معلومة

Synteny ، علم الوراثة؟

Synteny ، علم الوراثة؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

هل يمكن لأي شخص أن يشرح مفهوم Synteny المتعلق بعلم الوراثة؟ سوف تساعد الصورة. حاولت قراءة مصدر ويكيبيديا مع ملف PDF آخر

http://gep.wustl.edu/repository/course_materials_WU/annotation/About_Synteny_Analysis.pdf

وأشعر أنه ساعد إلى حد ما فقط. مما أجمعه يتعلق بترتيب الجينات بالنسبة لجيناتها المتماثلة؟ أم موقعهم بشكل عام؟


تحتوي الكتل التركيبية على نفس جينات الترتيب بين كروموسومات الأنواع المختلفة.

يوضح الشكل أعلاه (من اليسار إلى اليمين) كتلة تركيبية مشتركة بين الكروموسوم البشري 17 والكروموسومات المقابلة في ثلاثة ثدييات أخرى (الحصان والخنزير والشمبانزي). وكما هو متوقع ، كلما تميزت الأنواع (مثل الخنازير والحصان) كلما كان ترتيب الجينات أكثر اضطرابًا.

المرجع: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3758187/


ما هو التخليق وكيف نستخدمه في علم الجينوم وعلم الوراثة؟

فيما يتعلق بهذا ، عند مقارنة جينومات الأنواع المختلفة يتم تعريف التخليق على أنه؟

عند مقارنة جينومات الأنواع المختلفة, 'synteny "يتم تعريفه على أنه. نفس الجينات في نفس الترتيب على طول الكروموسوم. مصطلح التغطية ، عند تطبيقها على علم الجينوم، يعني تسلسل نفس الزوج الأساسي عدة مرات. لقد درست للتو 10 فصول دراسية!

قد يتساءل المرء أيضًا ، ما هو الغرض من اختبار synteny؟ هو - هي الاختبارات لمعرفة ما إذا كانت الجينات موجودة على نفس الكروموسوم. فصل الكروماتيدات الشقيقة خلال أي مراحل من دورة الخلية؟ طور الانقسام الخيطي وطور الانقسام الاختزالي الثاني.

وبالتالي ، ما هي الكتلة المخلوية؟

أ كتلة تركيبية عبارة عن مجموعة من الجينات المتجاورة الموجودة على نفس الكروموسوم. عادةً ما يتم توريث السمات التي توفرها هذه الجينات معًا ، وبالتالي تنتهك قانون مندل للتشكيلة المستقلة.

كيف يحدث ازدواجية الجينات؟

الازدواجية الجينية يحدث عندما تكون نسخة إضافية من ملف الجين مصنوع في كائن حي الجينوم. بعض الأحيان، ازدواجية الجينات مفيد للكائن الحي وقد يؤدي في النهاية إلى تطوير نوع جديد. أنواع مختلفة من الكيراتين في الجسم هي نتيجة الازدواجية من واحد الجين.


تسمية الجينات البشرية

الرموز والأسماء

بمجرد تخصيص الجينات للعديد من الكروموسومات ، بدأ ترتيبها على طول الكروموسوم وبدأ بالفعل رسم خرائط الجينات البشرية. أدى نشر أوامر الجينات إلى توليد فكرة رمز الجين ، بالإضافة إلى اسمه. كان هذا الرمز عبارة عن شكل مختصر من الاسم ، ولا يُنسى ويمكن التعرف عليه ، ولكنه قصير بما يكفي ليتم إدراجه في التمثيلات التخطيطية للكروموسومات التي تسمى الخرائط. تتكون هذه الرموز عادةً من حرفين أو ثلاثة أحرف فقط في تركيبة تعكس الاسم ، وربما مع إضافة رقم إذا تم اكتشاف أكثر من جين واحد له وظيفة مماثلة. مثال: ADH1، ADH2 (الجينات التي ترمز لأشكال مختلفة من الإنزيم ، نازعة هيدروجين الكحول).

من الواضح أن رمز الجين وحده ليس له معنى جوهري ، فهو له معنى فقط فيما يتعلق بالاسم الأطول والأكثر وصفيًا. في حين أن الاسم قد يتنوع بشكل كبير ولا يزال يحتفظ بنفس المعنى (الأميليز واللعاب و الأميليز اللعابي من الواضح أن لها نفس المعنى) ، يجب أن تكون مجموعات الأحرف والأرقام المحدودة للرمز القصير ثابتة لتجنب الغموض. تم التعرف على أهمية رمز التعريف الفريد في السنوات الأولى لرسم خرائط الجينات ، وتم تشكيل لجنة التسمية للإشراف على تخصيص الرموز المناسبة للاستخدام في الخرائط ووضع مبادئ توجيهية لضمان أكبر قدر ممكن من الاتساق. كانت المبادئ التوجيهية عرضة للعديد من التأثيرات التي تضمنت الممارسة المتبعة ، من أجل تجنب الالتباس من خلال العديد من التغييرات في الرموز ، والحاجة إلى تقليل الغموض ، مع التفرد كأهم معايير أخرى توصيات أبسط مثل تجنب الأرقام الرومانية والأكثر بعد نظر تهدف إلى زيادة إمكانية الوصول و "إمكانية البحث" من خلال التوصية بأنظمة هرمية لبناء الرموز. تأثرت المبادئ التوجيهية أيضًا بالقيود المفروضة على التخزين الإلكتروني المبكر والاتصالات ، مثل إلغاء الأحرف اليونانية التي لا يمكن تمثيلها بسهولة في قواعد البيانات الإلكترونية ، والقيود المفروضة على استخدام علامات الترقيم لتسهيل البحث.


يحل التخليق المحفوظ بعمق الأحداث المبكرة في تطور الفقاريات

على الرغم من الاعتقاد السائد بأن التطور المبكر للفقاريات قد تم تشكيله من خلال ازدواج الجينوم الكامل القديم ، إلا أن عدد وتوقيت وآلية هذه الأحداث لا يزال بعيد المنال. هنا ، نستنتج تاريخ الفقاريات من خلال المقارنات الجينومية مع تسلسل جديد على نطاق كروموسوم من الأمفيوكسوس الحبلي اللافقاري. نوضح كيف يتم اشتقاق الأنماط النووية للسُّهيمات والفقاريات المتنوعة من 17 مجموعة ربط حبلي أسلاف (و 19 مجموعة أسلاف ثنائية) عن طريق الاندماج وإعادة الترتيب والازدواجية. لقد حللنا نسختين قديمتين مختلفتين من الازدواجية بناءً على أنماط التركيب الكروموسومي المحفوظ. تشترك جميع الفقاريات الموجودة في الازدواجية الأولى ، والتي حدثت في منتصف / أواخر العصر الكمبري عن طريق الاستبدال الذاتي (أي مضاعفة الجينوم المباشر). في المقابل ، تم العثور على الازدواجية الثانية فقط في الفقاريات الفكية وحدثت في منتصف أواخر Ordovician عن طريق التباين (أي ، ازدواج الجينوم بعد التهجين بين الأنواع) من اثنين من السلالات المنقرضة الآن. هذا التاريخ الجينومي المعقد يوازي تنوع سلالات الفقاريات في السجل الأحفوري.

بيان تضارب المصالح

د. عضو في المجلس الاستشاري العلمي لعلم الجينوم المتوافق. R.E.G. هو مؤسس Dovetail Genomics. N.H.P. موظف في شركة Dovetail Genomics. DSR ، R.E.G. و N.H.P. جميعهم مساهمون في شركة Dovetail Genomics. يعلن المؤلفون الآخرون عدم وجود مصالح متنافسة.

الأرقام

الشكل 1. المواد المخلقة المحفوظة بين السُّهيمات و ...

التين. 1. المخلوقات المحفوظة بين السُّهيمات والأنواع المختلفة.

الشكل 2. مساهمات 17 أسلاف ...

التين. 2. مساهمات الـ 17 CLGs الموروثة للأجداد في جينومات الفقاريات المعاصرة.

الشكل 3. تنظيم الكروموسومات العظمية للفقاريات ...

الشكل 3. تنظيم كروموسومات الفقاريات العظمية بعد 2R.

غالبية CLGs لديها أربعة ...

الشكل 4. الازدواج والاندماج والاختلاط في ...

الشكل 4. الازدواجية والاندماج والاختلاط في الفقاريات العظمية.

التين. 5. سيناريو Auto- ثم allotetetraploidy لـ ...

5. سيناريو تباين الصبغيات الذاتي لتطور الفقاريات.

رسم تخطيطي لـ auto- ثم allotetraploidy ...

بيانات موسعة الشكل 1. الكروماتين والجيني ...

