We are searching data for your request:
Upon completion, a link will appear to access the found materials.
هل يمكن لأي شخص أن يشرح مفهوم Synteny المتعلق بعلم الوراثة؟ سوف تساعد الصورة. حاولت قراءة مصدر ويكيبيديا مع ملف PDF آخر
http://gep.wustl.edu/repository/course_materials_WU/annotation/About_Synteny_Analysis.pdf
وأشعر أنه ساعد إلى حد ما فقط. مما أجمعه يتعلق بترتيب الجينات بالنسبة لجيناتها المتماثلة؟ أم موقعهم بشكل عام؟
تحتوي الكتل التركيبية على نفس جينات الترتيب بين كروموسومات الأنواع المختلفة.
يوضح الشكل أعلاه (من اليسار إلى اليمين) كتلة تركيبية مشتركة بين الكروموسوم البشري 17 والكروموسومات المقابلة في ثلاثة ثدييات أخرى (الحصان والخنزير والشمبانزي). وكما هو متوقع ، كلما تميزت الأنواع (مثل الخنازير والحصان) كلما كان ترتيب الجينات أكثر اضطرابًا.
المرجع: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3758187/
ما هو التخليق وكيف نستخدمه في علم الجينوم وعلم الوراثة؟
فيما يتعلق بهذا ، عند مقارنة جينومات الأنواع المختلفة يتم تعريف التخليق على أنه؟
عند مقارنة جينومات الأنواع المختلفة, 'synteny "يتم تعريفه على أنه. نفس الجينات في نفس الترتيب على طول الكروموسوم. مصطلح التغطية ، عند تطبيقها على علم الجينوم، يعني تسلسل نفس الزوج الأساسي عدة مرات. لقد درست للتو 10 فصول دراسية!
قد يتساءل المرء أيضًا ، ما هو الغرض من اختبار synteny؟ هو - هي الاختبارات لمعرفة ما إذا كانت الجينات موجودة على نفس الكروموسوم. فصل الكروماتيدات الشقيقة خلال أي مراحل من دورة الخلية؟ طور الانقسام الخيطي وطور الانقسام الاختزالي الثاني.
وبالتالي ، ما هي الكتلة المخلوية؟
أ كتلة تركيبية عبارة عن مجموعة من الجينات المتجاورة الموجودة على نفس الكروموسوم. عادةً ما يتم توريث السمات التي توفرها هذه الجينات معًا ، وبالتالي تنتهك قانون مندل للتشكيلة المستقلة.
كيف يحدث ازدواجية الجينات؟
الازدواجية الجينية يحدث عندما تكون نسخة إضافية من ملف الجين مصنوع في كائن حي الجينوم. بعض الأحيان، ازدواجية الجينات مفيد للكائن الحي وقد يؤدي في النهاية إلى تطوير نوع جديد. أنواع مختلفة من الكيراتين في الجسم هي نتيجة الازدواجية من واحد الجين.
تسمية الجينات البشرية
الرموز والأسماء
بمجرد تخصيص الجينات للعديد من الكروموسومات ، بدأ ترتيبها على طول الكروموسوم وبدأ بالفعل رسم خرائط الجينات البشرية. أدى نشر أوامر الجينات إلى توليد فكرة رمز الجين ، بالإضافة إلى اسمه. كان هذا الرمز عبارة عن شكل مختصر من الاسم ، ولا يُنسى ويمكن التعرف عليه ، ولكنه قصير بما يكفي ليتم إدراجه في التمثيلات التخطيطية للكروموسومات التي تسمى الخرائط. تتكون هذه الرموز عادةً من حرفين أو ثلاثة أحرف فقط في تركيبة تعكس الاسم ، وربما مع إضافة رقم إذا تم اكتشاف أكثر من جين واحد له وظيفة مماثلة. مثال: ADH1، ADH2 (الجينات التي ترمز لأشكال مختلفة من الإنزيم ، نازعة هيدروجين الكحول).
