. لطالما كان تعريفه أحد المشاكل الرئيسية للتصنيف. تتم مناقشة العديد من التعاريف والجوانب حول تعريف الأنواع.

وفقًا لـ Blackweldler ، يمكن تعريف الأنواع على النحو التالي:

(ط) إحدى المجموعات ، المجموعة الموضوعة في فئة تسمى مستوى الأنواع (مجموعة الأنواع).

(2) الفئة أو المستوى الذي توضع فيه مجموعات الأنواع (مستوى الأنواع).

يتم إعطاء تعريفين رئيسيين للأنواع.

تُعرَّف الأنواع البيولوجية عادةً على أنها مجموعات من التجمعات الطبيعية الفعلية أو التي يحتمل تزاوجها ، والتي يتم عزلها تكاثريًا عن مجموعات أخرى من هذا القبيل. هذا يعطي مجموعات نظرية نادرا ما يمكن تمييزها في الممارسة.

أشار سيمبسون إلى أن جميع تعريفات الأنواع الحيوانية تعطينا أنواعًا بيولوجية. لذلك ، فهو يفضل اسم الأنواع الجينية لهذا ويستشهد أيضًا بالأنواع الحيوية. (تجدر الإشارة إلى أن السكان لا يتزاوجون ، فقط الحيوانات والنباتات الفردية تتزاوج).

الأنواع الجينية هي مجموعات من مجموعات التهجين المعزولة تكاثريًا عن بعضها البعض. وبالتالي ، فهي نفس الأنواع البيولوجية. على سبيل المثال ، في الإنسان العاقل هو نوع من الإنسان.

جنس:

التصنيف الموجود في فئة الجنس هو الأجناس. هذه مجموعات من الأنواع جمعها علماء التصنيف كما يتضح من حقيقة أن الاسم العام هو جزء من كل اسم لكل نوع من الأنواع المدرجة.

الجنس متورط من تسمية النوع الأول الذي يشكل الجزء الأول من اسمه. مرة أخرى ، من الممكن أن نقول أن الجنس هو أي مجموعة من الأنواع المدرجة تحت اسم عام واحد من قبل أي عالم تصنيف. هذا أمر ذاتي تمامًا ، لكنه تقريبًا التعريف العملي الذي هو أساس معظم الأعمال التصنيفية.

لا يمكن وصف الجنس بشكل صحيح على أنه المستوى الأعلى التالي فوق الأنواع ، لأنه شائع ويمكن دائمًا ذلك. استخدام الجينات الفرعية بين الجنس والأنواع ، وكذلك لاستخدام الأقسام أو الفئات غير الرسمية الأخرى.

تعريف عملي لحالات الجنس ، & # 8220A الجنس هو فئة تصنيفية تحتوي على نوع واحد أو مجموعة أحادية اللون من الأنواع ، والتي يتم فصلها عن الأصناف الأخرى من نفس المرتبة (أجناس أخرى) بفجوة محددة. & # 8221 يشمل جنس Felis القط الذهبي (Felis temincki) وقط الصيد (Felis viverrina) والقط الفهد (Felis bengalensis).

أسرة:

هذه فئة تصنيفية تحتوي على واحد أو أكثر من الأجناس ذات الصلة والتي يتم فصلها عن العائلات الأخرى ذات الصلة باختلافات مهمة ومميزة. فصيلة السنيريات وتضم الأسد والنمر والنمر وجميع أنواع القطط التي تنتمي إلى أجناس مختلفة. هذه الفصيلة منفصلة بشكل واضح عن عائلة الكلبيات التي تضم الكلاب والثعالب.

ترتيب:

الترتيب هو الفئة الأساسية لما يسمى بمجموعة الطلبات التي تشمل أيضًا الطلبات الفائقة ، والأوامر الفرعية ، والأوامر الفرعية ، والأصناف في أي مستويات أخرى محرفة بين الأسرة الفائقة والطبقة تحت. في العديد من الشعب ، تعتبر الأوامر مجموعات معروفة جيدًا ، ولكن في بعض الشعب تكون أقل شهرة من الفئات ، في حين أن الفصول لها تماثل واضح إلى حد ما في جميع أنحاء مملكة الحيوان.

ترتيب الفقاريات ، على سبيل المثال ، نادرًا ما يمكن مقارنته بالعائلات في الحشرات وتختلف المستويات في المجموعات الأخرى. على سبيل المثال ، يشتمل ترتيب Carnivora على عائلات Felidae و Canidae.

فصل:

الفصل هو الفئة الأساسية لما يُطلق عليه مجموعة الفصل والتي تضمنت أيضًا الفصول الفائقة والفئات الفرعية ، بالإضافة إلى أي فئة أخرى تم دمجها بين هذه الفئات. في مملكة الحيوان ككل ، تعد الفئات بلا شك أشهر الأصناف المعروفة ، حتى أن الشعب تخضع لمزيد من الاختلافات في الرأي.

الفئة هي عمومًا تقسيم فرعي لشعبة. على سبيل المثال ، يشتمل ترتيب Carnivora على الأسد ، والقط ، وما إلى ذلك ، في فئة Mammalia.

حق اللجوء:

التصنيف المصنف في فئة اللجوء هو الشعب ، التقسيمات الفرعية للمملكة. قد يتم تجميعها في سوبر phyla أو تقسيمها إلى subphyla. تضم شعبة بوريفيرا ثلاث فئات مثل Calcarea و Hexactinellida و Demospongia.

مملكة:

هذه هي أعلى فئة تصنيفية. يتم تضمين جميع الحيوانات في المملكة الحيوانية وجميع النباتات المدرجة في المملكة النباتية.

الأنواع كفئة:

أهمية مصطلح الأنواع في جميع مجالات البيولوجيا هائلة لدرجة أنه يستحق اهتمامًا خاصًا. لقد تم بالفعل ذكر أن الكائنات الفردية التي لها العديد من السمات المشتركة وقادرة على التكاثر فيما بينها فقط يشملها مصطلح الأنواع.

لا يقتصر تعريف الأنواع على علماء التصنيف فقط. في الوقت الحاضر ، تنظر مجالات علم الأحياء الأخرى أيضًا إلى الأنواع إلى حد كبير. كما قام علماء الخلايا وعلماء الوراثة وعلماء البيئة وعلماء الكيمياء الحيوية وغيرهم بتحديد الأنواع.

التعريفات التي قدمها مختلف العمال هي كما يلي:

الأنواع التي تعيش في مناطق جغرافية مختلفة.

عادة ما تحتل الأنواع نفس المناطق الجغرافية.

& # 8220 هذه هي تلك التي أنشأها التشابه الصرفي بغض النظر عن الاعتبارات الأخرى & # 8221 (سيمبسون).

الأنواع الحيوية والأنواع الجينية:

مجموعة من العشائر المتكاثرة المعزولة تكاثريًا عن مجموعة أخرى مماثلة.

إنه مصطلح ينطبق على أزواج أو مجموعات من الأنواع المتشابهة جدًا والمترابطة بشكل وثيق. عند تطبيقه على الأنواع ذات الصلة الوثيقة (بالمعنى التطوري) ، يشير هذا التعبير إلى الأنواع الافتراضية ، ولا يمكن التعامل معها في التصنيف ولكن يمكن أن تكون مفيدة في التخمينات حول التطور.

نوع تم تقديم اسم محدد له بموجب القواعد الدولية للتسمية.

هذه هي السلالات (المتواليات المتحدرة من الأسلاف) التي تتطور بشكل منفصل عن بعضها البعض مع أدوارها وميولها التطورية الوحدوية.

الأنواع متعددة الأنواع هي تلك التي تتكون من نوعين فرعيين أو أكثر.

تتكون الأنواع أحادية النمط من نوع فرعي واحد.

التصنيف التفصيلي للحيوانات:

تم تصنيف الحيوانات بطرق مختلفة من قبل مؤلفين مختلفين. التصنيف التالي يعتمد على التصنيف الذي اقترحه Meglitsch، P.A. (1972). في هذا التصنيف ، تم أخذ مجموعات أكبر فقط في الاعتبار.

ملكom الحيوان:

هذه هي أكبر مجموعة تصنيف للحيوانات. يشمل جميع الحيوانات (الحيوانات) في العالم.

وهي مقسمة إلى مجالين فرعيين:

Subkingdom A. البروتوزوا:

حوالي 50000 نوع. الحيوانات المجهرية اللاخلوية. انفرادي أو استعماري. عضيات الخلية المتخصصة. منفردة إلى نوى عديدة. التغذية Holozoic ، Holophytic أو saprozoic أو الطفيلية. المياه العذبة أو البحرية أو الأرضية الرطبة.

البروتوزوا (الحيوانات الأولى). شخصيات مثل تلك الخاصة بالمملكة الفرعية.

Subkingdom B. ميتازوا:

الحيوانات متعددة الخلايا. يتكون الجسم من العديد من الخلايا ، عادة ما تكون مرتبة في طبقات أو أنسجة.

وهي مقسمة إلى ثلاثة فروع:

Mesozoa ، Parazoa ، Eumetazoa.

الفرع الأول الميزوزوا:

الحيوانات الخلوية التي لها بنية مجسمة ، تتكون من طبقة سطحية من الخلايا الجسدية والخلايا التناسلية الداخلية.

الميزوزوا (الحيوانات الوسطى). حوالي 50 نوعًا ، تشبه الدودة ، صغيرة. التماثل الثنائي. طبقة خارجية من الخلايا الهضمية الهدبية تحيط بخلايا تناسلية واحدة أو عدة خلايا.طفيلي في رأسيات الأرجل واللافقاريات الأخرى.

الفرع الثاني. بارازوا:

حيوانات من الدرجة الخلوية للتنظيم مع تكوين الأنسجة الأولي. الخلايا الداخلية من عدة أنواع مختلفة. لا يوجد فم أو جهاز هضمي ولا توجد أجهزة عضوية. الجسم مسامي مع واحد إلى العديد من التجاويف الداخلية المبطنة بالخلايا المنتفخة. لاطئ ، بحري ، قليل من المياه العذبة. انفرادي أو استعماري.

Porifera (المسام): حوالي 5000 نوع. شخصيات مثل تلك الخاصة بالفرع.

Scypha أو Sycon ، Euplectella ، Hyalonema ، Euspongia ، إلخ.

الفرع الثالث. يوميتازوا:

حيوانات من الأنسجة أو نظام العضو بدرجة التنظيم مع الفم والجهاز الهضمي (إلا عندما تضيع بسبب التنكس الطفيلي). الخلايا الداخلية من عدة أنواع. الجسم ليس مساميًا ولا يحتوي على تجاويف مبطنة بالخلايا المنتفخة.

الأنواع التمثيلية من اللافقاريات فيللا.

الصف الأول:

Eumetazoa مع تناظر شعاعي أولي. الأنسجة موجودة وأنظمة الأعضاء هي أولية. الأديم المتوسط ​​، الذي يُشتق عادةً من الأديم الظاهر ، موجود كأنسجة أولية ، بدون درجة عالية من التخصص الخلوي. مساحة الجسم الوحيدة هي التجويف الهضمي ، الذي له فم ولكن بدون فتحة الشرج.

شعبة 4. القراصات (Coelenterata):

حوالي 10000 نوع. تناظر شعاعي أو ثنائي نصف قطري أو راديو ثنائي. الفم محاط بمخالب تحمل الأكياس الخيطية. لا توجد صفوف من الصفائح المهدبة. تجويف الجسم مثل coelenteron. السباحة غير المستقرة أو الحرة. انفرادي أو استعماري. مياه بحرية أو مياه عذبة.

هيدرا ، أوبيليا ، أوريليا ، ميتريديوم ، كورالز ، إلخ.

شعبة 5. Ctenophora (حاملي المشط أو الهلام المشط):

حوالي 90 نوعا. التماثل ثنائي الشعاع. اللوامس عند وجودها لا تطوق الفم. لا تكيسات خيطية. ثمانية صفوف شعاعية من ألواح السباحة المهدبة. السباحة الحرة والبحرية.

بلوروبراشيا ، كويلوبلانا ، ستينوبلانا ، إلخ.

الصف الثاني. بيلاتيريا:

Eumetazoa مع التناظر الثنائي ، أو تلك التي لديها تناظر ثنائي جنيني تم تعديلها لاحقًا إلى تناظر شعاعي. درجة تنظيم الجهاز العضوي. في الغالب مع أديم متوسط ​​متطور من أصل باطن. في الغالب مع مسافات الجسم غير التجويف الهضمي. الفم والشرج موجودان بشكل عام.

ينقسم Bilateria إلى قسمين:

البروتستوميا و Deuterostomia.

قسم أ. Protostomia:

ثنائيات البطن التي ينشأ فيها الفم من ثقب المتفجرات أو من الهامش الأمامي للثقب المتفجر.

تنقسم البروتستوميا إلى ثلاثة أقسام فرعية:

Acoelomata و Pseudocoelomata و Coelomata.

التقسيم 1. أكويلوماتا:

لا يوجد تجويف أو تجويف في الجسم. تمتلئ المساحة بين جدار الجسم والجهاز الهضمي باللحمة المتوسطة. نظام إفراز البروتنفريدا مع لمبات اللهب.