الشكل 1. البيانات الموسعة. الخرائط الجينية والكروماتين للجينوم السماوي.

بيانات موسعة الشكل 2. تظهر المخططات النقطية المحفوظة ...

بيانات موسعة الشكل 2. تظهر المخططات النقطية التراكيب المحفوظة بين السُّهيمات والإنسان والضفدع.

الشكل 3. بيانات موسعة. تظهر المخططات النقطية ...

بيانات موسعة الشكل 3. تظهر المخططات النقطية التراكيب المحفوظة بين لامبري والسُّهيمات.

الشكل 4. بيانات موسعة. توضح المخططات النقطية ...

بيانات موسعة الشكل 4. تظهر المخططات النقطية التراكيب المحفوظة بين السُّهيمات واللافقاريات المختارة.

بيانات موسعة الشكل 5. أخصائيو تقويم العظام المرقط الدجاج ...

بيانات موسعة الشكل 5. أخصائيو تقويم العظام ومعاوني الثوم المرقط الدجاج.

"نقطة أكسفورد بين الدجاج (جالوس جالوس ، ...

تمديد البيانات الشكل 6. شبكة أكسفورد بين ...

الشكل 6. شبكة أكسفورد بين كروموسومات الفقاريات العظمية ومجموعات الارتباط الحبلي (CLGs).

بيانات موسعة الشكل 7. تظهر شبكة أكسفورد ...

بيانات موسعة الشكل 7. تظهر شبكة أكسفورد الارتباطات بين 50 قطعة جينية للفقاريات العظمية ...

بيانات موسعة الشكل 8. شبكة أكسفورد بين ...

الشكل 8. شبكة أكسفورد بين كروموسومات السلالة الجرثومية لجزيرة البحر ومجموعات الارتباط الحبلي ...


خريطة جينية توافقية تستند إلى SNP لاستهداف السمات القائمة على التركيب في الفول (Vicia faba L.)

الفول Faba (Vicia faba L.) هو بقول مهم عالميًا لتثبيت النيتروجين ، ويزرع على نطاق واسع في مجموعة متنوعة من البيئات. في هذا العمل ، قمنا بالتعدين والتحقق من صحة مجموعة من 845 SNPs من النسخ المحاذية لخطين داخليين متناقضين. يتم تخصيص كل من V. faba SNP من خلال تحليل BLAST إلى أخصائي تقويم العظام في ميديكاغو. تم بعد ذلك التحقق من صحة هذه المجموعة من الأشكال متعددة الأشكال المثبتة بشكل اصطناعي كمقايسات KASP فردية ، مصنفة وفقًا لمعلوماتها وأدائها على لوحة مكونة من 37 سلالة فطرية ، وأفضل 757 علامة أداء مستخدمة في التركيب الجيني لستة مجموعات رسم خرائط. تم دمج خرائط الربط الست الناتجة في خريطة إجماع واحدة حيث تم وضع 687 SNPs على ست مجموعات ربط ، يفترض أن تتوافق كل منها مع أحد كروموسومات V. faba الست. تم استخدام خريطة الإجماع القائمة على التسلسل لاستكشاف التركيب مع أنواع المحاصيل الأكثر ارتباطًا ، والعدس ، والجينوم الأكثر ارتباطًا بالتسلسل الكامل ، ميديكاغو. تم العثور على مساحات كبيرة من العلاقة الخطية غير المنقطعة بين فاصوليا وميديكاغو ، مما يجعل من السهل نسبيًا التنبؤ بمحتوى الجين والترتيب في الفاصل الجيني المعين. كدليل على ذلك ، قمنا بتعيين جين لون الزهرة إلى فاصل 2 سم من كروموسوم Vf 2 والذي كان شديد الخطية مع Mt3. كان الجين المرشح الواضح من 78 نموذجًا جينيًا في مقطع كروموسوم Medicago الخطي هو الجين MtWD40-1 الذي تم وصفه سابقًا والذي يتحكم في إنتاج الأنثوسيانين في Medicago وأظهر إعادة ترتيب تقويم العظام VF حذفًا مسببًا مفترضًا لنهاية الجين بالكامل 5 '.

الكلمات الدالة: التنميط الجيني KASP الفول البقوليات أحادية النيوكليوتيدات تعدد الأشكال التركيبي.

© 2015 المؤلفون. مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية الصادرة عن جمعية البيولوجيا التجريبية وجمعية علماء الأحياء التطبيقية وشركة John Wiley & Sons Ltd.


ينشئ العلماء برنامجًا يجد الكتل المخلقة في حيوانات مختلفة

الائتمان: ديمتري ليسوفسكي ، ITMO.NEWS

تتضمن الجينات الحديثة العمل بكميات هائلة من البيانات التي لا يمكن معالجتها دون مساعدة الخوارزميات الرياضية المعقدة. لهذا السبب ، فإن مهمة تطوير برامج معالجة خاصة لا تقل أهمية بالنسبة لمتخصصي المعلوماتية الحيوية عن مهمة التسلسل الجيني لحيوانات معينة. طور فريق دولي من العلماء ، شمل باحثين من جامعة ITMO ، أداة برمجية تجعل من الممكن العثور بسرعة وفعالية على أجزاء متشابهة في جينومات الحيوانات المختلفة ، وهو أمر ضروري لفهم مدى الارتباط الوثيق بين نوعين ، ومدى وجودهما. تطورت من سلفهم المشترك. تم نشر البحث في GigaScience.

هناك الملايين من الأنواع البيولوجية على كوكب الأرض ، وهذا التنوع قائم على المستوى الجيني. يتم تحديد تشريح الحيوانات وحجمها وأنماط ألوانها وعاداتها من خلال جيناتها. ومرة أخرى ، فإن تنوع الجينات نفسها ليس بهذه الروعة: بحلول اليوم ، حدد العلماء فقط ما يزيد عن 20000. لذلك ، تختلف الأنواع ليس فقط في مجموعات الجينات التي لديها ولكن أيضًا في كيفية ترتيب جيناتها. في لغة علم الجينوم المقارن ، يسمى هذا التركيب ، أي ترتيب الجينات والعناصر التنظيمية.

تقول كسينيا كراشينينيكوفا ، باحثة ومهندسة في جامعة ITMO: "لنأخذ غوريلا وشمبانزي كمثال". "هذان النوعان لهما نفس مجموعة الجينات ، لكن عناصرهما التنظيمية وطفرات الجينوم تخلقان ترتيبًا مختلفًا قليلاً مما ينتج عنه اختلافات بين هذه الرئيسيات."

لذلك ، لأغراض فهم مدى قرب نوعين من وجهة النظر التطورية ، يحتاج العلماء إلى معرفة ليس فقط جيناتهم ولكن أيضًا كيفية ترتيبها في كروموسوم ، وعدد أجزاء الجينوم الشائعة ، أو الكتل التركيبية ، كما يسميها علماء الوراثة ، يوجد. ثم مرة أخرى ، يعد البحث عنها يدويًا أمرًا مستحيلًا: فكمية البيانات كبيرة جدًا. تتكون جينومات الثدييات من ملايين ومليارات من أزواج القواعد ، مما يجعل المعالجة بدون تقنيات البيانات الضخمة أقرب إلى المستحيل. لهذا السبب ، ينشئ العلماء برامج خاصة بهم تجعل من الممكن حل هذه الفئة الجديدة من المهام التي ظهرت في سياق تطور هذا العلم. وهذا ما فعله فريق البحث الذي ضم علماء من مختبر التنوع الجينومي التابع لـ ITMO.

تم تسمية الأداة البرمجية الجديدة halSynteny. وفقًا لمؤلفيه ، يمكنه البحث عن الكتل التركيبية بشكل أفضل وأسرع من البرامج الأخرى المطورة لهذا الغرض. علاوة على ذلك ، تعمل HalSynteny مع البيانات بتنسيقين قياسيين وموثقين جيدًا.

يقول كسينيا ، وهو المؤلف الأول لهذا البحث: "كان هدفنا إنشاء خوارزمية يمكن تطبيقها بسهولة على البيانات التي يمكن الوصول إليها". "تستند بعض مناهج تحديد التسلسلات التركيبية إلى التعليق التوضيحي للجينات مسبقًا ، فإن طريقتنا مختلفة. لا نستخدم أي تعليق توضيحي إضافي. نستخدم طريقة المحاذاة ، عندما تتم محاذاة أجزاء مختلفة من جينوم واحد حسب درجة التشابه مع أجزاء من جينوم آخر. وبهذه الطريقة ، يمكننا تحديد الأجزاء المتجانسة ، الأجزاء التي هي من نفس الأصل. "

يتيح البرنامج تسريع العمليات الحسابية بأكثر من مرتين مقارنة بـ SatsumaSynteny2 ، وهي أداة شائعة أخرى. تم تحقيق هذه الكفاءة العالية من خلال تنفيذ خوارزمية فعالة رياضيا باستخدام C ++.