من الواضح أن رمز الجين وحده ليس له معنى جوهري ، فهو له معنى فقط فيما يتعلق بالاسم الأطول والأكثر وصفيًا. في حين أن الاسم قد يتنوع بشكل كبير ولا يزال يحتفظ بنفس المعنى (الأميليز واللعاب و الأميليز اللعابي من الواضح أن لها نفس المعنى) ، يجب أن تكون مجموعات الأحرف والأرقام المحدودة للرمز القصير ثابتة لتجنب الغموض. تم التعرف على أهمية رمز التعريف الفريد في السنوات الأولى لرسم خرائط الجينات ، وتم تشكيل لجنة التسمية للإشراف على تخصيص الرموز المناسبة للاستخدام في الخرائط ووضع مبادئ توجيهية لضمان أكبر قدر ممكن من الاتساق. كانت المبادئ التوجيهية عرضة للعديد من التأثيرات التي تضمنت الممارسة المتبعة ، من أجل تجنب الالتباس من خلال العديد من التغييرات في الرموز ، والحاجة إلى تقليل الغموض ، مع التفرد كأهم معايير أخرى توصيات أبسط مثل تجنب الأرقام الرومانية والأكثر بعد نظر تهدف إلى زيادة إمكانية الوصول و "إمكانية البحث" من خلال التوصية بأنظمة هرمية لبناء الرموز. تأثرت المبادئ التوجيهية أيضًا بالقيود المفروضة على التخزين الإلكتروني المبكر والاتصالات ، مثل إلغاء الأحرف اليونانية التي لا يمكن تمثيلها بسهولة في قواعد البيانات الإلكترونية ، والقيود المفروضة على استخدام علامات الترقيم لتسهيل البحث.
يحل التخليق المحفوظ بعمق الأحداث المبكرة في تطور الفقاريات
على الرغم من الاعتقاد السائد بأن التطور المبكر للفقاريات قد تم تشكيله من خلال ازدواج الجينوم الكامل القديم ، إلا أن عدد وتوقيت وآلية هذه الأحداث لا يزال بعيد المنال. هنا ، نستنتج تاريخ الفقاريات من خلال المقارنات الجينومية مع تسلسل جديد على نطاق كروموسوم من الأمفيوكسوس الحبلي اللافقاري. نوضح كيف يتم اشتقاق الأنماط النووية للسُّهيمات والفقاريات المتنوعة من 17 مجموعة ربط حبلي أسلاف (و 19 مجموعة أسلاف ثنائية) عن طريق الاندماج وإعادة الترتيب والازدواجية. لقد حللنا نسختين قديمتين مختلفتين من الازدواجية بناءً على أنماط التركيب الكروموسومي المحفوظ. تشترك جميع الفقاريات الموجودة في الازدواجية الأولى ، والتي حدثت في منتصف / أواخر العصر الكمبري عن طريق الاستبدال الذاتي (أي مضاعفة الجينوم المباشر). في المقابل ، تم العثور على الازدواجية الثانية فقط في الفقاريات الفكية وحدثت في منتصف أواخر Ordovician عن طريق التباين (أي ، ازدواج الجينوم بعد التهجين بين الأنواع) من اثنين من السلالات المنقرضة الآن. هذا التاريخ الجينومي المعقد يوازي تنوع سلالات الفقاريات في السجل الأحفوري.
بيان تضارب المصالح
د. عضو في المجلس الاستشاري العلمي لعلم الجينوم المتوافق. R.E.G. هو مؤسس Dovetail Genomics. N.H.P. موظف في شركة Dovetail Genomics. DSR ، R.E.G. و N.H.P. جميعهم مساهمون في شركة Dovetail Genomics. يعلن المؤلفون الآخرون عدم وجود مصالح متنافسة.
الأرقام
الشكل 1. المواد المخلقة المحفوظة بين السُّهيمات و ...
التين. 1. المخلوقات المحفوظة بين السُّهيمات والأنواع المختلفة.
الشكل 2. مساهمات 17 أسلاف ...
التين. 2. مساهمات الـ 17 CLGs الموروثة للأجداد في جينومات الفقاريات المعاصرة.
الشكل 3. تنظيم الكروموسومات العظمية للفقاريات ...
الشكل 3. تنظيم كروموسومات الفقاريات العظمية بعد 2R.
غالبية CLGs لديها أربعة ...
الشكل 4. الازدواج والاندماج والاختلاط في ...
الشكل 4. الازدواجية والاندماج والاختلاط في الفقاريات العظمية.
التين. 5. سيناريو Auto- ثم allotetetraploidy لـ ...
5. سيناريو تباين الصبغيات الذاتي لتطور الفقاريات.