Superphylum Acoelomata:

بيلاتيريا بدون جوف. مع اللحمة المتوسطة بين جدار الجسم والجهاز الهضمي. نظام إفراز البروتونفيريديا مع لمبات اللهب. الجسم غير مجزأ أو يتكون من ستروبيلا ، مع الجزء الأصغر نحو الرأس.

شعبة 6. Platyhelminthes (الديدان المفلطحة):

حوالي 12700 نوع. تسطيح ظهر الجسم البطني. فتحة الشرج والدورة الدموية غائبة. العيش الحر أو الطفيلي. أرضية أو مياه عذبة أو بحرية.

Planaria ، Fasciola ، Taenia ، إلخ.

شعبة 7. Nemertinea أو Rhynchocoela- (الديدان الشريطية):

حوالي 750 نوعا. الجسم نحيل ، ناعم ، مرن للغاية ومغطى بالأهداب. لا تجزئة. الفم الأمامي مع خرطوم طويل دائم. الجهاز الهضمي كامل مع فتحة الشرج. نظام الدورة الدموية موجود. عيش حر. معظمها من المياه البحرية والبرية والمياه العذبة.

المخ ، Stichostemma ، إلخ.

التقسيم 2. الزائفة الزائفة:

توجد مساحة بين الجهاز الهضمي وجدار الجسم ولكن هذه المساحة عبارة عن جوف كاذب (بقايا الجوف الأريمي) وليس جوفًا. توجد فتحة الشرج مع البروتونفيريديا أو بدونها ، ومصابيح اللهب موجودة أو غائبة.

شعبة 8. Acanthocephala (الديدان ذات الرأس الشوكي):

حوالي 500 نوع. الديدان الطفيلية الدقيقة. خرطوم بروز (ثابت) مع أشواك مقوسة. لا يوجد جهاز هضمي.

Echinorhynchus ، Gigantorhynchus ، إلخ.

شعبة 9. Entoprocta (حيوانات الطحلب):

حوالي 60 نوعا. أنبوب هضمي على شكل حرف U. الفم والشرج قريبان من بعضهما داخل منطقة محاطة بمخالب مهدبة. لاطئ. معظمها من المياه البحرية وقليل من المياه العذبة. انفرادي أو استعماري.

Pedicellina ، Loxosoma ، Urnatella ، إلخ.

سوبر phylum Aschelminthes:

مجموعة من الحلقات الزائفة. تحتوي جميعها على الفم الأمامي والشرج الخلفي والأنبوب الهضمي المستقيم.

شعبة 10. روتيفيرا (عجلة حيوانية):

حوالي 1500 نوع. مجهري. نهاية أمامية مع هالة مهدبة. البلعوم مع الفكوك الداخلية المعروفة باسم النظام الغذائي البروتوني مع لمبات اللهب الطرفية. معظمها من المياه العذبة ، وبعضها من المياه البحرية.

Brachionus ، Philodina ، Rotatoria ، إلخ.

شعبة 11. Gastrotricha (ديدان المعدة المشعرة):

حوالي 150 نوعا. مجهري. السطح البطني بالارض ومهدب. بشرة ذات أشواك أو ألواح أو قشور وغير مجزأة. أنبوبي البلعوم خالي من التروفي. المياه العذبة والبحرية.

Chaetonotus ، Macrodasys ، إلخ.

شعبة 12. Kinorhyncha (الديدان تتحرك الفك):

حوالي 60 نوعا. صغير. أكثر أو أقل شوكية بدون أهداب سطحية. الجسم غير مجزأ مع الطرف الأمامي من البحرية الانطوائية.

Echinoderes ، Pycnophyses ، إلخ.

شعبة 13. النيماتودا (الديدان المستديرة):

حوالي 10000 نوع. الجسم مستدير ، نحيف ، مغطى بقشرة متصلة ، غالبًا ما تكون مدببة عند الأطراف. أهداب غائبة. تنقسم البشرة إلى أربعة أوتار أو أكثر. فقط العضلات الطولية في جدار الجسم. البلعوم العضلي الطويل ذو التجويف الثلاثي. العيش الحر أو الطفيلي. المياه العذبة أو البحرية أو في التربة.

داء الأسكاريس ، التهاب الرهابي ، إنتروبيوس ، أنسيلوستوما ، ووشيريريا ، إلخ.

شعبة 14. Nematomorpha (ديدان شعر الخيل):

حوالي 230 نوعا. الجسم طويل نحيف ، أسطواني مع أوتار جلدية ظهرية وبطنية. Gonoducts التي تنضم إلى الأمعاء. اليرقات مراحل طفيلية والبالغات تعيش بحرية.

التقسيم 3. Coelomata:

الحيوانات ذات اللولب الحقيقي والأديم الظاهر المتطور جيدًا. أعضاء الإخراج هي البروتونفيريديا مع أو بدون nephrostome. فتحة الشرج موجودة.

Super-phylum Inarticulate:

البروتستومات غير المجزأة.

حوالي 8 أنواع. سطح الجسم مغطى بالأشواك والدرنات. خرطوم الأمامي. تنفصل المسام البولية والتناسلية عن الأنبوب الهضمي في كلا الجنسين. بروتونفيريديا تنتهي في الخلايا اللولبية التي تنضم إلى gonoducts. البحرية.

شعبة 16. Sipunculida (ديدان الفول السوداني):

حوالي 275 نوعا. الجسم مستطيل وأسطواني مع انطوائي أمامي قابل للانكماش. مجسات مجوفة قصيرة حول الفم. لا تجزئة أو مجموعة. فتحة الشرج الظهرية. البحرية.

Sipunculus ، Phascolosoma ، إلخ.

شعبة 17. Mollusca (الحيوانات رخوة الجسم):

حوالي 1 ، 28000 نوع. الجسم رخو مغطى بالغطاء عادة برأس أمامي وعضلات بطنية. عباءة تفرز القشرة. شل أحيانا أثرية وأحيانا في عدة قطع. تخفيض Coelom. البرية والمياه العذبة والبحرية.

Chiton ، Pila (Snail) ، Unto (بلح البحر) ، Sepia ، Loligo (Squid) ، Nautilus ، إلخ.

شعبة 18. Echiurida (ديدان أفعى الذيل):

حوالي 150 نوعا. الجسم أسطواني مع خرطوم مرن على شكل حوض (غير قابل للانكماش). بطني الفم. جذع مع مجموعة. كويلوم فسيحة. البحرية.

Super-phylum Articulata:

حيوانات مجوفة مجزأة. تتميز بتجزئة المراحل الجنينية ، على الرغم من أن البالغ قد يكون قد فقد تنظيمه المعياري بشكل ثانوي.

شعبة 19. Annelida (الديدان الحلقية أو المقسمة):

حوالي 8700 نوع. الجسم ممدود ومقطوع. مساحة Coelom الفسيحة ، وتنقسم عادةً إلى مقصورات metameric. البرية والمياه العذبة والبحرية.

Nereis (Clamworm) ، Pheretima (دودة الأرض) ، Hirudinaria (Leech) ، إلخ.

شعبة 20. التارديغرادا (دببة الماء أو حيوان الدببة) دقيقة:

الجسم أسطواني ومقطع بأربعة أزواج من الأرجل غير المقسمة تنتهي بمخالب. تم استبدال Coelom العابر بـ haemocoel. لا توجد زوائد مرتبطة بالفم.

شعبة 21. Onychophora (حاملي المخالب):

حوالي 73 نوعا. الجسم يشبه دودة الجسم ، ممدود وغير مجزأ. تغطي بشرة رقيقة غير مجزأة الجسم. العديد من أزواج الأرجل القصيرة غير المقسمة. رأس مع ثلاثة أزواج من الزوائد ، اثنان منها مرتبطان بالفم. نظام التنفس الرغامي. رطبة أرضية.

شعبة 22. Pentastomatida (ديدان اللسان):

حوالي 70 نوعا. جسم يشبه الدودة بزوجين من المخالب أو زوائد قصيرة على جانبي الفم. الجهاز التنفسي غائب. طفيلي في الفقاريات.

بورسيفالوس ، سيفالوبينا. إلخ.

شعبة 23. مفصليات الأرجل (الحيوانات ذات القدم المشتركة):

حوالي 9،00،000 نوع. الجسم مجزأ مع أطراف مفصلية تنتهي عادة في المخالب. الهيكل الخارجي الكيتين. تم تقليل Coelom بشكل كبير واستبداله بـ haemocoel. البرية والمياه العذبة والبحرية. أمثلة: الجمبري ، العقارب ، الذباب ، مئويات الأقدام ، إلخ.

الشعبة B. Deuterostomia:

ثنائيات البطن التي لا ينشأ فيها الفم من فتحة الانفجار أو بالقرب من الحافة الأمامية. تنشأ الجوف من القناة الهضمية البدائية.

Super-phylum Tentaculata (Lophophorates):

الحيوانات ذات الحافة الدائرية أو الهلالية أو المزدوجة الملفوفة حلزونيًا والتي تحمل مخالب مهدبة وتعرف باسم lophophore. الفم والشرج قريبان من بعضهما البعض. تشكل الأمعاء حلقة.

حوالي 15 نوعا. الحيوانات التي تشبه الدودة الانفرادية. الجسم محاط بأنبوب كيتيني. نظام الدورة الدموية المغلق. زوج واحد من metanephridia Marine.

شعبة 25. إكتوبروكتا أو بريوزوا (حيوانات الطحلب):

حوالي 4000 نوع. حيوانات لاطئة أو مستعمرة مع lophophore. الجسم محاط بغطاء جيلاتيني أو كيتيني أو كلسي. فتحة الشرج خارج منطقة lophophore. معظمها من المياه البحرية وقليل من المياه العذبة.

شعبة 26. Brachiopoda (قذائف المصباح):

حوالي 260 نوعا. الحيوانات المنفردة مع lophophore. الجسم محاط بقذيفة ذات صدفتين. زوج أو اثنين من metanephridia. البحرية.

Lingula ، Crania ، Hemithyris ، إلخ.

شعبة 27. شوكيات الجلد (الحيوانات ذات البشرة الشوكية):

حوالي 6000 نوع. الحيوانات ذات التناظر الشعاعي الثانوي. نظام الأوعية الدموية موجود. الحركة بالقدم الأنبوبية.

نجم البحر ، نجم هش ، قنافذ البحر ، زنابق البحر ، إلخ.

شعبة 28. Chaetognatha (دودة السهم):

حوالي 50 نوعا. الحيوانات الصغيرة ، النحيلة ، الممدودة ، الشفافة. الجسم مقسم إلى رأس وجذع وذيل. خطافات أو شعيرات بالقرب من الفم ، زعانف مقترنة على الجذع وزعنفة نهائية. أنبوب الجهاز الهضمي كامل. العوالق والبحرية. عيش حر.

شعبة 29. Pogonophora (ديدان اللحية):

حوالي 43 نوعا. الجسم ممدود في أنبوب كيتيني. نهاية أمامية مع واحد إلى العديد من مخالب. الهيكل الداخلي والشقوق الخيشومية والأنبوب الهضمي غائبان. المياه العميقة والبحرية.

Siboglinum ، Polybrachia ، Spirobrachia ، إلخ.

شعبة 30. Hemichordata (ديدان الجوزة):

حوالي 80 نوعا. الحيوانات ثنائية بشكل دائم مع شقوق الخياشيم. فقراء الهيكل الداخلي. الجنين يفتقر إلى الحبل الظهري النموذجي. البحرية.

Balanoglossus (دودة البلوط) ، رأسي ، إلخ.

حوالي 45000 نوع. الحيوانات ثنائية بشكل دائم. الحبل العصبي الأنبوبي الظهري ، الحبل الظهري والشقوق الخيشومية الحلقية المزدوجة موجودة في مرحلة ما من تاريخ الحياة. الأرض والمياه العذبة والبحرية.

Ascidians ، Amphioxus ، الأسماك ، الضفادع والضفادع ، السحالي والثعابين ، الطيور والثدييات ، إلخ.


5.5.2 ضع قائمة بسبعة مستويات في التسلسل الهرمي للأصناف - مملكة ، شعبة ، فئة ، رتبة ، عائلة ، جنس وأنواع - باستخدام مثال من مملكتين مختلفتين لكل مستوى.

الكنغر الأحمر :
مملكة: الحيوان
حق اللجوء: الحبليات
فصل: Mammalia
ترتيب: ثنائي الأسنان
أسرة: Macropodidae
جنس: ماكروبوس
صنف: م. روفوس

شجرة البلوط الأبيض :
مملكة: النبات
حق اللجوء: Magnoliophyta
فصل: Magnoliopsida
ترتيب: فاجاليس
أسرة: فاجاسيا
جنس: Quercus
صنف: ألبا


1610 بالمعنى المحدد بالمعنى 1

اقترضت من اللاتينية Nōmenclātūra & اقتباس الأسماء للأشياء ، & الاقتباس من لا رجال & quotname & quot + كالاتوس النعت الماضي كالار & quotto يعلن ، يعلن & quot + -ūra - نعم - المزيد في إدخال الاسم 1 ، إدخال منخفض 3

ملاحظة: تم تشكيل الكلمة اللاتينية بعد في وقت سابق Nōmenclātor & quotslave مكلف بإخبار سيده بأسماء العملاء والآخرين الذين تمت مواجهتهم علنًا & quot— انظر التسمية.