تم اختبار الطريقة والأداة البرمجية المقترحة من خلال مقارنة جينومات القطط والكلاب.

يقول كسينيا ، "لقد أظهرنا أن أجزاء كبيرة من كروموسومات القطط وبعض أجزاء كروموسومات الكلاب تتحد في كتل تركيبية ، مما يعني أنها تطورت من كروموسومات مماثلة لسلف مشترك. ويمكن استخدام هذا كأساس للتوصل إلى استنتاجات حول عمليتهم التطورية. أظهرت الأبحاث السابقة في مجال البيولوجيا "الرطبة" أن جينوم القطط تغير بشكل أقل من جينوم سلفهم المشترك مقارنةً بالكلاب. ويمكن ملاحظة ذلك بالمقارنة مع الأنواع الأخرى التي ليست جزءًا من ترتيب آكلات اللحوم. النتائج التي حصلنا عليها تؤكد هذه الاستنتاجات وتجعلها أكثر دقة. وهذا يعني أنه في جزء معين ، يتشابه جينوم القط والأنواع المأخوذة للمقارنة ، وفي الكلاب ، يتم إعادة ترتيبها ".

في المستقبل ، سيتم استخدام هذه الخوارزمية في أبحاث أخرى في مجال الجينوميات المقارنة التي تجري في جامعة ITMO.


النتائج

وقت الاختلاف:

لتقدير وقت تباعد سلالات lepidopteran ، قمنا بحساب ساعة جزيئية باستخدام شجرة بناءً على تعيينات تصنيفية راسخة وتسلسل الحمض النووي لبروتينين محفوظين للغاية (الشكل 1). الوقت المقدر للتباعد بين ب. موري و H. melpomene كانت السلالات 103 ± 8.6 MY ، بناءً على عمر تقديري قدره 190 سنة للاختلاف Lepidoptera-Diptera.

يستخدم علم السلالات لتقدير وقت الاختلاف بينهما ب. موري و H. melpomene. يشير الخط المتقطع إلى العمر التقريبي للتباعد بين هذه السلالات (∼103 MY). تشير الأسهم إلى العقد المقيدة (انظر المواد والأساليب). تشير الأرقام الموجودة في الدوائر إلى العدد الفردي للكروموسومات لـ ب. موري, H. melpomene، والأصناف القاعدية.

يستخدم علم التطور النسوي لتقدير وقت الاختلاف بينهما ب. موري و H. melpomene. يشير الخط المتقطع إلى العمر التقريبي للتباعد بين هذه السلالات (∼103 MY). تشير الأسهم إلى العقد المقيدة (انظر المواد والأساليب). تشير الأرقام الموجودة في الدوائر إلى العدد الفردي للكروموسومات لـ ب. موري, H. melpomene، والأصناف القاعدية.

تحليل الارتباط:

في المجموع ، تم تعيين 64 علامة مشتقة من (كدنا) H. melpomene مجموعات الربط في هذه الدراسة. من بين هذه العلامات ، تم تعيين 8 إلى LGs على أساس تعدد الأشكال المرئي في الطول من indels ، وتم تعيين 56 علامة أخرى لـ LGs على أساس تسجيل النمط الجيني من هضم التقييد في SNPs (الجدول 1 والجدول التكميلي 1 في http: / /www.genetics.org/supplemental/). تشابه تسلسل عالٍ للمنتجات المضخمة لتسلسلات إجماع EST و ب. موري دعم تسلسل الترميز فرضيتنا في علم تقويم العظام.