رسم تخطيطي لـ auto- ثم allotetraploidy ...
بيانات موسعة الشكل 1. الكروماتين والجيني ...
الشكل 1. البيانات الموسعة. الخرائط الجينية والكروماتين للجينوم السماوي.
بيانات موسعة الشكل 2. تظهر المخططات النقطية المحفوظة ...
بيانات موسعة الشكل 2. تظهر المخططات النقطية التراكيب المحفوظة بين السُّهيمات والإنسان والضفدع.
الشكل 3. بيانات موسعة. تظهر المخططات النقطية ...
بيانات موسعة الشكل 3. تظهر المخططات النقطية التراكيب المحفوظة بين لامبري والسُّهيمات.
الشكل 4. بيانات موسعة. توضح المخططات النقطية ...
بيانات موسعة الشكل 4. تظهر المخططات النقطية التراكيب المحفوظة بين السُّهيمات واللافقاريات المختارة.
بيانات موسعة الشكل 5. أخصائيو تقويم العظام المرقط الدجاج ...
بيانات موسعة الشكل 5. أخصائيو تقويم العظام ومعاوني الثوم المرقط الدجاج.
"نقطة أكسفورد بين الدجاج (جالوس جالوس ، ...
تمديد البيانات الشكل 6. شبكة أكسفورد بين ...
الشكل 6. شبكة أكسفورد بين كروموسومات الفقاريات العظمية ومجموعات الارتباط الحبلي (CLGs).
بيانات موسعة الشكل 7. تظهر شبكة أكسفورد ...
بيانات موسعة الشكل 7. تظهر شبكة أكسفورد الارتباطات بين 50 قطعة جينية للفقاريات العظمية ...
بيانات موسعة الشكل 8. شبكة أكسفورد بين ...
الشكل 8. شبكة أكسفورد بين كروموسومات السلالة الجرثومية لجزيرة البحر ومجموعات الارتباط الحبلي ...
خريطة جينية توافقية تستند إلى SNP لاستهداف السمات القائمة على التركيب في الفول (Vicia faba L.)
الفول Faba (Vicia faba L.) هو بقول مهم عالميًا لتثبيت النيتروجين ، ويزرع على نطاق واسع في مجموعة متنوعة من البيئات. في هذا العمل ، قمنا بالتعدين والتحقق من صحة مجموعة من 845 SNPs من النسخ المحاذية لخطين داخليين متناقضين. يتم تخصيص كل من V. faba SNP من خلال تحليل BLAST إلى أخصائي تقويم العظام في ميديكاغو. تم بعد ذلك التحقق من صحة هذه المجموعة من الأشكال متعددة الأشكال المثبتة بشكل اصطناعي كمقايسات KASP فردية ، مصنفة وفقًا لمعلوماتها وأدائها على لوحة مكونة من 37 سلالة فطرية ، وأفضل 757 علامة أداء مستخدمة في التركيب الجيني لستة مجموعات رسم خرائط. تم دمج خرائط الربط الست الناتجة في خريطة إجماع واحدة حيث تم وضع 687 SNPs على ست مجموعات ربط ، يفترض أن تتوافق كل منها مع أحد كروموسومات V. faba الست. تم استخدام خريطة الإجماع القائمة على التسلسل لاستكشاف التركيب مع أنواع المحاصيل الأكثر ارتباطًا ، والعدس ، والجينوم الأكثر ارتباطًا بالتسلسل الكامل ، ميديكاغو. تم العثور على مساحات كبيرة من العلاقة الخطية غير المنقطعة بين فاصوليا وميديكاغو ، مما يجعل من السهل نسبيًا التنبؤ بمحتوى الجين والترتيب في الفاصل الجيني المعين. كدليل على ذلك ، قمنا بتعيين جين لون الزهرة إلى فاصل 2 سم من كروموسوم Vf 2 والذي كان شديد الخطية مع Mt3. كان الجين المرشح الواضح من 78 نموذجًا جينيًا في مقطع كروموسوم Medicago الخطي هو الجين MtWD40-1 الذي تم وصفه سابقًا والذي يتحكم في إنتاج الأنثوسيانين في Medicago وأظهر إعادة ترتيب تقويم العظام VF حذفًا مسببًا مفترضًا لنهاية الجين بالكامل 5 '.