محتويات

أ نظام شعرية هي فئة من المشابك مع نفس مجموعة مجموعات النقاط الشبكية ، وهي مجموعات فرعية من فئات البلورات الحسابية. تم تجميع 14 مشابك Bravais في سبعة أنظمة شعرية: ثلاثي الميل ، أحادي الميل ، معيني ، رباعي الزوايا ، معيني السطوح ، سداسي ، ومكعب.

في نظام الكريستال، يتم تعيين مجموعة من مجموعات النقاط ومجموعات الفضاء المقابلة لها لنظام شبكي. من بين مجموعات 32 نقطة الموجودة في ثلاثة أبعاد ، يتم تخصيص معظمها لنظام شبكي واحد فقط ، وفي هذه الحالة يكون لكل من النظامين البلوري والشبكي نفس الاسم. ومع ذلك ، يتم تخصيص مجموعات من خمس نقاط لنظامين شبكيين ، معيني السطوح وسداسي ، لأن كلاهما يظهر تناظرًا دورانيًا ثلاثي الأبعاد. يتم تعيين مجموعات النقاط هذه للنظام البلوري ثلاثي الزوايا. في المجموع ، هناك سبعة أنظمة بلورية: ثلاثي الميل ، أحادي الميل ، معيني ، رباعي الزوايا ، ثلاثي الزوايا ، سداسي ، ومكعب.

أ عائلة الكريستال يتم تحديده بواسطة المشابك ومجموعات النقاط. يتم تشكيله من خلال الجمع بين الأنظمة البلورية التي تحتوي على مجموعات فضائية مخصصة لنظام شبكي مشترك. في ثلاثة أبعاد ، تكون العائلات والأنظمة البلورية متطابقة ، باستثناء الأنظمة البلورية السداسية والمثلثية ، والتي يتم دمجها في عائلة بلورية واحدة سداسية. في المجموع ، هناك ست عائلات بلورية: ثلاثية الميل ، وحيدة الميل ، وتقويم العظام ، ورباعي الزوايا ، وسداسية ، ومكعبة.

المساحات ذات الأبعاد الأقل من ثلاثة أبعاد لها نفس عدد الأنظمة البلورية ، والعائلات البلورية ، والأنظمة الشبكية. في الفضاء أحادي البعد ، يوجد نظام بلوري واحد. في الفضاء ثنائي الأبعاد ، توجد أربعة أنظمة بلورية: مائلة ، مستطيلة ، مربعة ، سداسية.

العلاقة بين العائلات البلورية ثلاثية الأبعاد والأنظمة البلورية والأنظمة الشبكية موضحة في الجدول التالي:

عائلة الكريستال نظام بلوري التناظرات المطلوبة لمجموعة النقاط مجموعات النقاط مجموعات الفضاء المشابك Bravais نظام شعرية
ثلاثي الميل ثلاثي الميل لا أحد 2 2 1 ثلاثي الميل
أحادي الميل أحادي الميل 1 محور دوران مزدوج أو مستوى مرآة واحد 3 13 2 أحادي الميل
تقويم العظام تقويم العظام 3 محاور دوران مزدوجة أو محور دوران مزدوج و 2 مستويات مرآة 3 59 4 تقويم العظام
رباعي الزوايا رباعي الزوايا 1 محور دوران رباعي 7 68 2 رباعي الزوايا
سداسي الشكل ثلاثي الزوايا 1 محور دوران ثلاثي 5 7 1 معين السطوح
18 1 سداسي الشكل
سداسي الشكل 1 محور دوران سداسي 7 27
مكعب مكعب 4 محاور دوران ثلاثية 5 36 3 مكعب
6 7 المجموع 32 230 14 7
ملاحظة: لا يوجد نظام شعرية ثلاثي الزوايا. لتجنب الخلط بين المصطلحات ، لم يتم استخدام المصطلح "شعرية مثلثية".

تتكون الأنظمة البلورية السبعة من 32 فئة بلورية (تقابل 32 مجموعة نقاط بلورية) كما هو موضح في الجدول التالي أدناه:

عائلة الكريستال نظام بلوري مجموعة النقاط / فئة الكريستال Schönflies هيرمان موجان أوربيفولد كوكستر تناظر النقطة ترتيب مجموعة مجردة
ثلاثي الميل دواسة ج1 1 11 [ ] + قطبي متماثل الشكل 1 تافهة Z 1 _<1>>
بيناكويد جأنا2) 1 1x [2,1 + ] تناظر مركزي 2 دوري Z 2 _<2>>
أحادي الوتدي ج2 2 22 [2,2] + قطبي متماثل الشكل 2 دوري Z 2 _<2>>
محلي جس1 ساعة) م *11 [ ] قطبي 2 دوري Z 2 _<2>>
منشوري ج2 ح 2 / م 2* [2,2 + ] تناظر مركزي 4 كلاين أربعة V = Z 2 × Z 2 = mathbb _ <2> مرات mathbb _<2>>
تقويم العظام المعينية د2 (الخامس) 222 222 [2,2] + متماثل 4 كلاين أربعة V = Z 2 × Z 2 = mathbb _ <2> مرات mathbb _<2>>
معيني-هرمي ج2 فولت مم 2 *22 [2] قطبي 4 كلاين أربعة V = Z 2 × Z 2 = mathbb _ <2> مرات mathbb _<2>>
معيني ثنائي الهرمي د2 ح (الخامسح) ممم *222 [2,2] تناظر مركزي 8 V × Z 2 مرات mathbb _<2>>
رباعي الزوايا رباعي الزوايا الهرم ج4 4 44 [4] + قطبي متماثل الشكل 4 دوري Z 4 _<4>>
رباعي الزعنفة س4 4 2x [2 + ,2] غير متماثل 4 دوري Z 4 _<4>>
رباعي الزوايا ثنائي الهرمي ج4 ح 4 / م 4* [2,4 + ] تناظر مركزي 8 ض 4 × Z 2 _ <4> مرات mathbb _<2>>
رباعي الزوايا شبه منحرف د4 422 422 [2,4] + متماثل 8 ثنائي السطح D 8 = Z 4 ⋊ Z 2 _ <8> = mathbb _ <4> r مرات mathbb _<2>>
ثنائي الزوايا الهرمي ج4 فولت 4 مم *44 [4] قطبي 8 ثنائي السطح D 8 = Z 4 ⋊ Z 2 _ <8> = mathbb _ <4> r مرات mathbb _<2>>
رباعي الزوايا سكالينوهيدرال د2 د (الخامسد) 4 2 م أو 4 م 2 2*2 [2 + ,4] غير متماثل 8 ثنائي السطح D 8 = Z 4 ⋊ Z 2 _ <8> = mathbb _ <4> r مرات mathbb _<2>>
ثنائي الزوايا - ثنائي الهرمي د4 ح 4 / مم *422 [2,4] تناظر مركزي 16 د 8 × ض 2 _ <8> مرات mathbb _<2>>
سداسي الشكل ثلاثي الزوايا هرم ثلاثي ج3 3 33 [3] + قطبي متماثل الشكل 3 دوري Z 3 _<3>>
شكل معين ج3 ط6) 3 3x [2 + ,3 + ] تناظر مركزي 6 دوري Z 6 = Z 3 × Z 2 _ <6> = mathbb _ <3> مرات mathbb _<2>>
ثلاثي الزوايا شبه منحرف د3 32 أو 321 أو 312 322 [3,2] + متماثل 6 ثنائي السطح D 6 = Z 3 ⋊ Z 2 _ <6> = mathbb _ <3> r مرات mathbb _<2>>
ثنائي النتوء الهرمي ج3 فولت 3 م أو 3 م 1 أو 31 م *33 [3] قطبي 6 ثنائي السطح D 6 = Z 3 ⋊ Z 2 _ <6> = mathbb _ <3> r مرات mathbb _<2>>
ديتريجونال-سكالينوهيدرال دثلاثي الأبعاد 3 م أو 3 م 1 أو 3 م 1 2*3 [2 + ,6] تناظر مركزي 12 ثنائي السطح D 12 = Z 6 ⋊ Z 2 _ <12> = mathbb _ <6> r مرات mathbb _<2>>
سداسي الشكل سداسية هرمية ج6 6 66 [6] + قطبي متماثل الشكل 6 دوري Z 6 = Z 3 × Z 2 _ <6> = mathbb _ <3> مرات mathbb _<2>>
ثلاثي الزوايا ثنائي الهرمي ج3 ح 6 3* [2,3 + ] غير متماثل 6 دوري Z 6 = Z 3 × Z 2 _ <6> = mathbb _ <3> مرات mathbb _<2>>
سداسية - ثنائي الهرمي ج6 ح 6 / م 6* [2,6 + ] تناظر مركزي 12 ض 6 × Z 2 _ <6> مرات mathbb _<2>>
سداسية الشكل شبه منحرف د6 622 622 [2,6] + متماثل 12 ثنائي السطح D 12 = Z 6 ⋊ Z 2 _ <12> = mathbb _ <6> r مرات mathbb _<2>>
هرمي سداسي ج6 فولت 6 مم *66 [6] قطبي 12 ثنائي السطح D 12 = Z 6 ⋊ Z 2 _ <12> = mathbb _ <6> r مرات mathbb _<2>>
ثنائي التثليج ثنائي الهرمي د3 ح 6 م 2 أو 6 2 م *322 [2,3] غير متماثل 12 ثنائي السطح D 12 = Z 6 ⋊ Z 2 _ <12> = mathbb _ <6> r مرات mathbb _<2>>
ثنائي سداسي - ثنائي الهرمي د6 ح 6 / مم *622 [2,6] تناظر مركزي 24 د 12 × Z 2 _ <12> مرات mathbb _<2>>
مكعب رباعي تي 23 332 [3,3] + متماثل 12 بالتناوب A 4 >
ثنائي الصيغة تيح م 3 3*2 [3 + ,4] تناظر مركزي 24 أ 4 × Z 2 times mathbb _<2>>
الغدة الدرقية ا 432 432 [4,3] + متماثل 24 متماثل S 4 _<4>>
سداسي السطوح تيد 4 م *332 [3,3] غير متماثل 24 متماثل S 4 _<4>>
سداسي الاوكتاهدرا اح م 3 م *432 [4,3] تناظر مركزي 48 S 4 × Z 2 _ <4> مرات mathbb _<2>>

يمكن وصف التناظر النقطي للهيكل على النحو التالي.ضع في اعتبارك النقاط التي يتكون منها الهيكل ، وعكسها جميعًا من خلال نقطة واحدة ، بحيث (x,ذ,ض) يصبح (-x,−ذ,−ض). هذا هو "الهيكل المقلوب". إذا كان الهيكل الأصلي والهيكل المقلوب متطابقين ، فإن الهيكل يكون تناظر مركزي. وإلا فهو كذلك غير متماثل. ومع ذلك ، حتى في حالة عدم التناسق المركزي ، يمكن في بعض الحالات تدوير البنية المقلوبة لتتماشى مع الهيكل الأصلي. هذا غير متماثل مركزي اكيرال بنية. إذا كان الهيكل المقلوب لا يمكن تدويره ليتماشى مع الهيكل الأصلي ، فإن الهيكل يكون كذلك غير متناظر أو متماثل ومجموعة التناظر هي متماثل. [1]

يسمى الاتجاه (بمعنى خط بدون سهم) قطبي إذا كانت حواسها ثنائية الاتجاه مختلفة هندسيًا أو ماديًا. يسمى اتجاه تناظر البلورة القطبية a المحور القطبي. [2] تسمى المجموعات التي تحتوي على محور قطبي قطبي. تمتلك البلورة القطبية محورًا قطبيًا فريدًا (بتعبير أدق ، جميع المحاور القطبية متوازية). تختلف بعض الخصائص الهندسية أو الفيزيائية عند طرفي هذا المحور: على سبيل المثال ، قد يحدث استقطاب عازل كما هو الحال في البلورات الكهروحرارية. يمكن أن يحدث المحور القطبي فقط في الهياكل غير المتماثلة المركزية. لا يمكن أن يكون هناك مستوى معكوس أو محور مزدوج عمودي على المحور القطبي ، لأنهما سيجعلان اتجاهي المحور متكافئين.

يمكن أن تحدث الهياكل البلورية للجزيئات البيولوجية غير المتجانسة (مثل تراكيب البروتين) فقط في 65 مجموعة فضاء متماثل (الجزيئات البيولوجية عادة ما تكون مراوان).

هناك سبعة أنواع مختلفة من الأنظمة البلورية ، ولكل نوع من الأنظمة البلورية أربعة أنواع مختلفة من التمركزات (بدائية ، متمركزة على القاعدة ، متمركزة على الجسم ، متمركزة على الوجه). ومع ذلك ، ليست كل المجموعات فريدة من نوعها ، فبعض التركيبات متكافئة في حين أن التوليفات الأخرى غير ممكنة بسبب أسباب التناظر. هذا يقلل من عدد المشابك الفريدة إلى 14 مشابك Bravais.

يوضح الجدول التالي توزيع 14 مشابك Bravais في أنظمة شعرية وعائلات بلورية.