تم تعيين المواقع المحفوظة بتنسيق H. melpomene وتقويم العظام فيها ب. موري

اسم العلامة. اختصار . H. melpomene مجموعة الربط. انضمام GenBank لا. . ب. موري مجموعة الربط أ . انضمام GenBank لا. .
Alanyl-tRNA synthetase آاتس علاء1 EF207962 4 M55993
دوبا ديكاربوكسيلاز بDDC1 AY437802 4 AF372836
بروتين الريبوسوم L3 بRpL31 EE743523 4 AB024901
بلا أجنحة جWg1 AY745485 4 D14169
بروتين الريبوسوم L6 RpL62 EF207960 16 AY769273
بروتين الريبوسوم P2 RpP22 EF207959 16 AY769269
الجلوتاثيون س-ناقل ضريبة السلع والخدمات3 EF207961 6 AJ006502
بروتين الريبوسوم L15 دRpL153 DN172764 6 AY769285
مانوز - فوسفات أيزوميراز جMPI3 AY332460
بروتين الريبوسوم S6 RpS64 EF207950 21 AY769320
بروتين الريبوسوم S15 RpS154 EF207951 21 AY706957
بروتين الريبوسوم S17 RpS174 EF207952 21 AY769333
بروتين الريبوسوم L11 بRpL115 CO729501 3 AY769280
بروتين الريبوسوم L13A RpL13A5 EF207949 3 AY769283
منتج الجين المرتبط بالإنزيم المحفز بالـ Ecdysteroid تعصب6 EF207953 9 AB026110
بروتين الريبوسوم S14 دRpS146 CX700812 9 AY706956
محفور م7 AY745328 2 M64335
مستتر جInv7 DQ445457 2 M64336
بروتين الريبوسوم S21 روبية 217 DN172654 ، CX700448 2 AY578154
بروتين الريبوسوم S28 روبية 287 EF452418 2 AY583363
بروتين الريبوسوم L14 RpL147 EF207954 11 AY769284
بروتين الريبوسوم L18 RpL187 EF207955 ، EF211970 11 AY769287
الريبوسوم Sop2 Sop27 DT663968 ، EF211973 11 AY763110
أقل البعيدة جدلل7 DQ445415
الجين البروتيني للتحكم في نقطة التفتيش الانقسامية (bub3) بوب 37 CX700513
بروتين بولي كومب سو (ض) 12 سو (ض) 127 DT662097
بروتين الريبوسوم S25 25 روبية8 EF207956 25 AY769340
chiB (سلائف الكيتيناز) الفصل9 CX700556 ، EF211966 7 AF052914
متماثل مثبط الريبونوكليز L RLI9 EF207958 7 AB164193
بروتين الريبوسوم S27 RpS279 EF207957 7 AY769342
الوحدة الفرعية التنظيمية للكينازات المعتمدة على Cyclin سيكس9 سي اكس 700558
عامل الاستطالة 1α بEf1a10 AY747994 5 D13338
عامل الاستطالة 1δ Ef1d10 سي اكس 700886 5 AB046366
مرمم بPtc10 AY745373 5 AADK01000387
بروتين الريبوسوم L13 دRpL1310 CO729603 5 AY769282
بروتين الريبوسوم L19 بRpL1910 سي اكس 700796 5 AY769289
بروتين الريبوسوم S11 دRpS1110 سي اكس 700450 ص AY706955
Opsin1 بOPS111 AF126751 15 AB047924
بروتين الريبوسوم L5 بRpL511 CO729889 15 AY769272
بروتين الريبوسوم L7A RpL7A11 EF207963 15 AY769275
بروتين الريبوسوم L10A بRpL10A11 CO729740 15 AY769279
بروتين الريبوسوم P0 بRpP011 CO729821 15 AJ457827
بروتين الريبوسوم S5 بRpS511 CO729660 15 AY769319
بروتين الريبوسوم S8 بRpS811 CX700851 15 AY769322
بروتين الريبوسوم L8 RpL811 EF207977 ، EF211969
بروتين الريبوسوم L30 د30 روبية11 CO729949
البروتين الغني بالجليسين جي ار بي12 EF207964 ، EF211967 8 AB197877
بيتا توبولين Btub12 EF207965 ، EF211964 20 AB003287
بروتين الريبوسوم S7 RpS712 EF207966 20 AY769321
بروتين الريبوسوم S20 20 روبية12 CX700684 20 AY769336
إينولاس إينو12 EF207979
بروتين الريبوسوم L7 دRpL712 سي اكس 700625
بروتين الريبوسوم L27 RpL2712 EF207978
بروتين الريبوسوم S12 دروبية 1212 CX700631
بروتين الريبوسوم S16 RpS1613 EF207967 14 AY769332
كالريتيكولين اتفاقية حقوق الطفل13 EF207968 22 AB090887
بروتين بشرة (EDG84A homolog) EDG84A13 CO729743 22 AB017550
PCNA PCNA13 CV526328 22 AB002264 ، AB002265
بروتين الريبوسوم L37 RpL3713 DN172717 22 AY769308
بروتين الريبوسوم S4 RpS413 CO729938
قرمزي بالخامس13 AY691422
بروتين الريبوسوم L12 RpL1214 EF207969 19 AY769281
عامل استطالة الترجمة حقيقية النواة 2 eEF214 سي اكس 700527
بروتين الريبوسوم S9 جRpS914 CX700565
بروتين الريبوسوم L22 جRpL2215 CX700470 17 AY769291
بروتين الريبوسوم P40 جRpP4015 سي اكس 700776 17 AB062685
بروتين الريبوسوم S24 RpS2415 EF207970 ، EF211972 17 AY578155
عامل بدء حقيقيات النوى 3 ب eiF3B15 EF207980
صندوق رأس الشوكة J1 جفوكس15 CR974474
راب جيرانيغيرانيل ترانسفيراز ججيرترا15 CR974474
عامل الاستطالة 1γ Ef1g16 EF207971 18 AB046361
بروتين هيت شوك hsp21.4 Hsp21.417 EF207972 13 AB195972
بروتين ليم Mlp17 DT663321 13 AY461436
بروتين الريبوسوم L21 RpL2117 CO729978 13 AY769290
بروتين الريبوسوم L31 جRpL3117 CX700740 13 AY769301
ترجمة ADP / ATP ANT17 EF207974 ، EF211962 24 AY227000
بروتين الريبوسوم L32 RpL3217 EF207973 24 AB048205
Sui1 Sui117 CO729706 ، EF211974 24 AY426343
بروتين الريبوسوم L27a RpL27a17 EF207981
بروتين الريبوسوم S10 RpS1017 EF207982
صدفي جاس دي17 DQ674429
بي ام 44 بي ام 4418 DT664299 23 AB158647
مثبط لبروتين موت الخلايا المبرمج الشراء داخل التطبيق18 CV526245 ، EF211968 23 AF281073
بروتين الريبوسوم S30 30 روبية18 سي اكس 700724 23 AY769346
Cubitus interruptus بci18 AY429297 يو AF529422
90 كيلو دالتون بروتين الصدمة الحرارية 90 ساعة18 CO729719 ، EF211960 يو AB060275
ألفا توبولين أتوب18 EF207983 ، EF211963
ا-جليكوزيل ترانسفيراز دOgt18 CV526007
مشلول بموانئ دبي19 AY747899 12 BAAB01102755
بروتين يحتوي على المجال J JDP19 DT662955 12 AF176014
بروتين الريبوسوم L9 RpL919 EF207975 12 AY769277
بروتين عضلي 20 النائب 2019 CO729543
طليعة إنزيم منشط للبروبينول أوكسيديز PPAE19 CO729777
بروتين الريبوسوم L44 جRpL4419 CX700847
كاسباس -1 كاسباس20 EF207976 ، EF211965 10 AF448494
بروتين رابط لهرمون الأحداث العصاري الخلوي جهبة20 DT661817 10 AF098303
أكتين 1 يمثل20 EF207985 ، EF211961
الكالسيوم ATPase قبعة20 CO729824
بروتين الريبوسوم L23A RpL23A20 EF207984 ، EF211971
من غير إمتدادات بملائم21 (ض) AY747887 1 (ض) AB024903
ترايوز-فوسفات أيزوميراز بTPI21 (ض) AY548151 1 (ض) AY734490
اسم العلامة. اختصار . H. melpomene مجموعة الربط. انضمام GenBank لا. . ب. موري مجموعة الربط أ . انضمام GenBank لا. .
Alanyl-tRNA synthetase آاتس علاء1 EF207962 4 M55993
دوبا ديكاربوكسيلاز بDDC1 AY437802 4 AF372836
بروتين الريبوسوم L3 بRpL31 EE743523 4 AB024901
بلا أجنحة جWg1 AY745485 4 D14169
بروتين الريبوسوم L6 RpL62 EF207960 16 AY769273
بروتين الريبوسوم P2 RpP22 EF207959 16 AY769269
الجلوتاثيون س-ناقل ضريبة السلع والخدمات3 EF207961 6 AJ006502
بروتين الريبوسوم L15 دRpL153 DN172764 6 AY769285
مانوز - فوسفات أيزوميراز جMPI3 AY332460
بروتين الريبوسوم S6 RpS64 EF207950 21 AY769320
بروتين الريبوسوم S15 RpS154 EF207951 21 AY706957
بروتين الريبوسوم S17 RpS174 EF207952 21 AY769333
بروتين الريبوسوم L11 بRpL115 CO729501 3 AY769280
بروتين الريبوسوم L13A RpL13A5 EF207949 3 AY769283
منتج الجين المرتبط بالإنزيم المحفز بالـ Ecdysteroid تعصب6 EF207953 9 AB026110
بروتين الريبوسوم S14 دRpS146 CX700812 9 AY706956
محفور م7 AY745328 2 M64335
مستتر جInv7 DQ445457 2 M64336
بروتين الريبوسوم S21 روبية 217 DN172654 ، CX700448 2 AY578154
بروتين الريبوسوم S28 روبية 287 EF452418 2 AY583363
بروتين الريبوسوم L14 RpL147 EF207954 11 AY769284
بروتين الريبوسوم L18 RpL187 EF207955 ، EF211970 11 AY769287
الريبوسوم Sop2 Sop27 DT663968 ، EF211973 11 AY763110
أقل البعيدة جدلل7 DQ445415
الجين البروتيني للتحكم في نقطة التفتيش الانقسامية (bub3) بوب 37 CX700513
بروتين بولي كومب سو (ض) 12 سو (ض) 127 DT662097
بروتين الريبوسوم S25 25 روبية8 EF207956 25 AY769340
chiB (سلائف الكيتيناز) الفصل9 CX700556 ، EF211966 7 AF052914
متماثل مثبط الريبونوكليز L RLI9 EF207958 7 AB164193
بروتين الريبوسوم S27 RpS279 EF207957 7 AY769342
الوحدة الفرعية التنظيمية للكينازات المعتمدة على Cyclin سيكس9 سي اكس 700558
عامل الاستطالة 1α بEf1a10 AY747994 5 D13338
عامل الاستطالة 1δ Ef1d10 سي اكس 700886 5 AB046366
مرمم بPtc10 AY745373 5 AADK01000387
بروتين الريبوسوم L13 دRpL1310 CO729603 5 AY769282
بروتين الريبوسوم L19 بRpL1910 سي اكس 700796 5 AY769289
بروتين الريبوسوم S11 دRpS1110 سي اكس 700450 ص AY706955
Opsin1 بOPS111 AF126751 15 AB047924
بروتين الريبوسوم L5 بRpL511 CO729889 15 AY769272
بروتين الريبوسوم L7A RpL7A11 EF207963 15 AY769275
بروتين الريبوسوم L10A بRpL10A11 CO729740 15 AY769279
بروتين الريبوسوم P0 بRpP011 CO729821 15 AJ457827
بروتين الريبوسوم S5 بRpS511 CO729660 15 AY769319
بروتين الريبوسوم S8 بروبية 811 CX700851 15 AY769322
بروتين الريبوسوم L8 RpL811 EF207977 ، EF211969
بروتين الريبوسوم L30 د30 روبية11 CO729949
البروتين الغني بالجليسين جي ار بي12 EF207964 ، EF211967 8 AB197877
بيتا توبولين Btub12 EF207965 ، EF211964 20 AB003287
بروتين الريبوسوم S7 RpS712 EF207966 20 AY769321
بروتين الريبوسوم S20 20 روبية12 CX700684 20 AY769336
إينولاس إينو12 EF207979
بروتين الريبوسوم L7 دRpL712 سي اكس 700625
بروتين الريبوسوم L27 RpL2712 EF207978
بروتين الريبوسوم S12 دروبية 1212 CX700631
بروتين الريبوسوم S16 روبية 1613 EF207967 14 AY769332
كالريتيكولين اتفاقية حقوق الطفل13 EF207968 22 AB090887
بروتين بشرة (EDG84A homolog) EDG84A13 CO729743 22 AB017550
PCNA PCNA13 CV526328 22 AB002264 ، AB002265
بروتين الريبوسوم L37 RpL3713 DN172717 22 AY769308
بروتين الريبوسوم S4 RpS413 CO729938
قرمزي بالخامس13 AY691422
بروتين الريبوسوم L12 RpL1214 EF207969 19 AY769281
عامل استطالة الترجمة حقيقية النواة 2 eEF214 سي اكس 700527
بروتين الريبوسوم S9 جRpS914 CX700565
بروتين الريبوسوم L22 جRpL2215 CX700470 17 AY769291
بروتين الريبوسوم P40 جRpP4015 سي اكس 700776 17 AB062685
بروتين الريبوسوم S24 RpS2415 EF207970 ، EF211972 17 AY578155
عامل بدء حقيقيات النوى 3 ب eiF3B15 EF207980
صندوق رأس الشوكة J1 جفوكس15 CR974474
راب جيرانيغيرانيل ترانسفيراز ججيرترا15 CR974474
عامل الاستطالة 1γ Ef1g16 EF207971 18 AB046361
بروتين هيت شوك hsp21.4 Hsp21.417 EF207972 13 AB195972
بروتين ليم Mlp17 DT663321 13 AY461436
بروتين الريبوسوم L21 RpL2117 CO729978 13 AY769290
بروتين الريبوسوم L31 جRpL3117 CX700740 13 AY769301
ترجمة ADP / ATP ANT17 EF207974 ، EF211962 24 AY227000
بروتين الريبوسوم L32 RpL3217 EF207973 24 AB048205
Sui1 Sui117 CO729706 ، EF211974 24 AY426343
بروتين الريبوسوم L27a RpL27a17 EF207981
بروتين الريبوسوم S10 RpS1017 EF207982
صدفي جاس دي17 DQ674429
بي ام 44 بي ام 4418 DT664299 23 AB158647
مثبط لبروتين موت الخلايا المبرمج الشراء داخل التطبيق18 CV526245 ، EF211968 23 AF281073
بروتين الريبوسوم S30 30 روبية18 سي اكس 700724 23 AY769346
Cubitus interruptus بci18 AY429297 يو AF529422
90 كيلو دالتون بروتين الصدمة الحرارية 90 ساعة18 CO729719 ، EF211960 يو AB060275
ألفا توبولين أتوب18 EF207983 ، EF211963
ا-جليكوزيل ترانسفيراز دOgt18 CV526007
مشلول بموانئ دبي19 AY747899 12 BAAB01102755
بروتين يحتوي على المجال J JDP19 DT662955 12 AF176014
بروتين الريبوسوم L9 RpL919 EF207975 12 AY769277
بروتين عضلي 20 النائب 2019 CO729543
طليعة إنزيم منشط للبروبينول أوكسيديز PPAE19 CO729777
بروتين الريبوسوم L44 جRpL4419 CX700847
كاسباس -1 كاسباس20 EF207976 ، EF211965 10 AF448494
بروتين رابط لهرمون الأحداث العصاري الخلوي جهبة20 DT661817 10 AF098303
أكتين 1 يمثل20 EF207985 ، EF211961
الكالسيوم ATPase قبعة20 CO729824
بروتين الريبوسوم L23A RpL23A20 EF207984 ، EF211971
من غير إمتدادات بملائم21 (ض) AY747887 1 (ض) AB024903
ترايوز-فوسفات أيزوميراز بTPI21 (ض) AY548151 1 (ض) AY734490