الكلمات الدالة: التنميط الجيني KASP الفول البقوليات أحادية النيوكليوتيدات تعدد الأشكال التركيبي.
© 2015 المؤلفون. مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية الصادرة عن جمعية البيولوجيا التجريبية وجمعية علماء الأحياء التطبيقية وشركة John Wiley & Sons Ltd.
ينشئ العلماء برنامجًا يجد الكتل المخلقة في حيوانات مختلفة
تتضمن الجينات الحديثة العمل بكميات هائلة من البيانات التي لا يمكن معالجتها دون مساعدة الخوارزميات الرياضية المعقدة. لهذا السبب ، فإن مهمة تطوير برامج معالجة خاصة لا تقل أهمية بالنسبة لمتخصصي المعلوماتية الحيوية عن مهمة التسلسل الجيني لحيوانات معينة. طور فريق دولي من العلماء ، شمل باحثين من جامعة ITMO ، أداة برمجية تجعل من الممكن العثور بسرعة وفعالية على أجزاء متشابهة في جينومات الحيوانات المختلفة ، وهو أمر ضروري لفهم مدى الارتباط الوثيق بين نوعين ، ومدى وجودهما. تطورت من سلفهم المشترك. تم نشر البحث في GigaScience.
هناك الملايين من الأنواع البيولوجية على كوكب الأرض ، وهذا التنوع قائم على المستوى الجيني. يتم تحديد تشريح الحيوانات وحجمها وأنماط ألوانها وعاداتها من خلال جيناتها. ومرة أخرى ، فإن تنوع الجينات نفسها ليس بهذه الروعة: بحلول اليوم ، حدد العلماء فقط ما يزيد عن 20000. لذلك ، تختلف الأنواع ليس فقط في مجموعات الجينات التي لديها ولكن أيضًا في كيفية ترتيب جيناتها. في لغة علم الجينوم المقارن ، يسمى هذا التركيب ، أي ترتيب الجينات والعناصر التنظيمية.
تقول كسينيا كراشينينيكوفا ، باحثة ومهندسة في جامعة ITMO: "لنأخذ غوريلا وشمبانزي كمثال". "هذان النوعان لهما نفس مجموعة الجينات ، لكن عناصرهما التنظيمية وطفرات الجينوم تخلقان ترتيبًا مختلفًا قليلاً مما ينتج عنه اختلافات بين هذه الرئيسيات."
لذلك ، لأغراض فهم مدى قرب نوعين من وجهة النظر التطورية ، يحتاج العلماء إلى معرفة ليس فقط جيناتهم ولكن أيضًا كيفية ترتيبها في كروموسوم ، وعدد أجزاء الجينوم الشائعة ، أو الكتل التركيبية ، كما يسميها علماء الوراثة ، يوجد. ثم مرة أخرى ، يعد البحث عنها يدويًا أمرًا مستحيلًا: فكمية البيانات كبيرة جدًا. تتكون جينومات الثدييات من ملايين ومليارات من أزواج القواعد ، مما يجعل المعالجة بدون تقنيات البيانات الضخمة أقرب إلى المستحيل. لهذا السبب ، ينشئ العلماء برامج خاصة بهم تجعل من الممكن حل هذه الفئة الجديدة من المهام التي ظهرت في سياق تطور هذا العلم. وهذا ما فعله فريق البحث الذي ضم علماء من مختبر التنوع الجينومي التابع لـ ITMO.
تم تسمية الأداة البرمجية الجديدة halSynteny. وفقًا لمؤلفيه ، يمكنه البحث عن الكتل التركيبية بشكل أفضل وأسرع من البرامج الأخرى المطورة لهذا الغرض. علاوة على ذلك ، تعمل HalSynteny مع البيانات بتنسيقين قياسيين وموثقين جيدًا.