في الهندسة وعلم البلورات ، أ شعرية Bravais هي فئة من مجموعات التماثل المترجمة (المعروفة أيضًا باسم المشابك) في ثلاثة اتجاهات.

تتكون مجموعات التناظر هذه من ترجمات بواسطة متجهات النموذج

أين ن1, ن2، و ن3 هي أعداد صحيحة و أ1, أ2، و أ3 هي ثلاثة نواقل غير متحد المستوى ، تسمى نواقل بدائية.

يتم تصنيف هذه المشابك حسب المجموعة الفضائية للشبكة نفسها ، حيث يُنظر إليها على أنها مجموعة من النقاط ، فهناك 14 شبكة Bravais بثلاثة أبعاد تنتمي كل منها إلى نظام شبكي واحد فقط. أنهم [ التوضيح المطلوب ] تمثل أقصى تماثل يمكن أن يتمتع به هيكل ما مع تناظر انتقالي معين.

يجب أن تتناسب جميع المواد البلورية (باستثناء شبه البلورات) ، بحكم تعريفها ، في أحد هذه الترتيبات.

للراحة ، يتم تصوير شبكة Bravais بواسطة خلية وحدة أكبر بعامل 1 أو 2 أو 3 أو 4 من الخلية البدائية. اعتمادًا على تناظر بلورة أو نمط آخر ، يكون المجال الأساسي أصغر مرة أخرى ، حتى العامل 48.

تمت دراسة مشابك Bravais بواسطة Moritz Ludwig Frankenheim في عام 1842 ، الذي وجد أن هناك 15 شبكة Bravais. تم تصحيح هذا إلى 14 بواسطة A. Bravais في عام 1848.

يتم تعريف خلية الوحدة رباعية الأبعاد بأربعة أطوال للحواف (أ, ب, ج, د) وست زوايا محورية (α, β, γ, δ, ε, ζ). تحدد الشروط التالية لمعلمات الشبكة 23 عائلة بلورية

تم تقديم الأسماء هنا وفقًا لـ Whittaker. [3] هم تقريبا نفس الشيء كما في براون وآخرون[4] باستثناء أسماء العائلات الكريستالية 9 و 13 و 22. أسماء هذه العائلات الثلاث وفقًا لبراون وآخرون ترد بين قوسين.

العلاقة بين العائلات البلورية رباعية الأبعاد والأنظمة البلورية والأنظمة الشبكية موضحة في الجدول التالي. [3] [4] يتم تمييز أنظمة Enantiomorphic بعلامة النجمة. يتم إعطاء عدد الأزواج المتشابهة بين قوسين. هنا مصطلح "enantiomorphic" له معنى مختلف عن الجدول لفئات الكريستال ثلاثية الأبعاد. هذا الأخير يعني ، أن مجموعات النقاط المتشابهة تصف الهياكل اللولبية (متشابهة الشكل). في الجدول الحالي ، تعني عبارة "enantiomorphic" أن المجموعة نفسها (تعتبر ككائن هندسي) متشابهة ، مثل الأزواج المتشابهة لمجموعات الفضاء ثلاثية الأبعاد P31 و P32، P4122 و P4322. بدءًا من الفضاء رباعي الأبعاد ، يمكن أيضًا أن تكون مجموعات النقاط متشابهة في هذا المعنى.


نتائج

التسمية والتوزيع الجينومي ل نبات الأرابيدوبسيس thaliana عائلة جين بروتين اف بوكس

يظهر التمثيل التخطيطي للتسميات الموحدة ، والذي تم اقتراحه هنا لتسمية جينات FBP ، ويمثل الجين محل الاهتمام في الشكل 4 أ ، بينما يتم توفير تسمية عائلة جينات Arabidopsis FBP في الجدول التكميلي S1. كشف عارض كروموسوم ePlant المستخدم لتحديد موقع الجينات أن الجين المستهدف لدينا موجود على الذراع القصيرة (ع) من الكروموسوم 3 (الشكل 4 ب) ووفقًا للتسمية ، فإن الجين الذي يهمنا هو كما يلي 3 ص. أظهر بحث NCBI ذلك 3 ص يقع في اتجاه عكسي على تسلسل الجينوم المرجعي للكروموسوم 3 NC_003074.8 (الشكل 4C) بينما أظهر تحليل التسلسل ذلك 3 ص هو جين طويل 1.24 كيلو بايت يتكون من إكسون واحد (الشكل 4 د) ويرمز 397 بروتين طويل من الأحماض الأمينية. أظهر التوزيع الجيني لجينات FBP توزيعها المتساوي على جميع الكروموسومات الخمسة (الشكل 5 أ). يصف التوزيع المتساوي لجينات تشفير FBP ارتباطًا إيجابيًا بطول الكروموسومات ، أي الكروموسومات 1 و 3 و 5 ، والتي تعد تحتوي على المزيد من جينات FBP مقارنةً بالكروموسومات 2 و 4 ، والتي تكون أقصر في الحجم. ومع ذلك ، من بين الكروموسومات الأطول ، يكون عدد جينات تشفير FBP على الكروموسوم 3 أكبر مقارنة بالكروموسوم 5 ، وهو أكبر نسبيًا في الحجم (الشكل 5 ب).

الشكل 4. نظام تسمية عائلة الجينات FBP ، و 3 ص توطين الكروموسوم والتوجيه والبنية الجينية. (أ) يوضح نظام تسمية أبجدي رقمي يتكون من عدة أجزاء ، يمثل الجين محل الاهتمام ، لتسمية عائلة الجينات FBP في Arabidopsis. (ب) يوضح ذلك على وجه التحديد 3 ص يقع على الذراع القصيرة لكروموسوم أرابيدوبسيس 3 في منطقة كثافة جينية عالية. (ج) يدل على أن 3 ص يقع في اتجاه عكسي على تسلسل الكروموسوم المرجعي NCBI NC_003074.8 جنبًا إلى جنب مع الجينات الأخرى. (د) يصف 3 ص بنية. يبلغ طول الجين 1.24 كيلو بايت ويشفر exon واحدًا باستخدام منطقة UTR 5 & # x2032.

الشكل 5. التوزيع الجينومي لـ نبات الأرابيدوبسيس thaliana جينات F-box. (أ) يوضح توزيع وتوطين جينات FBP على خمسة كروموسومات مختلفة من نبات الأرابيدوبسيس thaliana. (ب) يصف العلاقة الإيجابية بين طول الكروموسوم وعدد جينات ترميز FBP. تميل الكروموسومات الأطول إلى امتلاك المزيد من جينات FBP مقارنة بالكروموسومات الأصغر باستثناء أن المزيد من جينات FBP تعيش على الكروموسوم 3 مقارنة بالكروموسوم 5 ، وهو أكبر من الكروموسوم 3.

التوطين الخلوي المتوقع والخصائص الفيزيائية والكيميائية

تم استخدام أدوات حسابية مختلفة لإجراء تحليل منهجي مفصل على تسلسل البروتين 3p.AtFBP113 المسترجع من UniPort. توقعت أدوات التنبؤ بالتوطين تحت الخلوي أن 3p.AtFBP113 يقع إما في النواة أو السيتوبلازم أو غشاء البلازما ويفتقر إلى الإشارة / الببتيدات العابرة واللوالب الغشائية. توقع مخطط cNLS وجود نوعين من إشارات التوطين النووي ، أي أحادي الجزء وثنائي الجزء. اقترحت الإشارة أحادية الجزء ، الموجودة في المنطقة الطرفية N ، توطينًا نوويًا قويًا بسبب الدرجة العالية بينما اقترحت درجة الإشارة ثنائية الجزء توطينها في كلا الجزأين ، أي السيتوبلازم والنواة. يتم عرض تصور طوبولوجيا البروتين 3p.AtFBP113 التي تم الحصول عليها باستخدام بروتر في الشكل 6. يتم تلخيص الخصائص الفيزيائية والكيميائية المحسوبة لبروتين 3p.AtFBP113 في الجدول 1.

الشكل 6. تصور 3p.AtFBP113 طوبولوجيا البروتين. يوضح بروتر أن 3p.AtFBP113 تفتقر إلى حلزونات الغشاء وهي موجودة في المنطقة داخل الخلايا. لذلك ، فهو محروم من الطوبولوجيا النموذجية ، وهي السمة المميزة لبروتينات TM.

الجدول 1. تم توقع الخصائص الفيزيائية والكيميائية لبروتين 3p.AtFBP113 باستخدام أداة ProtParam المتوفرة في خادم ExPASy.

المجالات الوظيفية المتوقعة ، والدوافع ، والطيات ، والأسرة

توقعت جميع قواعد بيانات التنبؤ بالمجال الوظيفي المستخدمة مثل CDD و ScanProsite و SMART و Pfam و CDART و InterProScan أن 3p.AtFBP113 تحتوي على 40-50 مجال F-box طويل من الأحماض الأمينية تقريبًا في منطقة N-terminal الخاصة بها. إلى جانب المجال N-terminal ، أظهرت بعض قواعد البيانات هذه مثل مخرجات CDD و SMART و Pfam و CDART مجالًا إضافيًا في منطقة C-terminal. على سبيل المثال ، توقع CDD و CDART نوع المجال المرتبط بـ F-box 1 (FBA1) الممتد من 127 إلى 365 من الأحماض الأمينية ، بينما أظهرت مخرجات SMART و Pfam نوع المجال المرتبط بـ F-box 3 (FBA3) الممتد من 233 إلى 357 amino في C- طرفية. كشف البحث في قاعدة بيانات InterProScan أن تسلسل 3p.AtFBP113 يحتوي في منطقة C-terminus الخاصة به إما على مجال التفاعل المرتبط بـ F-box (127-365 aa) أو مجال FBA3 (234-357 aa). توقع CDD و CDART أن يكون عضوًا في عائلة نطاق شبيهة بـ F-box أو عائلة مجال FBA1 الفائقة. أظهر ناتج InterProScan أنه عضو في عائلة مجال F-box الفائقة أو عائلة مجال شبيهة بمربع F ، في حين توقعت نتيجة Superfamily أنها تنتمي إلى عائلة مجال F-box الفائقة من البروتينات. المجالات ، التي تنبأت بها أدوات المعلوماتية الحيوية المختلفة ، موضحة في الشكل 7. اكتشف MotifFinder ثلاثة أشكال في تسلسل البروتين ، أي ، شكل F-box أو F-box-like في منطقة N-terminal بينما عزر FBA3 في المنطقة الطرفية C ، في حين توقع خادم الويب PFP-FunDSeqE أضعاف تشبه الغلوبولين المناعي في تسلسل البروتين.

الشكل 7. المجالات الوظيفية المتوقعة في تسلسل البروتين 3p.AtFBP113. يوضح الشكل أن تسلسل 3p.AtFBP113 يحتوي على مجالين رئيسيين أحدهما يقيم في منطقة N-terminal الخاصة به ، بينما الآخر موجود في منطقة C-terminal. على الرغم من توقع مجالات C-terminal المختلفة من قواعد بيانات مختلفة للتنبؤ بالمجال ، إلا أن هذه المجالات لها مناطق متداخلة وتنتمي إلى نفس الفئة الفرعية لبروتينات F-box ، أي المجال المرتبط بـ F-box (FBA).

المنشور المتوقع / تعديلات الترجمة المشتركة

يعد الارتباط بالجليكوزيل أحد التعديلات الرئيسية للبروتينات بعد ترجمتها وتقوم البروتينات السكرية بعمليات مهمة مختلفة على المستوى الخلوي مثل طي البروتينات ، والتفاعل بين الخلية والخلية ، والتعرف على الخلايا ، والتفاعل بين المضيف والممرض (Chauhan et al. ، 2013). في تسلسل البروتين 3p AtFBP113 ، توقعت أداة GlycoEP أن 154N كمخلفات محتملة للارتباط بالجليكوزيل المرتبط بـ N ، تم توقع العديد من المخلفات ، على سبيل المثال ، 42S ، 61S ، و 252S كمواقع محتملة مرتبطة بـ O بينما لا يمكنها التنبؤ بأي احتمال مرتبط بـ C. مواقع الارتباط بالجليكوزيل في تسلسل البروتين. يعد الأستلة N-terminal هو التعديل الأكثر شيوعًا ، والذي يحدث بشكل مشترك (Kiemer et al. ، 2005). أظهر ناتج خادم NetAcet 1.0 أن تسلسل 3p.AtFBP113 لا يحتوي على أي موقع acetylation محتمل. تعد الفسفرة في السيرين أو الثريونين أو التيروزين أهم تعديل يؤثر على إشارات العمليات الخلوية المختلفة (بلوم وآخرون ، 1999). توقع خادم NetPhos 3.1 العديد من مواقع الفسفرة المحتملة في تسلسل 3p.AtFBP113 (الشكل 8). تم ذكر المواقع المحتملة المتوقعة في تسلسل 3p.AtFBP113 لتعديلات ما بعد / ترجمة مشتركة مختلفة في الجدول 2.

الشكل 8. مواقع الفسفرة المحتملة المتوقعة في تسلسل 3p.AtFBP113. تم توقع العديد من المخلفات ذات الإمكانات العالية للفسفرة بواسطة خادم NetPhos كما هو موضح من خلال درجاتها العالية في الرسم البياني. تشير الدرجة الأعلى ، أي 1 ، إلى ثقة عالية في التنبؤ. من بين هؤلاء ، يبدو أن بقايا السيرين لديها احتمالية أكبر للفسفرة حيث أن العديد من بقايا السيرين لها درجة قريبة من 1.