تم تعيين المواقع المحفوظة بتنسيق H. melpomene وتقويم العظام فيها ب. موري

اسم العلامة. اختصار . H. melpomene مجموعة الربط. انضمام GenBank لا. . ب. موري مجموعة الربط أ . انضمام GenBank لا. .
Alanyl-tRNA synthetase آاتس علاء1 EF207962 4 M55993
دوبا ديكاربوكسيلاز بDDC1 AY437802 4 AF372836
بروتين الريبوسوم L3 بRpL31 EE743523 4 AB024901
بلا أجنحة جWg1 AY745485 4 D14169
بروتين الريبوسوم L6 RpL62 EF207960 16 AY769273
بروتين الريبوسوم P2 RpP22 EF207959 16 AY769269
الجلوتاثيون س-ناقل ضريبة السلع والخدمات3 EF207961 6 AJ006502
بروتين الريبوسوم L15 دRpL153 DN172764 6 AY769285
مانوز - فوسفات أيزوميراز جMPI3 AY332460
بروتين الريبوسوم S6 RpS64 EF207950 21 AY769320
بروتين الريبوسوم S15 RpS154 EF207951 21 AY706957
بروتين الريبوسوم S17 RpS174 EF207952 21 AY769333
بروتين الريبوسوم L11 بRpL115 CO729501 3 AY769280
بروتين الريبوسوم L13A RpL13A5 EF207949 3 AY769283
منتج الجين المرتبط بالإنزيم المحفز بالـ Ecdysteroid تعصب6 EF207953 9 AB026110
بروتين الريبوسوم S14 دRpS146 CX700812 9 AY706956
محفور م7 AY745328 2 M64335
مستتر جInv7 DQ445457 2 M64336
بروتين الريبوسوم S21 روبية 217 DN172654 ، CX700448 2 AY578154
بروتين الريبوسوم S28 روبية 287 EF452418 2 AY583363
بروتين الريبوسوم L14 RpL147 EF207954 11 AY769284
بروتين الريبوسوم L18 RpL187 EF207955 ، EF211970 11 AY769287
الريبوسوم Sop2 Sop27 DT663968 ، EF211973 11 AY763110
أقل البعيدة جدلل7 DQ445415
الجين البروتيني للتحكم في نقطة التفتيش الانقسامية (bub3) بوب 37 CX700513
بروتين بولي كومب سو (ض) 12 سو (ض) 127 DT662097
بروتين الريبوسوم S25 25 روبية8 EF207956 25 AY769340
chiB (سلائف الكيتيناز) الفصل9 CX700556 ، EF211966 7 AF052914
متماثل مثبط الريبونوكليز L RLI9 EF207958 7 AB164193
بروتين الريبوسوم S27 RpS279 EF207957 7 AY769342
الوحدة الفرعية التنظيمية للكينازات المعتمدة على Cyclin سيكس9 سي اكس 700558
عامل الاستطالة 1α بEf1a10 AY747994 5 D13338
عامل الاستطالة 1δ Ef1d10 سي اكس 700886 5 AB046366
مرمم بPtc10 AY745373 5 AADK01000387
بروتين الريبوسوم L13 دRpL1310 CO729603 5 AY769282
بروتين الريبوسوم L19 بRpL1910 سي اكس 700796 5 AY769289
بروتين الريبوسوم S11 دRpS1110 سي اكس 700450 ص AY706955
Opsin1 بOPS111 AF126751 15 AB047924
بروتين الريبوسوم L5 بRpL511 CO729889 15 AY769272
بروتين الريبوسوم L7A RpL7A11 EF207963 15 AY769275
بروتين الريبوسوم L10A بRpL10A11 CO729740 15 AY769279
بروتين الريبوسوم P0 بRpP011 CO729821 15 AJ457827
بروتين الريبوسوم S5 بRpS511 CO729660 15 AY769319
بروتين الريبوسوم S8 بروبية 811 CX700851 15 AY769322
بروتين الريبوسوم L8 RpL811 EF207977 ، EF211969
بروتين الريبوسوم L30 د30 روبية11 CO729949
البروتين الغني بالجليسين جي ار بي12 EF207964 ، EF211967 8 AB197877
بيتا توبولين Btub12 EF207965 ، EF211964 20 AB003287
بروتين الريبوسوم S7 RpS712 EF207966 20 AY769321
بروتين الريبوسوم S20 20 روبية12 CX700684 20 AY769336
إينولاس إينو12 EF207979
بروتين الريبوسوم L7 دRpL712 سي اكس 700625
بروتين الريبوسوم L27 RpL2712 EF207978
بروتين الريبوسوم S12 دروبية 1212 CX700631
بروتين الريبوسوم S16 روبية 1613 EF207967 14 AY769332
كالريتيكولين اتفاقية حقوق الطفل13 EF207968 22 AB090887
بروتين بشرة (EDG84A homolog) EDG84A13 CO729743 22 AB017550
PCNA PCNA13 CV526328 22 AB002264 ، AB002265
بروتين الريبوسوم L37 RpL3713 DN172717 22 AY769308
بروتين الريبوسوم S4 RpS413 CO729938
قرمزي بالخامس13 AY691422
بروتين الريبوسوم L12 RpL1214 EF207969 19 AY769281
عامل استطالة الترجمة حقيقية النواة 2 eEF214 سي اكس 700527
بروتين الريبوسوم S9 جRpS914 CX700565
بروتين الريبوسوم L22 جRpL2215 CX700470 17 AY769291
بروتين الريبوسوم P40 جRpP4015 سي اكس 700776 17 AB062685
بروتين الريبوسوم S24 RpS2415 EF207970 ، EF211972 17 AY578155
عامل بدء حقيقيات النوى 3 ب eiF3B15 EF207980
صندوق رأس الشوكة J1 جفوكس15 CR974474
راب جيرانيغيرانيل ترانسفيراز ججيرترا15 CR974474
عامل الاستطالة 1γ Ef1g16 EF207971 18 AB046361
بروتين هيت شوك hsp21.4 Hsp21.417 EF207972 13 AB195972
بروتين ليم Mlp17 DT663321 13 AY461436
بروتين الريبوسوم L21 RpL2117 CO729978 13 AY769290
بروتين الريبوسوم L31 جRpL3117 CX700740 13 AY769301
ترجمة ADP / ATP ANT17 EF207974 ، EF211962 24 AY227000
بروتين الريبوسوم L32 RpL3217 EF207973 24 AB048205
Sui1 Sui117 CO729706 ، EF211974 24 AY426343
بروتين الريبوسوم L27a RpL27a17 EF207981
بروتين الريبوسوم S10 RpS1017 EF207982
صدفي جاس دي17 DQ674429
بي ام 44 بي ام 4418 DT664299 23 AB158647
مثبط لبروتين موت الخلايا المبرمج الشراء داخل التطبيق18 CV526245 ، EF211968 23 AF281073
بروتين الريبوسوم S30 30 روبية18 سي اكس 700724 23 AY769346
Cubitus interruptus بci18 AY429297 يو AF529422
90 كيلو دالتون بروتين الصدمة الحرارية 90 ساعة18 CO729719 ، EF211960 يو AB060275
ألفا توبولين أتوب18 EF207983 ، EF211963
ا-جليكوزيل ترانسفيراز دOgt18 CV526007
مشلول بموانئ دبي19 AY747899 12 BAAB01102755
بروتين يحتوي على المجال J JDP19 DT662955 12 AF176014
بروتين الريبوسوم L9 RpL919 EF207975 12 AY769277
بروتين عضلي 20 النائب 2019 CO729543
طليعة إنزيم منشط للبروبينول أوكسيديز PPAE19 CO729777
بروتين الريبوسوم L44 جRpL4419 CX700847
كاسباس -1 كاسباس20 EF207976 ، EF211965 10 AF448494
بروتين رابط لهرمون الأحداث العصاري الخلوي جهبة20 DT661817 10 AF098303
أكتين 1 يمثل20 EF207985 ، EF211961
الكالسيوم ATPase قبعة20 CO729824
بروتين الريبوسوم L23A RpL23A20 EF207984 ، EF211971
من غير إمتدادات بملائم21 (ض) AY747887 1 (ض) AB024903