يقول كسينيا ، وهو المؤلف الأول لهذا البحث: "كان هدفنا إنشاء خوارزمية يمكن تطبيقها بسهولة على البيانات التي يمكن الوصول إليها". "تستند بعض مناهج تحديد التسلسلات التركيبية إلى التعليق التوضيحي للجينات مسبقًا ، فإن طريقتنا مختلفة. لا نستخدم أي تعليق توضيحي إضافي. نستخدم طريقة المحاذاة ، عندما تتم محاذاة أجزاء مختلفة من جينوم واحد حسب درجة التشابه مع أجزاء من جينوم آخر. وبهذه الطريقة ، يمكننا تحديد الأجزاء المتجانسة ، الأجزاء التي هي من نفس الأصل. "
يتيح البرنامج تسريع العمليات الحسابية بأكثر من مرتين مقارنة بـ SatsumaSynteny2 ، وهي أداة شائعة أخرى. تم تحقيق هذه الكفاءة العالية من خلال تنفيذ خوارزمية فعالة رياضيا باستخدام C ++.
تم اختبار الطريقة والأداة البرمجية المقترحة من خلال مقارنة جينومات القطط والكلاب.
يقول كسينيا ، "لقد أظهرنا أن أجزاء كبيرة من كروموسومات القطط وبعض أجزاء كروموسومات الكلاب تتحد في كتل تركيبية ، مما يعني أنها تطورت من كروموسومات مماثلة لسلف مشترك. ويمكن استخدام هذا كأساس للتوصل إلى استنتاجات حول عمليتهم التطورية. أظهرت الأبحاث السابقة في مجال البيولوجيا "الرطبة" أن جينوم القطط تغير بشكل أقل من جينوم سلفهم المشترك مقارنةً بالكلاب. ويمكن ملاحظة ذلك بالمقارنة مع الأنواع الأخرى التي ليست جزءًا من ترتيب آكلات اللحوم. النتائج التي حصلنا عليها تؤكد هذه الاستنتاجات وتجعلها أكثر دقة. وهذا يعني أنه في جزء معين ، يتشابه جينوم القط والأنواع المأخوذة للمقارنة ، وفي الكلاب ، يتم إعادة ترتيبها ".
في المستقبل ، سيتم استخدام هذه الخوارزمية في أبحاث أخرى في مجال الجينوميات المقارنة التي تجري في جامعة ITMO.
النتائج
وقت الاختلاف:
لتقدير وقت تباعد سلالات lepidopteran ، قمنا بحساب ساعة جزيئية باستخدام شجرة بناءً على تعيينات تصنيفية راسخة وتسلسل الحمض النووي لبروتينين محفوظين للغاية (الشكل 1). الوقت المقدر للتباعد بين ب. موري و H. melpomene كانت السلالات 103 ± 8.6 MY ، بناءً على عمر تقديري قدره 190 سنة للاختلاف Lepidoptera-Diptera.
يستخدم علم السلالات لتقدير وقت الاختلاف بينهما ب. موري و H. melpomene. يشير الخط المتقطع إلى العمر التقريبي للتباعد بين هذه السلالات (∼103 MY). تشير الأسهم إلى العقد المقيدة (انظر المواد والأساليب). تشير الأرقام الموجودة في الدوائر إلى العدد الفردي للكروموسومات لـ ب. موري, H. melpomene، والأصناف القاعدية.
يستخدم علم التطور النسوي لتقدير وقت الاختلاف بينهما ب. موري و H. melpomene. يشير الخط المتقطع إلى العمر التقريبي للتباعد بين هذه السلالات (∼103 MY). تشير الأسهم إلى العقد المقيدة (انظر المواد والأساليب). تشير الأرقام الموجودة في الدوائر إلى العدد الفردي للكروموسومات لـ ب. موري, H. melpomene، والأصناف القاعدية.
تحليل الارتباط:
في المجموع ، تم تعيين 64 علامة مشتقة من (كدنا) H. melpomene مجموعات الربط في هذه الدراسة. من بين هذه العلامات ، تم تعيين 8 إلى LGs على أساس تعدد الأشكال المرئي في الطول من indels ، وتم تعيين 56 علامة أخرى لـ LGs على أساس تسجيل النمط الجيني من هضم التقييد في SNPs (الجدول 1 والجدول التكميلي 1 في http: / /www.genetics.org/supplemental/). تشابه تسلسل عالٍ للمنتجات المضخمة لتسلسلات إجماع EST و ب. موري دعم تسلسل الترميز فرضيتنا في علم تقويم العظام.