الجدول 2. المخلفات المحتملة المتوقعة في تسلسل البروتين 3p.AtFBP113 للخضوع لتعديلات لاحقة / مشتركة في الترجمة.

الوظائف الجزيئية والخلوية المستنبطة بناءً على مصطلحات GO وشبكة PPI وتحليل التعبير المشترك للجينات

أعاد إخراج ARGOT2.5 العديد من مصطلحات GO (الجدول التكميلي S2) من بينها أهم المصطلحات المتوقعة 3 ص يشارك في العمليات البيولوجية مثل انتشار البروتين. على المستوى الجزيئي 3 ص من المتوقع أن يشارك في ارتباط البروتين ، بينما على المستوى الخلوي من المتوقع أن يكون جزءًا من المركب الأساسي البروتيازومي.

من أجل الفهم 3 ص وظائف في سياق شبكة بيولوجية جيدة التنظيم في البيئة الخلوية ، تم استخدام قاعدة بيانات STRING للتنبؤ بالشركاء المتفاعلين لبروتين 3p.AtFBP113. ومع ذلك ، مع قيمة القطع 0.04 ، لم نتمكن من الحصول على شركاء بروتين تفاعلي موثوق به. بعد ذلك ، باستخدام Expression Angler ، حصلنا على حوالي 24 جينًا لها أنماط تعبير مماثلة لتلك الموجودة في 3 ص خلال عملية التولد الدقيق (الشكل 9). تم البحث في قاعدة بيانات TAIR عن شرح وظائف الجينات. الجينات التي أظهرت أنماط تعبير متشابهة قوية ، أي وجود معامل ارتباط بيرسون & # x2265 0.7 كانت بشكل أساسي تلك التي تشارك في فسفرة البروتين ، وتقسيم الخلايا ، والنقل ، وانتشار البروتين ، وربط البروتين (الجدول التكميلي S3).

الشكل 9. الخريطة الحرارية للجينات التي يتم التعبير عنها بالاشتراك مع 3 ص بطريقة خاصة بالأنسجة. الجزء (أ) يوضح الشكل أنماط التعبير المحلية للجينات التي تعبر عن نفسها مع الجين المرشح 3 ص (At3g49450) في شكل خريطة حرارة خلال مراحل تطور مختلفة من التولد الدقيق. (ب) يُظهر وجهة النظر العالمية للتعبير الجيني الذي يشير إلى التعبير التفاضلي القوي للجين خلال المرحلة الأخيرة من التولد الدقيق. تشير وسيلة إيضاح اللون إلى مستويات التعبير في شكل تغيير الطية ، حيث يظهر اللون الأحمر الحد الأقصى ويمثل اللون الأصفر الحد الأدنى من التغيير. (ج) يصور التعبير عن 3 ص حصريًا خلال مراحل النمو المختلفة من التولد الدقيق. يكون التعبير الجيني منخفضًا خلال المراحل المبكرة بينما يصل إلى مستوى عالٍ خلال مراحل لاحقة من التكاثر كما هو مبين في أسطورة اللون الخاصة بتغيير الطية.

الهياكل الثانوية والثالثية من 3p.AtFBP113

تم توقع الهياكل الثانوية والثالثية لـ 3p.AtFBP113 للحصول على نظرة ثاقبة حول ميزاتها الهيكلية ووظيفتها. أظهرت نتائج PSIPRED أن تسلسل 3p.AtFBP113 يهيمن عليه & # x03B2- صفائح وملفات مطوية متبوعة بـ & # x03B1-helices (الشكل 10). نظرًا لأننا لم نتمكن من العثور على أي بنية ثلاثية الأبعاد مناسبة للبروتين المتماثل في مكتبة PDB لنمذجة التماثل ، لذلك قمنا بإنشاء هياكل ثلاثية الأبعاد باستخدام خوادم I-TASSER و Robetta. أنتج مخرجات I-TASSER 5 نماذج بدرجات C مختلفة تتراوح من -4 إلى -2 ، وتم اختيار الطراز الذي حصل على أعلى درجة C التي تعكس ثقة عالية كنموذج نهائي. استخدم خادم Robetta النمذجة المقارنة وقام أيضًا بإنشاء 5 نماذج تم اختيار أفضل نموذج من بينها. أدى التحسين باستخدام خادم تقليل الطاقة YASARA إلى إعادة الطرز ذات الطاقة المنخفضة وقيم Z العالية. بعد ذلك ، أدى التحقق من صحة نماذج I-TASSER و Robetta باستخدام خادم الويب ProSA إلى إرجاع درجات Z ضمن نطاق الهياكل ثلاثية الأبعاد المحددة تجريبياً للبروتينات وتصوير جودتها الإجمالية الجيدة (الشكلان 11 أ ، ب). كشف تحليل مخططات راماشاندران التي تم إنشاؤها بواسطة وحدة PDBsum النمطية PROCHECK أنه بالنسبة لنماذج I-TASSER و Robetta التي تم إنشاؤها ، فإن 94.3 ٪ و 97.7 ٪ من البقايا phi (& # x03A6) و psi (& # x03A8) كانت مطابقة الروابط في الأكثر تفضيلًا المناطق والمناطق المسموح بها بالإضافة إلى ذلك ، مما يصور الجودة الجيدة لنماذج 3p.AtFBP113 ثلاثية الأبعاد (الأشكال 11C ، D). أظهرت وحدة ERRAT الخاصة بأداة SAVES v5.0 أن عامل الجودة الإجمالي لنموذج بروتين I-TASSER كان 87.9 بينما كان نموذج Robetta 84.6. وبالتالي فإن جميع أدوات التحقق المستخدمة تشير إلى الجودة الجيدة للنموذج ثلاثي الأبعاد المتوقع. أخيرًا ، أظهر تصور النماذج ثلاثية الأبعاد باستخدام PyMol وجود نوعين من المجالات في تسلسل البروتين 3p.AtFBP113 (الشكل 12).

الشكل 10. الهيكل الثانوي المتوقع للبروتين 3p.AtFBP113. يوضح الهيكل الثانوي لـ 3p.AtFBP113 أن خيوط & # x03B2 (الأسطوانات الصفراء) هي العناصر الهيكلية الثانوية الأكثر وفرة تليها & # x03B1-helices (الأسطوانات الوردية). علاوة على ذلك ، فإن الملفات (الخطوط الرمادية) متوفرة أيضًا بكثرة في الهيكل الثانوي لـ 3 p.

الشكل 11. أدى التحقق من صحة I-TASSER و Robetta إلى إنشاء نماذج ثلاثية الأبعاد للبروتين 3p.AtFBP113. المؤامرة جزئيا (أ) يُظهر Z-Score لـ I-TASSER الذي تم إنشاؤه لنموذج ثلاثي الأبعاد ، بينما بتنسيق (ب) للنموذج الذي طوره خادم Robetta. تُظهر الرسوم البيانية جودة إجمالية جيدة للنماذج نظرًا لوجود درجات Z الخاصة بهم ضمن نطاق هياكل البروتين المحددة تجريبياً. الجزء (ج) يوضح الشكل تشكيل روابط phi (& # x03A6) و psi (& # x03A8) للهيكل ثلاثي الأبعاد الذي تم إنشاؤه بواسطة I-TASSER حيث يكون إجمالي 97.4 ٪ من بقايا السندات phi (& # x03A6) و psi (& # x03A8) في التشكل ، وهو إما الأكثر ملاءمة أو المسموح به ، بينما 2.6 ٪ من المخلفات هي القيم المتطرفة. (د) يعرض مخطط راماشاندران لنموذج ثلاثي الأبعاد تم إنشاؤه بواسطة Robetta. تُظهر المؤامرة أن المناطق الأكثر تفضيلاً والمسموح بها والمسموح بها بسخاء تحتوي على 98٪ من المخلفات بينما 2٪ من البقايا لها عوائق خيفية وقيم متطرفة.

الشكل 12. الهياكل الثلاثية للبروتين 3p.AtFBP113 التي تم إنشاؤها بواسطة خادمين مختلفين للنمذجة. (أ) التمثيل التخطيطي للهيكل الثلاثي الكامل الذي تم إنشاؤه بواسطة I-TASSER كمخطط شريطي. (ب) مخطط الشريط للهيكل ثلاثي الأبعاد ، الذي تم إنشاؤه بواسطة برنامج Robetta. في كلا الهيكلين من الدرجة الثالثة ، يتم عرض الأغلفة المطوية & # x03B2 بلون أرجواني ويصف اللون السماوي & # x03B1-helices ، بينما تشكل الملفات (أحمر فاتح) باقي جزء البروتين. تشكل الحلزونات & # x03B1 مجال F-box في منطقة N- الطرفية ، بينما يشكل غلافان متوازيان & # x03B2 مطويان ، اللذان يشكلان طية تشبه الغلوبولين المناعي ، مجال C-terminal FBA.


مفهوم الأنواع في علم الأحياء الدقيقة

عدد أنواع البكتيريا والعتائق صغير بشكل مدهش ، على الرغم من تطورها المبكر وتنوعها الوراثي والبيئي.

أهداف التعلم

وصف مفهوم الأنواع متعددة الأطوار

الماخذ الرئيسية

النقاط الرئيسية

  • الاختلافات في مفاهيم الأنواع بين البكتيريا والكائنات الحية ، والصعوبات في النمو / التوصيف في الثقافة النقية (شرط أساسي لتسمية أنواع جديدة ، في أعلاه) ، ونقل الجينات الأفقي الواسع الذي يطمس التمييز بين الأنواع يجعل التمايز صعبًا.
  • التعريف الأكثر شيوعًا هو الأنواع متعددة الأطوار التعريف ، الذي يأخذ في الاعتبار الاختلافات المظهرية والجينية.
  • تتمثل العتبة التشخيصية الأسرع في فصل الأنواع على أنها أقل من 70٪ من تهجين الحمض النووي والحمض النووي الريبي ، وهو ما يتوافق مع أقل من 97٪ من هوية تسلسل الحمض النووي 16S.

الشروط الاساسية

  • بكتيريا: البكتيريا تشكل مجالا كبيرا من الكائنات الحية الدقيقة بدائية النواة. عادةً ما يبلغ طول البكتيريا بضعة ميكرومتر ، ولها مجموعة واسعة من الأشكال ، تتراوح من الكرات إلى القضبان واللوالب. كانت البكتيريا من بين أشكال الحياة الأولى التي ظهرت على الأرض ، وهي موجودة في معظم الموائل على هذا الكوكب.
  • محيط: في علم الأحياء ، النوع هو أحد الوحدات الأساسية للتصنيف البيولوجي والرتبة التصنيفية. غالبًا ما يتم تعريف النوع على أنه مجموعة من الكائنات الحية القادرة على التزاوج وإنتاج ذرية خصبة.
  • تهجين الحمض النووي: التهجين هو عملية إنشاء تفاعل غير تساهمي محدد التسلسل بين اثنين أو أكثر من الخيوط التكميلية للأحماض النووية في مجمع واحد ، والذي يشار إليه في حالة الخيطين على أنه مزدوج. سوف يرتبط القليل من النيوكليوتيدات أو الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي بمكملاتها في ظل الظروف العادية ، لذا فإن خيطين متكاملين تمامًا سيرتبطان ببعضهما البعض بسهولة.

التصنيف البيولوجي: التسلسل الهرمي للتصنيف البيولوجي & # 8217s ثماني مراتب تصنيفية رئيسية. الجنس يحتوي على نوع واحد أو أكثر. لا يتم عرض التصنيفات الثانوية المتوسطة.

الحكم على الأنواع في سياق اللاجنسي

تنقسم البكتيريا لاجنسيًا ولا تظهر في معظمها مناطق. بمعنى آخر ، & # 8220 كل شيء في كل مكان. & # 8221 وبناءً عليه ، فإن مفهوم الأنواع التي تعمل بشكل أفضل مع الحيوانات ، يصبح بالكامل مسألة حكم.

ما يقرب من 5000 نوع من البكتيريا والعتيقة تشكل عددًا صغيرًا بشكل مدهش ، بالنظر إلى تطورها المبكر نسبيًا ، والتنوع الجيني ، والقدرة على الإقامة في جميع النظم البيئية على الأرض. يكمن سبب هذه الخصوصية العددية في الاختلافات في مفاهيم الأنواع بين البكتيريا والكائنات الحية الكبيرة والصعوبات في النمو والتوصيف في الثقافة النقية (شرط أساسي لتسمية الأنواع الجديدة ، في أعلاه). بالإضافة إلى ذلك ، فإن الكمية الكبيرة من نقل الجينات الأفقي بين الكائنات الحية الدقيقة تؤدي إلى عدم وضوح الفروق بين الأنواع بين الكائنات الحية الدقيقة.