ترايوز-فوسفات أيزوميراز بTPI21 (ض) AY548151 1 (ض) AY734490
اسم العلامة. اختصار . H. melpomene مجموعة الربط. انضمام GenBank لا. . ب. موري مجموعة الربط أ . انضمام GenBank لا. .
Alanyl-tRNA synthetase آاتس علاء1 EF207962 4 M55993
دوبا ديكاربوكسيلاز بDDC1 AY437802 4 AF372836
بروتين الريبوسوم L3 بRpL31 EE743523 4 AB024901
بلا أجنحة جWg1 AY745485 4 D14169
بروتين الريبوسوم L6 RpL62 EF207960 16 AY769273
بروتين الريبوسوم P2 RpP22 EF207959 16 AY769269
الجلوتاثيون س-ناقل ضريبة السلع والخدمات3 EF207961 6 AJ006502
بروتين الريبوسوم L15 دRpL153 DN172764 6 AY769285
مانوز - فوسفات أيزوميراز جMPI3 AY332460
بروتين الريبوسوم S6 RpS64 EF207950 21 AY769320
بروتين الريبوسوم S15 RpS154 EF207951 21 AY706957
بروتين الريبوسوم S17 RpS174 EF207952 21 AY769333
بروتين الريبوسوم L11 بRpL115 CO729501 3 AY769280
بروتين الريبوسوم L13A RpL13A5 EF207949 3 AY769283
منتج الجين المرتبط بالإنزيم المحفز بالـ Ecdysteroid تعصب6 EF207953 9 AB026110
بروتين الريبوسوم S14 دRpS146 CX700812 9 AY706956
محفور م7 AY745328 2 M64335
مستتر جInv7 DQ445457 2 M64336
بروتين الريبوسوم S21 روبية 217 DN172654 ، CX700448 2 AY578154
بروتين الريبوسوم S28 روبية 287 EF452418 2 AY583363
بروتين الريبوسوم L14 RpL147 EF207954 11 AY769284
بروتين الريبوسوم L18 RpL187 EF207955 ، EF211970 11 AY769287
الريبوسوم Sop2 Sop27 DT663968 ، EF211973 11 AY763110
أقل البعيدة جدلل7 DQ445415
الجين البروتيني للتحكم في نقطة التفتيش الانقسامية (bub3) بوب 37 CX700513
بروتين بولي كومب سو (ض) 12 سو (ض) 127 DT662097
بروتين الريبوسوم S25 25 روبية8 EF207956 25 AY769340
chiB (سلائف الكيتيناز) الفصل9 CX700556 ، EF211966 7 AF052914
متماثل مثبط الريبونوكليز L RLI9 EF207958 7 AB164193
بروتين الريبوسوم S27 RpS279 EF207957 7 AY769342
الوحدة الفرعية التنظيمية للكينازات المعتمدة على Cyclin سيكس9 سي اكس 700558
عامل الاستطالة 1α بEf1a10 AY747994 5 D13338
عامل الاستطالة 1δ Ef1d10 سي اكس 700886 5 AB046366
مرمم بPtc10 AY745373 5 AADK01000387
بروتين الريبوسوم L13 دRpL1310 CO729603 5 AY769282
بروتين الريبوسوم L19 بRpL1910 سي اكس 700796 5 AY769289
بروتين الريبوسوم S11 دRpS1110 سي اكس 700450 ص AY706955
Opsin1 بOPS111 AF126751 15 AB047924
بروتين الريبوسوم L5 بRpL511 CO729889 15 AY769272
بروتين الريبوسوم L7A RpL7A11 EF207963 15 AY769275
بروتين الريبوسوم L10A بRpL10A11 CO729740 15 AY769279
بروتين الريبوسوم P0 بRpP011 CO729821 15 AJ457827
بروتين الريبوسوم S5 بRpS511 CO729660 15 AY769319
بروتين الريبوسوم S8 بروبية 811 CX700851 15 AY769322
بروتين الريبوسوم L8 RpL811 EF207977 ، EF211969
بروتين الريبوسوم L30 د30 روبية11 CO729949
البروتين الغني بالجليسين جي ار بي12 EF207964 ، EF211967 8 AB197877
بيتا توبولين Btub12 EF207965 ، EF211964 20 AB003287
بروتين الريبوسوم S7 RpS712 EF207966 20 AY769321
بروتين الريبوسوم S20 20 روبية12 CX700684 20 AY769336
إينولاس إينو12 EF207979
بروتين الريبوسوم L7 دRpL712 سي اكس 700625
بروتين الريبوسوم L27 RpL2712 EF207978
بروتين الريبوسوم S12 دروبية 1212 CX700631
بروتين الريبوسوم S16 روبية 1613 EF207967 14 AY769332
كالريتيكولين اتفاقية حقوق الطفل13 EF207968 22 AB090887
بروتين بشرة (EDG84A homolog) EDG84A13 CO729743 22 AB017550
PCNA PCNA13 CV526328 22 AB002264 ، AB002265
بروتين الريبوسوم L37 RpL3713 DN172717 22 AY769308
بروتين الريبوسوم S4 RpS413 CO729938
قرمزي بالخامس13 AY691422
بروتين الريبوسوم L12 RpL1214 EF207969 19 AY769281
عامل استطالة الترجمة حقيقية النواة 2 eEF214 سي اكس 700527
بروتين الريبوسوم S9 جRpS914 CX700565
بروتين الريبوسوم L22 جRpL2215 CX700470 17 AY769291
بروتين الريبوسوم P40 جRpP4015 سي اكس 700776 17 AB062685
بروتين الريبوسوم S24 RpS2415 EF207970 ، EF211972 17 AY578155
عامل بدء حقيقيات النوى 3 ب eiF3B15 EF207980
صندوق رأس الشوكة J1 جفوكس15 CR974474
راب جيرانيغيرانيل ترانسفيراز ججيرترا15 CR974474
عامل الاستطالة 1γ Ef1g16 EF207971 18 AB046361
بروتين هيت شوك hsp21.4 Hsp21.417 EF207972 13 AB195972
بروتين ليم Mlp17 DT663321 13 AY461436
بروتين الريبوسوم L21 RpL2117 CO729978 13 AY769290
بروتين الريبوسوم L31 جRpL3117 CX700740 13 AY769301
ترجمة ADP / ATP ANT17 EF207974 ، EF211962 24 AY227000
بروتين الريبوسوم L32 RpL3217 EF207973 24 AB048205
Sui1 Sui117 CO729706 ، EF211974 24 AY426343
بروتين الريبوسوم L27a RpL27a17 EF207981
بروتين الريبوسوم S10 RpS1017 EF207982
صدفي جاس دي17 DQ674429
بي ام 44 بي ام 4418 DT664299 23 AB158647
مثبط لبروتين موت الخلايا المبرمج الشراء داخل التطبيق18 CV526245 ، EF211968 23 AF281073
بروتين الريبوسوم S30 30 روبية18 سي اكس 700724 23 AY769346
Cubitus interruptus بci18 AY429297 يو AF529422
90 كيلو دالتون بروتين الصدمة الحرارية 90 ساعة18 CO729719 ، EF211960 يو AB060275
ألفا توبولين أتوب18 EF207983 ، EF211963
ا-جليكوزيل ترانسفيراز دOgt18 CV526007
مشلول بموانئ دبي19 AY747899 12 BAAB01102755
بروتين يحتوي على المجال J JDP19 DT662955 12 AF176014
بروتين الريبوسوم L9 RpL919 EF207975 12 AY769277
بروتين عضلي 20 النائب 2019 CO729543
طليعة إنزيم منشط للبروبينول أوكسيديز PPAE19 CO729777
بروتين الريبوسوم L44 جRpL4419 CX700847
كاسباس -1 كاسباس20 EF207976 ، EF211965 10 AF448494
بروتين رابط لهرمون الأحداث العصاري الخلوي جهبة20 DT661817 10 AF098303
أكتين 1 يمثل20 EF207985 ، EF211961
الكالسيوم ATPase قبعة20 CO729824
بروتين الريبوسوم L23A RpL23A20 EF207984 ، EF211971
من غير إمتدادات بملائم21 (ض) AY747887 1 (ض) AB024903
ترايوز-فوسفات أيزوميراز بTPI21 (ض) AY548151 1 (ض) AY734490