تم تعيين المواقع المحفوظة بتنسيق H. melpomene وتقويم العظام فيها ب. موري
| اسم العلامة. | اختصار . | H. melpomene مجموعة الربط. | انضمام GenBank لا. . | ب. موري مجموعة الربط أ . | انضمام GenBank لا. . |
|---|---|---|---|---|---|
| Alanyl-tRNA synthetase | آاتس علاء | 1 | EF207962 | 4 | M55993 |
| دوبا ديكاربوكسيلاز ب | DDC | 1 | AY437802 | 4 | AF372836 |
| بروتين الريبوسوم L3 ب | RpL3 | 1 | EE743523 | 4 | AB024901 |
| بلا أجنحة ج | Wg | 1 | AY745485 | 4 | D14169 |
| بروتين الريبوسوم L6 | RpL6 | 2 | EF207960 | 16 | AY769273 |
| بروتين الريبوسوم P2 | RpP2 | 2 | EF207959 | 16 | AY769269 |
| الجلوتاثيون س-ناقل | ضريبة السلع والخدمات | 3 | EF207961 | 6 | AJ006502 |
| بروتين الريبوسوم L15 د | RpL15 | 3 | DN172764 | 6 | AY769285 |
| مانوز - فوسفات أيزوميراز ج | MPI | 3 | AY332460 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S6 | RpS6 | 4 | EF207950 | 21 | AY769320 |
| بروتين الريبوسوم S15 | RpS15 | 4 | EF207951 | 21 | AY706957 |
| بروتين الريبوسوم S17 | RpS17 | 4 | EF207952 | 21 | AY769333 |
| بروتين الريبوسوم L11 ب | RpL11 | 5 | CO729501 | 3 | AY769280 |
| بروتين الريبوسوم L13A | RpL13A | 5 | EF207949 | 3 | AY769283 |
| منتج الجين المرتبط بالإنزيم المحفز بالـ Ecdysteroid | تعصب | 6 | EF207953 | 9 | AB026110 |
| بروتين الريبوسوم S14 د | RpS14 | 6 | CX700812 | 9 | AY706956 |
| محفور | م | 7 | AY745328 | 2 | M64335 |
| مستتر ج | Inv | 7 | DQ445457 | 2 | M64336 |
| بروتين الريبوسوم S21 | روبية 21 | 7 | DN172654 ، CX700448 | 2 | AY578154 |
| بروتين الريبوسوم S28 | روبية 28 | 7 | EF452418 | 2 | AY583363 |
| بروتين الريبوسوم L14 | RpL14 | 7 | EF207954 | 11 | AY769284 |
| بروتين الريبوسوم L18 | RpL18 | 7 | EF207955 ، EF211970 | 11 | AY769287 |
| الريبوسوم Sop2 | Sop2 | 7 | DT663968 ، EF211973 | 11 | AY763110 |
| أقل البعيدة ج | دلل | 7 | DQ445415 | — | — |
| الجين البروتيني للتحكم في نقطة التفتيش الانقسامية (bub3) | بوب 3 | 7 | CX700513 | — | — |
| بروتين بولي كومب سو (ض) 12 | سو (ض) 12 | 7 | DT662097 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S25 | 25 روبية | 8 | EF207956 | 25 | AY769340 |
| chiB (سلائف الكيتيناز) | الفصل | 9 | CX700556 ، EF211966 | 7 | AF052914 |
| متماثل مثبط الريبونوكليز L | RLI | 9 | EF207958 | 7 | AB164193 |
| بروتين الريبوسوم S27 | RpS27 | 9 | EF207957 | 7 | AY769342 |
| الوحدة الفرعية التنظيمية للكينازات المعتمدة على Cyclin | سيكس | 9 | سي اكس 700558 | — | — |
| عامل الاستطالة 1α ب | Ef1a | 10 | AY747994 | 5 | D13338 |
| عامل الاستطالة 1δ | Ef1d | 10 | سي اكس 700886 | 5 | AB046366 |
| مرمم ب | Ptc | 10 | AY745373 | 5 | AADK01000387 |
| بروتين الريبوسوم L13 د | RpL13 | 10 | CO729603 | 5 | AY769282 |
| بروتين الريبوسوم L19 ب | RpL19 | 10 | سي اكس 700796 | 5 | AY769289 |
| بروتين الريبوسوم S11 د | RpS11 | 10 | سي اكس 700450 | ص | AY706955 |
| Opsin1 ب | OPS1 | 11 | AF126751 | 15 | AB047924 |
| بروتين الريبوسوم L5 ب | RpL5 | 11 | CO729889 | 15 | AY769272 |