التعريف الأكثر شيوعًا هو الأنواع متعددة الأطوار التعريف ، الذي يأخذ في الاعتبار الاختلافات المظهرية والجينية. ومع ذلك ، فإن العتبة التشخيصية السريعة للأنواع المنفصلة هي أقل من 70٪ من تهجين الحمض النووي والحمض النووي ، وهو ما يتوافق مع أقل من 97٪ من هوية تسلسل الحمض النووي 16S. وقد لوحظ أنه إذا تم تطبيق هذا على تصنيف الحيوانات ، فسيتم اعتبار ترتيب الرئيسيات نوعًا واحدًا.

المجلة الدولية لعلم الجراثيم النظامية / المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري (IJSB / IJSEM) هي مجلة راجعها النظراء تعمل كمنتدى دولي رسمي لنشر أصناف بدائية النواة جديدة. إذا تم نشر أحد الأنواع في مجلة مختلفة لمراجعة الأقران ، فيمكن للمؤلف تقديم طلب إلى IJSEM مع الوصف المناسب. إذا كانت المعلومات صحيحة ، سيتم عرض الأنواع الجديدة في قائمة التحقق من صحة IJSEM.


16.4 الممالك والمجالات

قبل لينيوس بفترة طويلة ، كانت النباتات والحيوانات تعتبر مملكتين منفصلتين. استخدم لينيوس هذا باعتباره المرتبة الأولى ، حيث قسم العالم المادي إلى ممالك نباتية وحيوانية ومعدنية. نظرًا لأن التقدم في الفحص المجهري جعل تصنيف الكائنات الحية الدقيقة ممكنًا ، فقد زاد عدد الممالك ، وكانت أنظمة الخمس والستة هي الأكثر شيوعًا.

عندما قدم كارل لينيوس نظام التسميات القائم على الرتبة في علم الأحياء عام 1735 ، أعطيت أعلى مرتبة اسم "مملكة" وتبعها أربع مراتب رئيسية أو رئيسية أخرى: الفئة ، والترتيب ، والجنس ، والأنواع. في وقت لاحق تم إدخال رتبتين رئيسيتين أخريين ، مما يجعل مملكة التسلسل ، والشعبة أو التقسيم ، والطبقة ، والنظام ، والأسرة ، والجنس ، والأنواع. في عام 1990 ، تم تقديم رتبة المجال فوق المملكة.

يمكن إضافة البادئات بحيث تكون subkingdom (subkingdom) و infrakingdom (المعروف أيضًا باسم infraregnum) هما الرتبتان اللتان تقعان تحت المملكة مباشرة. يمكن اعتبار الملك الفائق معادلاً للمجال أو الإمبراطورية أو كرتبة مستقلة بين المملكة والمجال أو المجال الفرعي. في بعض أنظمة التصنيف ، يمكن إدراج فرع الرتبة الإضافي (لاتيني: ramus) بين subkingdom و infrakingdom ، على سبيل المثال ، Protostomia و Deuterostomia في تصنيف Cavalier-Smith.

تخلت بعض التصنيفات الحديثة القائمة على علم الكيانات الحديثة صراحةً عن مصطلح "مملكة" ، مشيرةً إلى أن الممالك التقليدية ليست أحادية النمط ، أي لا تتكون من جميع أحفاد سلف مشترك.

حسب التقاليد ، عادةً ما يتم كتابة الأسماء ذات الحدين للأنواع بخط مائل على سبيل المثال ، الانسان العاقل. بشكل عام ، يجب طباعة ذات الحدين بنمط خط يختلف عن النمط المستخدم في النص العادي ، على سبيل المثال ، "أكثر من ذلك الانسان العاقل تم اكتشاف الحفريات ". عند الكتابة بخط اليد ، يجب وضع خط تحت الاسم ذي الحدين ، على سبيل المثال ، الانسان العاقل.

الجزء الأول من ذات الحدين ، اسم الجنس ، يتم كتابته دائمًا بحرف كبير أولي. في الاستخدام الحالي ، لا تتم كتابة الجزء الثاني بأحرف كبيرة. تستخدم المصادر القديمة ، وخاصة الأعمال النباتية المنشورة قبل الخمسينيات ، اتفاقية مختلفة. إذا كان الجزء الثاني من الاسم مشتقًا من اسم علم ، على سبيل المثال اسم الشخص أو المكان ، تم استخدام حرف كبير. وهكذا تمت كتابة الشكل الحديث بربريس دارويني على أنه بربريس دارويني. تم استخدام حرف كبير أيضًا عندما يتكون الاسم من اسمين في الموضع ، على سبيل المثال ليو بانثيرا أو قنطورس سيانوس.

عند استخدامه مع اسم شائع ، غالبًا ما يتبع الاسم العلمي بين قوسين ، على الرغم من أن هذا يختلف باختلاف النشر. على سبيل المثال ، "عصفور المنزل (عابر سبيل) في أوروبا ".

يجب كتابة الاسم ذي الحدين بالكامل بشكل عام. الاستثناء من ذلك هو عندما يتم سرد أو مناقشة عدة أنواع من نفس الجنس في نفس الورقة أو التقرير ، أو يتم ذكر نفس النوع مرارًا وتكرارًا ، وفي هذه الحالة يتم كتابة الجنس بالكامل عند استخدامه لأول مرة ، ولكن قد يتم بعد ذلك يتم اختصارها إلى أولية (ونقطة / نقطة توقف كاملة). على سبيل المثال ، يمكن كتابة قائمة بأعضاء جنس Canis كـ "Canis lupus، C. aureus، C. simensis". في حالات نادرة ، انتشر هذا الشكل المختصر لاستخدام أكثر عمومية على سبيل المثال ، غالبًا ما يشار إلى بكتيريا Escherichia coli على أنها E. coli فقط ، وربما يُعرف Tyrannosaurus rex ببساطة باسم T. rex ، وكلاهما يظهران غالبًا في هذا النموذج في الكتابة الشعبية حتى في حالة عدم إعطاء اسم الجنس الكامل بالفعل.

16.4.1 نظام المجالات الثلاثة

نظام المجالات الثلاثة هو تصنيف بيولوجي تم اقتراحه لأول مرة في عام 1977 من قبل Carl Woese الذي يقسم أشكال الحياة الخلوية إلى Archaea و Bacteria و Eukaryota. يتمثل الاختلاف الرئيسي عن التصنيفات السابقة في تقسيم العتائق والبكتيريا ، التي كانت مجمعة سابقًا في بكتيريا المملكة الواحدة (مملكة تسمى أحيانًا Monera).

يضيف نظام المجالات الثلاثة مستوى من التصنيف (المجالات) "فوق" الممالك الموجودة في أنظمة الممالك الخمس أو الست المستخدمة سابقًا. يتعرف نظام التصنيف هذا على الانقسام الأساسي بين مجموعتي بدائيات النوى ، بقدر ما يبدو أن الأركيا أكثر ارتباطًا بحقيقيات النوى أكثر من ارتباطها بدائيات النوى الأخرى - كائنات شبيهة بالبكتيريا بدون نواة خلية. يقوم النظام الحالي بفرز الممالك المعروفة سابقًا إلى هذه المجالات الثلاثة: العتائق والبكتيريا وحقيقيات النوى.

جادل ووز ، على أساس الاختلافات في جينات الرنا الريباسي 16S ، بأن البكتيريا والعتائق وحقيقيات النوى نشأت كل منها بشكل منفصل عن سلف ذي آلية وراثية ضعيفة التطور ، وغالبًا ما يطلق عليها اسم السلالة. ليعكس خطوط النسب الأولية هذه ، تعامل مع كل منها كمجال ، مقسم إلى عدة ممالك مختلفة. في الأصل كان انقسامه من بدائيات النوى إلى Eubacteria (الآن البكتيريا) و Archaebacteria (الآن Archaea). استخدم Woese في البداية مصطلح "مملكة" للإشارة إلى المجموعات التطورية الثلاثة الأولية ، وقد تم استخدام هذه التسمية على نطاق واسع حتى تم اعتماد مصطلح "المجال" في عام 1990.

كان قبول صحة تصنيف Woese الصالح نسبيًا عملية بطيئة. اعترض علماء الأحياء البارزون ، بما في ذلك سلفادور لوريا وإرنست ماير ، على تقسيم بدائيات النوى. لم يقتصر النقد الموجه إليه على المستوى العلمي فقط. تركه عقد من الفهرسة قليلة النوكليوتيد التي تتطلب عمالة مكثفة مع سمعة بأنه "كرنك" ، وسيستمر Woese ليُطلق عليه لقب "Microbiology’s Scarred Revolutionary" من خلال مقال إخباري نُشر في مجلة Science. دفع الكم المتزايد من البيانات الداعمة المجتمع العلمي إلى قبول الأركيا بحلول منتصف الثمانينيات. اليوم ، يتشبث عدد قليل من العلماء بفكرة بروكاريا الموحدة.


التسمية العلمية

تستخدم الحروف المائلة للأصناف البكتيرية والفيروسية على مستوى الأسرة وما دونها. جميع الجينات البكتيرية والعديد من الجينات الفيروسية مائلة. مصل السالمونيلا المعوية ليست مائلة.

بالنسبة للكائنات الحية بخلاف البكتيريا والفطريات والفيروسات ، يجب أن تكون الأسماء العلمية للأصناف فوق مستوى الجنس (العائلات ، الطلبات ، إلخ) بالنمط الروماني.

نظرًا لأن اختصارات نوكليازات التقييد مشتقة من اسم الكائن الحي (البكتيريا عادةً) التي يتم عزلها منها ، يجب أن تكون مائلة.

SMAكنت معزولا عن السراتية الذابلة.

طق تم عزل البوليميراز ، الذي يستخدم في تفاعل البوليميراز المتسلسل ، من ثيرموس أكواتيكوس.

استخدم الخط المائل للجنس والأنواع في أسماء الفيروسات.

اجعل الأنواع ، والتنوع أو الأنواع الفرعية ، والجنس مائلًا عند استخدامها في صيغة المفرد. لا تجعل اسم الجنس مائلاً أو كبيرًا عند استخدامه في صيغة الجمع.

الليسترية المستوحدة يكون

& helliplisteria هي بكتيريا السالمونيلا الفطرية

الجنس السالمونيلا يتكون من نوعين فقط: S. المعوية (مقسمة إلى 6 أنواع فرعية) و S. بونغوري. معظم السالمونيلا التي تصادف في العيد ستكون من الأنماط المصلية (السيروفار) S. المعوية. ضع الجنس والأنواع بخط مائل ، متبوعًا بالنمط المصلي المغطى مبدئيًا باللغة الرومانية (على سبيل المثال ، السالمونيلا المعوية النمط المصلي Paratyphi). لا ينبغي أبدًا استخدام اختزال الجنس و ldquoS. & rdquo بدون اسم نوع

صيح: S. المعوية التيفيموريوم المصلي

صيح: S. المعويةخادم. التيفيموريوم

غير صحيح: السالمونيلا التيفيموريوم

يتم تحديد الأنماط المصلية التي تنتمي إلى الأنواع الفرعية الأخرى بواسطة صيغها المستضدية بعد اسم النوع الفرعي (على سبيل المثال ، S. المعوية نوع فرعي diarizonae 60: k: z أو S. IIIb 60: k: z).

لمقال حول جنس واحد ، يمكن للمؤلف استخدام الاختصار لإدخال أنواع جديدة.

درسنا الزائفة الزنجارية, P. putida، P. fluorescens، و P. denitrificans.

بالنسبة لمقال حول أجناس متعددة لكل منها اختصار مختلف ، يمكن للمؤلف استخدام الاختصار لتقديم أنواع جديدة.

درسنا الزائفة الزنجارية, الأبراج العقدية, P. putida، و S. فيليس.

بالنسبة لمقال حول أجناس متعددة ، بعضها له نفس الاختصار ، اكتب أول ذكر للأنواع الجديدة. اختصر لاحقًا.

درسنا العلاقة بين المثقبية الكروزية و الترياتوما إنفستان.

وجدنا العلاقة بين T. infestans و T. كروزي أن تكون.

بالنسبة لمقال حول عدة أنواع من نفس الجنس ، يجب توضيح الجنس فقط في العنوان وعند استخدامه لأول مرة في الملخص والنص والجداول والأشكال. قد يتم اختصارها لاحقًا للأنواع الأخرى.

درسنا الزائفة الزنجارية ، P. putida، و المتألقة P..

ومع ذلك ، إذا بدأ الجنس & gt1 بالحرف نفسه في المقالة ، فيجب توضيح اسم الجنس بالكامل في المرة الأولى التي يتم استخدامه فيها مع نوع جديد. في الإشارات اللاحقة للأنواع ، يمكن اختصار الجنس.

تم اكتشاف القراد في الذئب الرمادي, كانيس لاتران, سيردوسيون آلاف، و الكريسوسيون العضدي، لكن C. الذئبة استضافت أكبر عدد من القراد.

بكتيريا

مائل الأسرة والجنس والأنواع والتنوع أو الأنواع الفرعية. ابدأ العائلة والجنس بحرف كبير. تبدأ المملكة ، واللجوء ، والفئة ، والترتيب ، والترتيب الفرعي بحرف كبير ولكن لا يتم وضع خط مائل. في حالة وجود صيغة عامة للكائن الحي (انظر Dorland & rsquos) ، فهي ليست مكتوبة بحروف كبيرة ولا مائلة.