التحليل التركيبي:

من بين العلامات المشتقة من cDNA المعينة حديثًا ، كانت 47 علامة متعامدة مع تلك التي تم تعيينها في ب. موري، والتي ، جنبًا إلى جنب مع 25 علامة متعامدة تم تعيينها مسبقًا (Jiggins وآخرون. 2005 بابانيكولاو وآخرون. 2005 جورون وآخرون. 2006 ب) ، نتج عنه رسم 72 علامة تقويمية في كلا النوعين. تمتد هذه العلامات على جميع الكروموسومات البالغ عددها 21 كروموسومًا H. melpomene و 27 من 28 كروموسوم ب. موري (الجدولان 1 و 2). أظهرت هذه العلامات العلاقات التركيبية المحفوظة تمامًا بين النوعين وسمحت بتحديد الكروموسومات المتجانسة التي حددتها المجموعات المحفوظة لمواضع الربط. سقط ثمانية وثلاثون علامة في 15 H. melpomene LGs ، كل منها يتوافق مع كروموسوم واحد متماثل في ب. موري كل من هذه LGs احتوت بين واحد وسبعة علامات متعامدة (الجدول 2).

ملخص مجموعة الارتباط المتماثل وعلامات نمط اللون

H. melpomene مجموعة الربط. ب. موري مجموعة الربط. عدد الجينات المشتركة لكلا النوعين. H. melpomene علامة نمط اللون أ .
1 4 4 ك
2 16 2
3 6 2
4 21 3
5 3 2
6 9 2
7 2, 11 7
8 25 1
9 7 3
10 5 ، ص 6 مكيف
11 15 7
12 8, 20 4
13 14, 22 5
14 19 1
15 17 3 يب / سب / ن
16 18 1
17 13, 24 7
18 23 ، يو 5 ب / د
19 12 3
20 10 2
21 1 2
غير متوفر 26 0
المجموع: 21 كروموسوم المجموع: 28 كروموسوم المجموع: 72
H. melpomene مجموعة الربط. ب. موري مجموعة الربط. عدد الجينات المشتركة لكلا النوعين. H. melpomene علامة نمط اللون أ .
1 4 4 ك
2 16 2
3 6 2
4 21 3
5 3 2
6 9 2
7 2, 11 7
8 25 1
9 7 3
10 5 ، ص 6 مكيف
11 15 7
12 8, 20 4
13 14, 22 5
14 19 1
15 17 3 يب / سب / ن
16 18 1
17 13, 24 7
18 23 ، يو 5 ب / د
19 12 3
20 10 2
21 1 2
غير متوفر 26 0
المجموع: 21 كروموسوم المجموع: 28 كروموسوم المجموع: 72

ملخص مجموعة الارتباط المتماثل وعلامات نمط الألوان

H. melpomene مجموعة الربط. ب. موري مجموعة الربط. عدد الجينات المشتركة لكلا النوعين. H. melpomene علامة نمط اللون أ .
1 4 4 ك
2 16 2
3 6 2
4 21 3
5 3 2
6 9 2
7 2, 11 7
8 25 1
9 7 3
10 5 ، ص 6 مكيف
11 15 7
12 8, 20 4
13 14, 22 5
14 19 1
15 17 3 يب / سب / ن
16 18 1
17 13, 24 7
18 23 ، يو 5 ب / د
19 12 3
20 10 2
21 1 2
غير متوفر 26 0
المجموع: 21 كروموسوم المجموع: 28 كروموسوم المجموع: 72
H. melpomene مجموعة الربط. ب. موري مجموعة الربط. عدد الجينات المشتركة لكلا النوعين. H. melpomene علامة نمط اللون أ .
1 4 4 ك
2 16 2
3 6 2
4 21 3
5 3 2
6 9 2
7 2, 11 7
8 25 1
9 7 3
10 5 ، ص 6 مكيف
11 15 7
12 8, 20 4
13 14, 22 5
14 19 1
15 17 3 يب / سب / ن
16 18 1
17 13, 24 7
18 23 ، يو 5 ب / د
19 12 3
20 10 2
21 1 2
غير متوفر 26 0
المجموع: 21 كروموسوم المجموع: 28 كروموسوم المجموع: 72

اندماج الكروموسومات:

بما يتفق مع الاختلاف في عدد الكروموسوم بينهما ب. موري (28) و H. melpomene (21) ، وجدنا دليلًا على 6 من 10 اندماج كروموسومي متوقع في Heliconiini المشتق (الشكل 2). اقترحت كل حالة أن اثنين من الكروموسومات من الأصناف القاعدية ، كما لا يزال يتم تمثيلها من قبل اثنين من الكروموسومات في ب. موري، قد انصهرت لتشكيل واحدة H. melpomene كروموسوم. كان من الممكن أن تكون الاندماجات الإضافية المتوقعة قد لا يتم اكتشافها إذا كانت قد اشتملت على زوج من الكروموسومات التي اندمجت أيضًا في ب. موري النسب أو متماثل ب. موري 26 كروموسوم الوحيد ب. موري كروموسوم ليس لدينا علامات مشتركة فيه H. melpomene (الجدول 2) ، يندمج إما في كروموسوم تم تحديده بالفعل على أنه مدمج (بمعنى آخر.، انصهار ثلاثي) أو لكروموسوم آخر يظهر حاليًا في تناظر 1: 1 مع ب. موري كروموسوم.

خرائط الارتباط للكروموسومات المندمجة افتراضيًا في H. melpomene بالمقارنة مع خرائط العلامات المحفوظة بتنسيق ب. موري (A – F ، المقابلة لستة كروموسومات مفترضة مدمجة مختلفة في H. melpomene). لاحظ الفرق في المقياس بين الخرائط. عدم وجود أشرطة الموضع لـ RpL13, ptc، و إف 1α في ب. موري يشير LG5 إلى أنه تم تعيين هذه العلامات باستخدام BAC-FISH بدلاً من تعيين ارتباط إعادة التركيب (انظر Yasukochi وآخرون. 2006). عدم وجود أشرطة الموضع لـ روبية 16 في ب. موري LG14 و H. melpomene يشير LG13 إلى عدم وجود تعيين إعادة التركيب في ب. موري ورسم خرائط إعادة التركيب في حضنة مختلفة (الحضنة 44 مقابل الحضنة 33 انظر المواد والطرق) في H. melpomene.