| بروتين الريبوسوم L7A | RpL7A | 11 | EF207963 | 15 | AY769275 |
| بروتين الريبوسوم L10A ب | RpL10A | 11 | CO729740 | 15 | AY769279 |
| بروتين الريبوسوم P0 ب | RpP0 | 11 | CO729821 | 15 | AJ457827 |
| بروتين الريبوسوم S5 ب | RpS5 | 11 | CO729660 | 15 | AY769319 |
| بروتين الريبوسوم S8 ب | RpS8 | 11 | CX700851 | 15 | AY769322 |
| بروتين الريبوسوم L8 | RpL8 | 11 | EF207977 ، EF211969 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L30 د | 30 روبية | 11 | CO729949 | — | — |
| البروتين الغني بالجليسين | جي ار بي | 12 | EF207964 ، EF211967 | 8 | AB197877 |
| بيتا توبولين | Btub | 12 | EF207965 ، EF211964 | 20 | AB003287 |
| بروتين الريبوسوم S7 | RpS7 | 12 | EF207966 | 20 | AY769321 |
| بروتين الريبوسوم S20 | 20 روبية | 12 | CX700684 | 20 | AY769336 |
| إينولاس | إينو | 12 | EF207979 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L7 د | RpL7 | 12 | سي اكس 700625 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L27 | RpL27 | 12 | EF207978 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S12 د | روبية 12 | 12 | CX700631 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S16 | RpS16 | 13 | EF207967 | 14 | AY769332 |
| كالريتيكولين | اتفاقية حقوق الطفل | 13 | EF207968 | 22 | AB090887 |
| بروتين بشرة (EDG84A homolog) | EDG84A | 13 | CO729743 | 22 | AB017550 |
| PCNA | PCNA | 13 | CV526328 | 22 | AB002264 ، AB002265 |
| بروتين الريبوسوم L37 | RpL37 | 13 | DN172717 | 22 | AY769308 |
| بروتين الريبوسوم S4 | RpS4 | 13 | CO729938 | — | — |
| قرمزي ب | الخامس | 13 | AY691422 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L12 | RpL12 | 14 | EF207969 | 19 | AY769281 |
| عامل استطالة الترجمة حقيقية النواة 2 | eEF2 | 14 | سي اكس 700527 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S9 ج | RpS9 | 14 | CX700565 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L22 ج | RpL22 | 15 | CX700470 | 17 | AY769291 |
| بروتين الريبوسوم P40 ج | RpP40 | 15 | سي اكس 700776 | 17 | AB062685 |
| بروتين الريبوسوم S24 | RpS24 | 15 | EF207970 ، EF211972 | 17 | AY578155 |
| عامل بدء حقيقيات النوى 3 ب | eiF3B | 15 | EF207980 | — | — |
| صندوق رأس الشوكة J1 ج | فوكس | 15 | CR974474 | — | — |
| راب جيرانيغيرانيل ترانسفيراز ج | جيرترا | 15 | CR974474 | — | — |
| عامل الاستطالة 1γ | Ef1g | 16 | EF207971 | 18 | AB046361 |
| بروتين هيت شوك hsp21.4 | Hsp21.4 | 17 | EF207972 | 13 | AB195972 |
| بروتين ليم | Mlp | 17 | DT663321 | 13 | AY461436 |
| بروتين الريبوسوم L21 | RpL21 | 17 | CO729978 | 13 | AY769290 |
| بروتين الريبوسوم L31 ج | RpL31 | 17 | CX700740 | 13 | AY769301 |
| ترجمة ADP / ATP | ANT | 17 | EF207974 ، EF211962 | 24 | AY227000 |
| بروتين الريبوسوم L32 | RpL32 | 17 | EF207973 | 24 | AB048205 |
| Sui1 | Sui1 | 17 | CO729706 ، EF211974 | 24 | AY426343 |
| بروتين الريبوسوم L27a | RpL27a | 17 | EF207981 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S10 | RpS10 | 17 | EF207982 | — | — |
| صدفي ج | اس دي | 17 | DQ674429 | — | — |