أسرة المتفطرة، طلب Actinomycetales

تستخدم مجموعات الأنواع الثنائية دائمًا في صيغة المفرد. عادة ما يستخدم الجنس المستخدم بمفرده (بحروف كبيرة ومائلة) في صيغة المفرد ، ولكن يمكن استخدامه في صيغة الجمع (غير مائل) إذا كان يشير إلى جميع الأنواع داخل هذا الجنس.

السالمونيلا منتشرة في كل مكان و hellip

لا تستخدم مسافات لعزل MRSA.

الفطريات

استخدم حمى الوادي ، وليس حمى الوادي ، عند الإشارة إلى الفطار الكرواني. يتوافق استخدام الأحرف الصغيرة & ldquof & rdquo in & ldquofever & rdquo مع الاستخدام في دليل الأمراض المعدية ومع أسلوب AMA لمقاومة حمى الوادي المتصدع.

الجينات

عادة ما تكون التعيينات الجينية مائلة ، مما يساعد على توضيح ما إذا كان الكاتب يشير إلى جين أو إلى كيان آخر قد يتم الخلط بينه وبين الجين. يختلف نمط الجينات باختلاف الكائن الحي.

لا يوجد إجماع حقيقي على أسلوب تصوير الاختصارات لـ المتصورة الجينات ، باستثناء أنه عندما يشار إليها باسم الجينات ، فإنها مائلة عندما يشار إليها بالبروتينات ، فهي ليست كذلك. الأسلوب يعتمد أكثر على المجلة الخاصة. في علم الأحياء الدقيقة الجزيئي ، يتم اختصار الجين والأنواع ، أي ص، مائل وكل المصطلح مكتوب بحروف صغيرة pfmdr1, pfatp6, pvdhfr. تم تقديم هذا الجين المعين في The Lancet كـ PfATPase6. الفكرة الرئيسية هي أن تكون متسقة في جميع أنحاء المخطوطة.

الاختصارات لـ المتصورة يتم كتابة الجينات بالخط المائل عند الإشارة إلى الجين. عند الإشارة إلى البروتين ، لا يتم وضع خط مائل.

تتم كتابة العديد من أسماء الجينات الفيروسية بخط مائل وتتكون تقليديًا من 3 أحرف ، صغيرة ، على الرغم من أن بعضها سيتم كتابتها بأحرف كبيرة ، رومانية. لا توجد قواعد محددة لتسمية هذه الجينات ، وسوف تراها موصوفة بعدة طرق مختلفة.

يتم دائمًا كتابة أسماء الجينات البكتيرية بخط مائل.

يتم التعامل مع أسماء الجينات الفطرية بشكل عام مثل أسماء الجينات الفيروسية (على سبيل المثال ، 3 أحرف مائلة ، وأحرف صغيرة). مع عائلة متعددة الأجناس ، يتم تضمين تدوين رقمي. عندما يتم ملاحظة أليلات مختلفة من نفس الجين ، فإن المصطلحات تسمح بالحرف المرتفع.

تضيف جينات الميتوكوندريا البادئة & ldquomt & rdquo إلى الجين المكون من 3 أو 4 أحرف ، والذي قد يكون أو لا يكون بحروف صغيرة. جميع الجينات المستهدفة للمخدرات محددة ، وليست مائلة.

xyz1 (أليلات مختلفة من نفس الجين)

طن متريLSU (جينات الميتوكوندريا)

DHPS و DHFR (الجينات المستهدفة للدواء)

تتم كتابة جين ذيفان الكوليرا على هيئة ctx ، ويتم كتابة الوحدة الفرعية A من جين ذيفان الكوليرا كـ ctxA.

تتم كتابة تسلسلات الإدراج كـ & ldquoIS & rdquo بالإضافة إلى رقم مائل (IS6110).

أسماء الجينات البشرية كلها أحرف استهلالية ومائلة. قد تكون كلها أحرف لاتينية كبيرة أو مجموعة من الأحرف الكبيرة والأرقام العربية ، من الناحية المثالية لا تزيد عن 6 أحرف. الحرف الأولي هو دائمًا حرف. لا يتم استخدام أحرف منخفضة أو مرتفعة أو أرقام رومانية أو أحرف يونانية.

قد توجد أسماء جينية مماثلة للإنسان والفئران. على سبيل المثال ، يسرد دليل النمط AMA الجينات التالية:

مستضد CD5: Cd5 (الفئران) و CD5 (البشر)

تتوفر قائمة بأسماء الجينات البشرية على http://www.genenames.org/guidelines.html

البروتينات

غالبًا ما تحمل البروتينات ، مجموعات الأحماض الأمينية التي تتكون منها النباتات والحيوانات ، بما في ذلك البشر ، نفس اسم الجين ولكنها ليست مائلة وتبدأ دائمًا بحرف كبير. على سبيل المثال ، 1 من بروتينات السطح الخارجي لـ بوريليا بورجدورفيري يسمى بروتين السطح الخارجي أ. يتم ترميزه بواسطة ospA (الجين) ، والبروتين هو OspA.

غالبًا ما يكون للبروتينات أسماء شائعة (على سبيل المثال ، بيتا جالاكتوزيداز هو المنتج الجيني لـ لاكض).

كيف تفرق بين البروتينات والجينات؟ إذا تم دمج مصطلح مع 1 من الكلمات التالية ، فمن المحتمل أنه يصف الجين:

المروج (على سبيل المثال ، محفز P2 الأساسي [لجين myc]) عبارة عن أجزاء من الجينات ، وليست بروتينات

المنهي ، المشغل ، مواقع المخفف

إذا تم الجمع بين المصطلح وإحدى الكلمات التالية ، فمن المحتمل أنه يصف بروتينًا.

قمع البروتين و mdasha يقمع ، الجين لا & rsquot.

يتفاعل بروتين React & mdasha ، ولا يتفاعل الجين & rsquot

المستويات المرتفعة من ____ [خطأ الاستخدام الشائع هو أن يكتب المؤلفون & ldquoelevated myc & rdquo عندما يقصدون: & ldquoelevated of myc. & rdquo]

مائل MMR هو خطأ شائع آخر في الاستخدام. هذا المصطلح ، الذي يعني & ldquomismatch repair ، & rdquo ليس أبدًا جينًا ، بل مجرد اختصار لعملية. لكنك قد ترى أن الفئران ذات التعديلات المحددة في عدد من جينات MMR قد تم تطويرها & hellip & rdquo

أنزيمات التقييد

يتم تحديد إنزيمات التقييد بتسمية من 3 أحرف للبكتيريا التي تم عزلها منها ، بالإضافة إلى تعيين سلالة من حرف واحد (حسب الحاجة) ورقم روماني يوضح الترتيب الذي تم تحديده به. يجب أن تبدأ تسمية البكتيريا المكونة من 3 أحرف بحرف كبير وأن يتم كتابة باقي اسم الإنزيم بالرومانية.

الفيروسات

استخدام الخط المائل مع أسماء الفيروسات

الفيروس ليس نوعًا ينتمي الفيروس إلى نوع ما. اجعل أنواع الفيروسات وجنسها وعائلتها مائلًا عند استخدامها بالمعنى التصنيفي. ومع ذلك ، لاحظ أنه من الجيد عدم ذكر تصنيف فيروس ، خاصةً فيروس مثل حمى الضنك أو شلل الأطفال المعروف جيدًا.

لا تكتب اسم فيروس بالخط المائل عند استخدامه بشكل عام. إذا قمت بكتابة اسم فيروس بأحرف كبيرة (بخلاف الاسم الذي يحتوي على اسم مناسب بحيث يجب أن تكتبه بأحرف كبيرة) ، فأنت بحاجة إلى جعله مائلاً.

فيروسات kobuvine البقري ، a kobuvirus ، kobuviruses ، لكن كوبوفيروس النيابة.

تأكد وجود فيروس غرب النيل في البعوض والغربان النافقة. (دليل أسلوب AMA ، ص 758).

الانتشار الوبائي لفيروس غرب النيل (WNV) والتطبيق الجوي المنقطر.

الانواع فيروس غرب النيل هو عضو في الجنس فلافيفيروس.

أسرة بونيافيريدي، جنس فيروس وريدي، محيط فيروس حمى الوادي المتصدع

تم لفت الانتباه مؤخرًا إلى فيروس توسكانا (عائلة بونيافيريدي، جنس فيروس الفليب، محيط فيروس حمى ذبابة الرمل نابولي) في البلدان و hellip

استخدم المختصرات مع أسماء الفيروسات

يجوز استخدام اختصار لفيروس (مثل WNV لفيروس غرب النيل) بعد تعريفه. ومع ذلك ، لا تختصر نوعًا ما (بما في ذلك نوع فيروس غرب النيل).باختصار ، إذا كنت تستخدم الحروف المائلة ، فلا تستخدم اختصارًا.

صحيح: فيروس غرب النيل (عائلة WNV فلافيفيريدي، جنس فلافيفيروس) ينتقل إلى الإنسان [هنا ينتقل الفيروس ، وليس اسم النوع ، لذا فإن فيروس غرب النيل من النوع الروماني ويمكن اختصاره].

بالنسبة للفيروسات التي تبدأ بحرف يوناني ، اكتبه وأغلق المسافة بين الحرف وبقية الكلمة.

ل فيروس كورونا البشري، استخدم الاختصار hCoV. اعلم أن هناك جنسًا / نوعًا مسمى فيروس كورونا البشري، والتي يجب أن يتم اختصارها كـ فيروس كورونا، وليس hCoV.

ل فيروسات صدى مرقمة (على سبيل المثال ، echovirus 13) ، استخدم التنسيق التالي: E13 (لا تستخدم EV)

ل فيروس التهاب الكبد E.، استخدم الاسم المستعار HEV.

استخدم حرف H من أجل اختصارات الفيروس البشري (على سبيل المثال ، HMPV ، وليس hMPV) ، ما لم يوجه المؤلف خلاف ذلك أو سابقة (انظر فيروس كورونا البشري أعلاه).

ل الفيروس المعوي البشري، استخدم EV البشري ، وليس HEV. بالنسبة للفيروسات المعوية المرقمة ، استخدم التنسيق التالي: EV75.

بالنسبة لفيروس الأنفلونزا ، راجع قسم منفصل (على سبيل المثال ، بعد فيروس غرب النيل أدناه).

ل الفيروسات، استخدم ما يلي:

KIPyV لفيروسات KI التورامية (المعروفة سابقًا باسم فيروس كارولينسكا التورامي)

MCPyV ، وليس MCV ، لفيروس خلية ميركل التورامي ، و

WUPyV لفيروسات WU التورامية (المعروفة سابقًا باسم فيروس جامعة واشنطن التورامي).

ل فيروس غرب النيل، استعمال WNV.

الانفلونزا

في 18 أكتوبر 2011 ، نشرت منظمة الصحة العالمية مبادئ توجيهية لتوحيد مصطلحات فيروس الجائحة A (H1N1) 2009 (انظر http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/terminology_ah1n1pdm09/en/index.html). تهدف المبادئ التوجيهية إلى تقليل الالتباس والتمييز بين الفيروس الجائح والفيروسات الموسمية القديمة A (H1N1) المنتشرة في البشر قبل جائحة A (H1N1) 2009. بالاتفاق مع إرشادات منظمة الصحة العالمية ، سيستخدم EID التسميات التالية لفيروس الجائحة A (H1N1) 2009:

فيروس الأنفلونزا A (H1N1) pdm09

بعد أول ذكر لاسم الفيروس بالكامل ، بما في ذلك الكلمة & ldquoinfluenza ، & rdquo يكفي استخدام & ldquoA (H1N1) pdm09 & rdquo ، ومع ذلك ، يجب إضافة الكلمة & ldquovirus ، & rdquo & ldquoinfection ، & rdquo أو & ldquooutbreak & rdquo إلى الاسم ، حسب الاقتضاء. إذا ظهر المصطلح بشكل متكرر ، فيمكن استخدام الاختصار & ldquopH1N1 & rdquo.

أمثلة على مصطلحات أخرى لفيروس الأنفلونزا يستخدمها EID:

فيروس أنفلونزا الطيور A (H7N9)

فيروس أنفلونزا الطيور A (H5N1)

كما هو مذكور أعلاه بالنسبة لفيروس الأنفلونزا A (H1N1) pdm09 ، يمكن اختصار أسماء فيروسات الأنفلونزا الأخرى بعد الإشارة الأولى التي تتضمن الكلمة & ldquoinfluenza ، & rdquo ولكن ، حسب الاقتضاء ، يجب إضافة كلمة & ldquovirus ، & rdquo & ldquoinfection ، & rdquo أو & ldquooutbreak & rdquo إلى الاسم. أمثلة: فيروس A (H7N9) ، عدوى A (H7N9) ، تفشي A (H7N9).