خرائط الارتباط للكروموسومات المندمجة افتراضيًا في H. melpomene بالمقارنة مع خرائط العلامات المحفوظة بتنسيق ب. موري (من A إلى F ، المقابلة لستة كروموسومات مفترضة مدمجة مختلفة في H. melpomene). لاحظ الفرق في المقياس بين الخرائط. عدم وجود أشرطة الموضع لـ RpL13, ptc، و إف 1α في ب. موري يشير LG5 إلى أنه تم تعيين هذه العلامات باستخدام BAC-FISH بدلاً من تعيين ارتباط إعادة التركيب (انظر Yasukochi وآخرون. 2006). عدم وجود أشرطة الموضع لـ روبية 16 في ب. موري LG14 و H. melpomene يشير LG13 إلى عدم وجود تعيين إعادة التركيب في ب. موري ورسم خرائط إعادة التركيب في حضنة مختلفة (الحضنة 44 مقابل الحضنة 33 انظر المواد والطرق) في H. melpomene.

حفظ الترتيب الجيني:

كان للكروموسومات الستة المفترضة التي قمنا بتعيين علامات جديدة لها موضعياً (الشكل 2) طول خريطة مجمعة يبلغ 627 سم ، مقارنةً مع ما يقدر بـ 424 سم لهذه الكروموسومات الستة نفسها باستخدام العلامات المتاحة سابقًا (Jiggins وآخرون. 2005). يرجع هذا إلى حد كبير إلى وظيفة اكتشاف الأخطاء في MapMaker ، مما يؤدي إلى تقدير منخفض بشكل مصطنع لمسافة إعادة التركيب في الخريطة السابقة (انظر المواد والأساليب). وهكذا ، على سبيل المثال ، كان لدى LG7 طول خريطة يبلغ 51.5 سم في الدراسة السابقة ، والذي يزيد إلى 61.4 سم مع مجموعة البيانات الحالية باستخدام اكتشاف الخطأ. ومع ذلك ، بدون اكتشاف الخطأ ، يزيد طول نفس الكروموسوم إلى 98 سم (الشكل 2 أ). لذلك يبدو من المحتمل أن يكون طول إعادة التركيب الإجمالي لـ H. melpomene الجينوم أكبر بكثير مما تم الإبلاغ عنه سابقًا. كشف التعيين أيضًا عن الاتجاه المحتمل لمعظم عمليات اندماج الكروموسومات (الشكل 2) ، بافتراض الحفاظ على ترتيب الجينات على الكروموسومات باستخدام علامتين فقط تم تعيينهما موضعياً. كان الحفاظ على ترتيب الجينات واضحًا في مقارنات H. melpomene كروموسوم 7 ل ب. موري الكروموسوم 2 و H. melpomene كروموسوم 10 إلى ب. موري كروموسوم 5 (الشكل 2 ، A و B). يعتمد الاستنتاج الأخير على المقارنة مع العلامات التي تم تعيينها بواسطة BAC-FISH في ب. موري (ياسوكوتشي وآخرون. 2006 الشكل 2 ب). حدث انعكاس واضح في ترتيب الجينات بين مرمم (ptc) و إف 1α (الشكل 2 ب) ، مما يشير إلى انقلاب الكروموسومات في سلالة واحدة أو أخرى. على الرغم من أن هذه المواقع مرتبطة ارتباطًا وثيقًا ، إلا أن عكس ترتيبها يؤدي إلى انخفاض كبير في الاحتمالية الإجمالية (احتمالية السجل = 2.38 ، ص & lt 0.004 ، من الترتيب المعكوس مقارنةً بالترتيب الموضح في الشكل 2 ب) ، فإن تعيين علامات إضافية لهذه المنطقة سيوفر اختبارًا لهذا الاستنتاج.


مراجع

رينويك ، ج. Annu. القس جينيه. 5, 81–120 (1972).

رينويك ، ج. في علم الوراثة البشرية. وقائع المؤتمر الدولي الرابع لعلم الوراثة البشرية ، 6-11 سبتمبر 1971 (محرران de Grouchy، J.، Ebling، FJG & amp Henderson، IW) 443-444 (Excerpta Medica، Amsterdam، 1972).

ليفيتان ، م. كتاب علم الوراثة البشرية (مطبعة جامعة أكسفورد ، أكسفورد ، 1988).

ساتون ، إم إي. مقدمة في علم الوراثة البشرية (هاركورت بريس جوفانوفيتش ، سان دييغو ، 1988).

طومسون ، MW ، McInnes ، R.R. & amp Willard ، H.F. علم الوراثة في الطب (دبليو بي سوندرز ، فيلادلفيا ، 1991).

روثويل ، ن. فهم علم الوراثة. نهج جزيئي (وايلي ليس ، نيويورك ، 1993).

كونور ، جي إم وأمبير فيرغسون سميث ، ماجستير علم الوراثة الطبية الأساسية (بلاكويل العلمية ، أكسفورد ، 1993).

مولر ، ر. & amp يونغ ، I.D. عناصر إيمري في علم الوراثة الطبية (تشرشل ليفينجستون ، إدنبرة ، 1995).

جورد ، إل بي ، كاري ، جي سي وأمبير وايت ، R.L. علم الوراثة الطبية (موسبي ، سانت لويس ، 1995).

جيليهرتر ، تي دي ، كولينز ، إف إس. & amp Ginsburg، D. مبادئ علم الوراثة الطبية (ويليامز وأمبير ويلكينز ، بالتيمور ، 1998).

ميرفي ، إ. & أمبير تشيس ، جنرال إلكتريك مبادئ الاستشارة الوراثية (الكتاب السنوي الطبي ، شيكاغو ، 1975).

Rieger ، R. ، Michaelis ، A. & amp Green ، M.M. مسرد علم الوراثة وعلم الوراثة الخلوية (Springer Verlag Heidelberg ، نيويورك ، 1976).

أوت ، ج. تحليل الارتباط الجيني البشري (مطبعة جامعة جونز هوبكنز ، بالتيمور ، 1991).


SynteBase / SynteView: أداة لتصور حفظ ترتيب الجينات في جينومات بدائية النواة

خلفية: لقد لوحظ مرارًا وتكرارًا أن ترتيب الجينات يُفقد بسرعة في جينومات بدائية النواة. ومع ذلك ، تم العثور على كتل تخليقية ثابتة عند مقارنة الأنواع البعيدة أكثر أو أقل. هذه الجينات التي تظل متجاورة باستمرار هي جاذبية المرشحين لدراسة تطور الجينوم وتعريف أكثر دقة لدورها الوظيفي. تتطلب مثل هذه الدراسات تصور الكتل المخلقة المحفوظة في عدد كبير من الجينومات في جميع المسافات التصنيفية.

نتائج: بعد مقارنة ما يقرب من 600 جينوم متسلسل بالكامل يشمل شجرة الحياة بدائية النواة بأكملها ، تم تجميع البيانات التركيبية المحسوبة في قاعدة بيانات علائقية ، SynteBase. تم تصميم SynteView لتصور الكتل المخلوطة المحفوظة في عدد كبير من الجينوم بعد اختيار واحد منهم كمرجع. وظائف SynteView مع البيانات المخزنة إما في SynteBase أو في قاعدة بيانات علائقية محلية الصنع للبيانات الشخصية. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن لهذا البرنامج أن يحسب بسرعة ويعرض توزيع الكتل المخلوطة المحفوظة في أزواج من الجينومات. تم تصميم هذه الأداة لتوفير ثروة من المعلومات حول كل جين تقويمي موضعي ، لتكون سهلة الاستخدام وقابلة للتخصيص. من الممكن أيضًا تنزيل تسلسل الجينات التي تنتمي إلى هذه الكتل المخلقة لمزيد من الدراسات. يمكن الوصول إلى SynteView من خلال Java Webstart على http://www.synteview.u-psud.fr.

استنتاج: يجيب SynteBase على الاستفسارات حول حفظ ترتيب الجينات ويصور SynteView النتائج التي تم الحصول عليها بطريقة مرنة وقوية توفر نظرة عامة مقارنة للتخليق المحفوظ في عدد كبير من الجينومات ، بغض النظر عن مسافاتها التصنيفية.


شاهد الفيديو: تجارب مندل (يونيو 2022).


تعليقات:

  1. Megore

    العبث ما هذا

  2. Sherbourne

    أنا آسف ، لكن أعتقد أنك مخطئ. أنا متأكد. يمكنني إثبات ذلك. أرسل لي بريدًا إلكترونيًا في PM ، سنتحدث.

  3. Braran

    the Authoritarian message :)

  4. Azzam

    لم يسمع تال



اكتب رسالة