يجب أن يكون النوعان الفرعيان H و N دائمًا بين قوسين عندما يتبع & ldquoinfluenza & rdquo:

فيروس الأنفلونزا A (H5N1) (لفيروس الإنفلونزا من النوع الفرعي H5N1 & rdquo)

A (H3N2) v (لـ & ldquovariant الأنفلونزا A (H3N2) & rdquo)

عند استخدامها بمفردها ، لا تحتاج الأنواع الفرعية إلى أقواس ولكن يجب أن تكون مصحوبة بالكلمة & ldquosubtype. & rdquo

أنواع فرعية مختلفة ، مثل H5N1 و hellip

ملحوظة: H5N1 ليس فيروسًا ، ولا مرضًا ، إنه مجرد نوع فرعي من نوع فيروس الأنفلونزا A. إذا كنت ترغب في إسقاط أي شيء لاحقًا في المقالة ، فيمكنك استبعاد تسمية النوع الفرعي. إذا تم دراسة فيروس واحد فقط ، يمكنك القول في الطرق أن فيروس الأنفلونزا يعني فيروس الأنفلونزا A من النوع الفرعي H5N1 ، وترك النوع الفرعي خارجًا من ذلك الحين فصاعدًا.

يمكن أن يكون لفيروس الإنفلونزا (H5N1) إمراضية عالية أو منخفضة. ليس من الزائد تضمين & quothighly pathogenic & quot في العنوان.

للحصول على معلومات حول أسلوب تسمية الفيروسات هذا ، المعتمد من قبل العديد من المنظمات الدولية ، راجع اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات.

بالنسبة لعزلات فيروس الإنفلونزا ، قم بتضمين النوع الفرعي للفيروس ، واكتب كامل المضيف الأصلي (حذف إذا كان بشريًا) ، وقم بتضمين موقع العزل ورقم السلالة ، واستخدم السنة المكونة من 4 أرقام إذا تم عزل الفيروس في عام 2000 أو بعد ذلك. بالنسبة للفيروسات التي تم عزلها خلال القرن العشرين ، استخدم العام المكون من رقمين.

اجعل جنس وأنواع العائل مائلًا في أسماء منفصلة.

تمت مراجعة ونشر التسمية الرسمية لتسمية فيروسات الأنفلونزا من قبل منظمة الصحة العالمية (WHO). (منظمة الصحة العالمية. مراجعة لنظام التسميات لفيروسات الأنفلونزا: مذكرة منظمة الصحة العالمية. Bull.World Health Organ. 198058585 & ndash9). تتضمن التسمية الكاملة والصحيحة نوع الفيروس (A ، B ، أو C) ، مضيف المنشأ (باستثناء الإنسان) ، الموقع الجغرافي للعزل ، رقم السلالة ، سنة العزل (4 أرقام العام للفيروسات تم عزله في عام 2000 أو ما بعده المكون من رقمين للفيروسات المعزولة خلال القرن العشرين) ، والنوع الفرعي (16 نوعًا ممكنًا من H و 9 أنواع فرعية محتملة من N).

وبالتالي ، تم عزل فيروس من النوع A في عام 1995 من بطة مالارد في ممفيس تينيسي برقم سلالة 123 ونوع فرعي H5N1:

الأنفلونزا A / mallard / Memphis / 123/95 (H5N1).

يمكن اختصار الموقع في صورة فيروسات بشرية ، كما هو الحال في ما يلي ، حيث إن العلاقات العامة (بورتوريكو) و FM (فورت مونماوث) معروفة جيدًا ولم يتم كتابتها.

كانت فيروسات الإنفلونزا المستخدمة هي A / PR / 8/34 (H1N1) و A / FM / 1/47 (H1N1) و
A / Thailand / SP-83/2004 (H5N1).

عند الإشارة إلى فيروسات أنفلونزا الطيور ذات القدرة المرضية المنخفضة ، استخدم المصطلح & ldquolow pathogenicity: أنفلونزا الطيور & rdquo & ldquolow ldquolow المسببة للأمراض أنفلونزا الطيور. & rdquo إذا استخدمت 3 مرات أو أكثر ، يمكن اختصار المصطلح إلى LPAI.

عند الإشارة إلى فيروسات أنفلونزا الطيور ذات الإمراضية العالية ، استخدم المصطلح "أنفلونزا الطيور شديدة الإمراض" & rdquo & ldquohigh.


محتويات

الصفات المتشابهة هي أوجه تشابه ناجمة عن سلف مشترك. إنها تختلف عن السمات المماثلة. على سبيل المثال ، تتمتع كل من الطيور والخفافيش بقدرة الطيران ، لكن هذا لا يستخدم لتصنيفها معًا ، لأنها ليست موروثة من سلف مشترك.

على الرغم من جميع الاختلافات الأخرى بينهما ، فإن حقيقة أن الخفافيش والحيتان تغذي صغارها على اللبن هي إحدى السمات المستخدمة لتصنيف كل منهما على أنها من الثدييات ، لأنها موروثة من سلف مشترك.

عندما تم تطوير النظام الحالي لتسمية الكائنات الحية ، كانت اللاتينية هي اللغة الأكثر استخدامًا حول العالم. لذلك ، لا تزال هذه الأسماء باللاتينية. الأوصاف والتشخيصات الرسمية للأصناف الجديدة باللغة اللاتينية كانت مكتوبة ولا تزال مكتوبة باللاتينية. يسمح عالم الحيوان بأي لغة لوصف الحيوانات. اعتبارًا من 1 يناير 2012 ، يمكن وصف أصناف جديدة من الطحالب والفطريات والنباتات باللغة الإنجليزية أو اللاتينية. [2]

غالبًا ما يتم إعطاء الأصناف فوق مستوى الجنس أسماء تستند إلى "جنس النوع" ، مع لاحقة قياسية. تعتمد اللواحق المستخدمة في تكوين هذه الأسماء على المملكة ، وأحيانًا على الشعبة والفئة ، كما هو موضح في الجدول أدناه.


التحقق والتحقق من صحة بواسطة عينات النوع

عادة ما يتطلب تحديد الكائن الدقيق المحدد بواسطة اسم معين أكثر من مجرد قراءة الوصف أو تعريف التصنيف الذي ينطبق عليه الاسم. قد تختلف الأشكال الجديدة ، التي ربما أصبحت معروفة منذ كتابة الوصف ، في الخصائص التي لم يتم النظر فيها في الأصل ، أو قد يكتشف العمال اللاحقون ، من خلال فحص المادة الأصلية ، أن المؤلف الأصلي قد خلط عن غير قصد شكلين أو أكثر. لا يمكن ضمان أن يكون الوصف شاملاً في جميع الأوقات. يتطلب التحقق من استخدام الاسم فحص العينة الأصلية. لذلك يجب تحديده بشكل لا لبس فيه.

في وقت ما ، ربما أخذ المؤلفون أوصافهم من سلسلة من العينات أو جزئيًا (أو حتى كليًا) من أوصاف أو شخصيات مؤلفين آخرين ، كما فعل لينيوس غالبًا. ينبع الكثير من الجدل حول صلاحية أسماء معينة في الاستخدام الحالي ، خاصة تلك التي تعود إلى أواخر القرن الثامن عشر ، من صعوبة تحديد هوية المواد التي استخدمها المؤلفون الأصليون. في الممارسة الحديثة ، يجب تعيين عينة من نوع واحد لاسم نوع جديد أو نوع فرعي. يجب دائمًا وضع النوع في مؤسسة عامة موثوقة ، حيث يمكن الاعتناء به بشكل صحيح وإتاحته لخبراء التصنيف. بالنسبة للعديد من الكائنات الحية الدقيقة ، يتم الاحتفاظ بنوع الثقافات في مؤسسات مؤهلة. ومع ذلك ، فقد تتطور الكائنات الحية الدقيقة بالفعل أثناء التخزين بسبب قصر وقت جيل الكائنات الحية الدقيقة.

يتم تطبيق تسمية معقدة على أنواع مختلفة من عينات النوع. النمط الشامل هو عينة واحدة يحددها الواصف الأصلي للنموذج (نوع أو نوع فرعي فقط) ومتاح لأولئك الذين يرغبون في التحقق من حالة العينات الأخرى. في حالة عدم وجود نمط شامل ، كما هو الحال في كثير من الأحيان ، يتم اختيار النمط الجديد ويتم تحديده من قبل شخص يقوم لاحقًا بمراجعة التصنيف ، ويحتل النمط الجديد موقعًا مكافئًا لهذا النمط الشامل. النوع الأول المعين بشكل صحيح له الأولوية على جميع عينات الأنواع الأخرى. الأنماط المكافئة هي عينات مستخدمة ، جنبًا إلى جنب مع النمط الشامل ، في التعيين الأصلي لشكل جديد ، يجب أن تكون جزءًا من نفس السلسلة (أي ، يتم جمعها في نفس المكان المباشر وفي نفس الوقت) مثل النمط الشامل.

بالنسبة لفئة أعلى من مستوى الأنواع ، يكون النوع تصنيفًا من الرتبة الأدنى التالية. بالنسبة للجنس ، على سبيل المثال ، فهو نوع. من مستوى الجنس إلى مستوى العائلة الفائقة ، توجد قواعد تتعلق بتكوين اسم مجموعة من اسم مجموعة النوع. الجنس وطي (البشر) هو نوع جنس عائلة Hominidae ، على سبيل المثال ، ويمنع الرمز إزالته من عائلة Hominidae طالما يتم التعامل مع Hominidae كعائلة صالحة والاسم وطي صالح من الناحية التصنيفية. ومهما تبقّى من محتوياته ، فالعائلة التي تحتوي على الجنس وطي يجب أن تكون Hominidae.

يعتبر الجمع العشوائي ذا فائدة قليلة اليوم ، ولكن مناطق شاسعة من الأرض لا تزال غير معروفة بيولوجيًا ، على الأقل فيما يتعلق بالعديد من المجموعات ، ولا يزال هناك العديد من المجموعات التي يستبعد العدد الصغير من العينات التي تم جمعها وإعدادها بشكل صحيح أي تحليل تصنيفي شامل . حتى في المجموعات المدروسة جيدًا ، مثل الفقاريات العليا ، غالبًا ما تتطلب الطرق الجديدة لتحليل المواد تجميعًا خاصًا. قد يستلزم تحديد الاختلاف داخل الأنواع أو السكان دراسة المزيد من العينات أكثر مما هو متاح ، حتى عندما (كما هو معتاد) يمكن للمتخصص استخدام مواد من العديد من المؤسسات. عادة ، يتم الجمع لملء الفجوات (في النطاق الجغرافي ، التكوينات الجيولوجية ، أو الفئات التصنيفية) التي تم إبرازها بالفعل من قبل المتخصصين الذين يقومون بمراجعة المواد المتاحة. يعرف جامع الكائنات الحية المطلع جيدًا إلى أين يذهب ، وما الذي تبحث عنه ، وكيفية اكتشاف أي شيء ذي قيمة أو غير عادية بشكل خاص.

تختلف التقنيات الفعلية للجمع والحفظ اختلافًا كبيرًا من مجموعة من الكائنات الحية إلى أخرى - لا يتم جمع أو حفظ أوليات التربة أو الفطريات أو الصنوبر بنفس الطريقة مثل الطيور. يمكن حفظ بعض الحيوانات فقط في كحول ضعيف ، لكن البعض الآخر يتحلل (يتحلل) فيه. بعض ديدان الأرض "المحفوظة" في كحول ضعيف تتدفق ببساطة من جلودها عند رفعها. يتم استخدام طرق خاصة بعد خبرة طويلة للحفاظ على الشخصيات ذات القيمة الخاصة في التصنيف. بعض الطرق تجعل من الصعب ملاحظة العينات ، وهذا ينطبق بشكل خاص على المواد التي يجب تقسيمها أو تحويلها بطريقة أخرى إلى مستحضرات مناسبة للمراقبة المجهرية.

بعد جمع المواد التصنيفية وحفظها ، يمكن أن تفقد قيمتها ما لم يتم تصنيفها بدقة وبشكل كامل. نادرًا ما تكون المواد غير الموسومة أو التي تم تصنيفها بشكل غير كافٍ لأي استخدام. يجب أن يعرف عالم التصنيف عادةً موقع جمع كل عينة (أو الكثير من العينات) ، وغالبًا ما يعرف الموطن (على سبيل المثال ، نوع الغابة ، والمستنقعات ، ونوع مياه البحر) ، والتاريخ ، واسم المجمع ، ورقم الحقل الأصلي تُعطى للعينة أو القطعة. يضاف إلى هذه المعلومات رقم الكتالوج الخاص بالمجموعة والجنس (إذا لم يتم تحديده بالفعل في الحقل وإذا كان ذلك مناسبًا). عادة ما يتم إضافة الهوية العلمية للعينة ، على النحو الذي يحدده متخصص معترف به ، إلى الملصق الموجود في المتحف. كما تم تضمين اسم الأخصائي الذي حدد العينة. قد تؤدي المراجعات اللاحقة للتصنيف والمعرفة الإضافية للكائن الحي إلى تغييرات لاحقة في الاسم العلمي ، ولكن يجب الاحتفاظ بالتسميات الأصلية دون تغيير.

قد تكون هناك حاجة إلى معلومات أخرى. على سبيل المثال ، تختلف الذكور والإناث في بعض مجموعات الحشرات اختلافًا كبيرًا في المظهر ، وقد يتعين تحديد الذكور والإناث من نفس النوع. يعطي القبض على زوج في البرية أثناء الجماع إشارة قوية (ولكن ، بشكل مفاجئ ، ليست مطلقة) على أن الذكر والأنثى ينتميان إلى نفس النوع ، تشير تسميات كل عينة (إذا تم فصلهما) إلى العينة التي بها كان التزاوج.