| بي ام 44 | بي ام 44 | 18 | DT664299 | 23 | AB158647 |
| مثبط لبروتين موت الخلايا المبرمج | الشراء داخل التطبيق | 18 | CV526245 ، EF211968 | 23 | AF281073 |
| بروتين الريبوسوم S30 | 30 روبية | 18 | سي اكس 700724 | 23 | AY769346 |
| Cubitus interruptus ب | ci | 18 | AY429297 | يو | AF529422 |
| 90 كيلو دالتون بروتين الصدمة الحرارية | 90 ساعة | 18 | CO729719 ، EF211960 | يو | AB060275 |
| ألفا توبولين | أتوب | 18 | EF207983 ، EF211963 | — | — |
| ا-جليكوزيل ترانسفيراز د | Ogt | 18 | CV526007 | — | — |
| مشلول ب | موانئ دبي | 19 | AY747899 | 12 | BAAB01102755 |
| بروتين يحتوي على المجال J | JDP | 19 | DT662955 | 12 | AF176014 |
| بروتين الريبوسوم L9 | RpL9 | 19 | EF207975 | 12 | AY769277 |
| بروتين عضلي 20 | النائب 20 | 19 | CO729543 | — | — |
| طليعة إنزيم منشط للبروبينول أوكسيديز | PPAE | 19 | CO729777 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L44 ج | RpL44 | 19 | CX700847 | — | — |
| كاسباس -1 | كاسباس | 20 | EF207976 ، EF211965 | 10 | AF448494 |
| بروتين رابط لهرمون الأحداث العصاري الخلوي | جهبة | 20 | DT661817 | 10 | AF098303 |
| أكتين 1 | يمثل | 20 | EF207985 ، EF211961 | — | — |
| الكالسيوم ATPase | قبعة | 20 | CO729824 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L23A | RpL23A | 20 | EF207984 ، EF211971 | — | — |
| من غير إمتدادات ب | ملائم | 21 (ض) | AY747887 | 1 (ض) | AB024903 |
| ترايوز-فوسفات أيزوميراز ب | TPI | 21 (ض) | AY548151 | 1 (ض) | AY734490 |
| اسم العلامة. | اختصار . | H. melpomene مجموعة الربط. | انضمام GenBank لا. . | ب. موري مجموعة الربط أ . | انضمام GenBank لا. . |
|---|---|---|---|---|---|
| Alanyl-tRNA synthetase | آاتس علاء | 1 | EF207962 | 4 | M55993 |
| دوبا ديكاربوكسيلاز ب | DDC | 1 | AY437802 | 4 | AF372836 |
| بروتين الريبوسوم L3 ب | RpL3 | 1 | EE743523 | 4 | AB024901 |
| بلا أجنحة ج | Wg | 1 | AY745485 | 4 | D14169 |
| بروتين الريبوسوم L6 | RpL6 | 2 | EF207960 | 16 | AY769273 |
| بروتين الريبوسوم P2 | RpP2 | 2 | EF207959 | 16 | AY769269 |
| الجلوتاثيون س-ناقل | ضريبة السلع والخدمات | 3 | EF207961 | 6 | AJ006502 |
| بروتين الريبوسوم L15 د | RpL15 | 3 | DN172764 | 6 | AY769285 |
| مانوز - فوسفات أيزوميراز ج | MPI | 3 | AY332460 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S6 | RpS6 | 4 | EF207950 | 21 | AY769320 |
| بروتين الريبوسوم S15 | RpS15 | 4 | EF207951 | 21 | AY706957 |
| بروتين الريبوسوم S17 | RpS17 | 4 | EF207952 | 21 | AY769333 |
| بروتين الريبوسوم L11 ب | RpL11 | 5 | CO729501 | 3 | AY769280 |
| بروتين الريبوسوم L13A | RpL13A | 5 | EF207949 | 3 | AY769283 |
| منتج الجين المرتبط بالإنزيم المحفز بالـ Ecdysteroid | تعصب | 6 | EF207953 | 9 | AB026110 |
| بروتين الريبوسوم S14 د | RpS14 | 6 | CX700812 | 9 | AY706956 |
| محفور | م | 7 | AY745328 | 2 | M64335 |
| مستتر ج | Inv | 7 | DQ445457 | 2 | M64336 |
| بروتين الريبوسوم S21 | روبية 21 | 7 | DN172654 ، CX700448 | 2 | AY578154 |
| بروتين الريبوسوم S28 | روبية 28 | 7 | EF452418 | 2 | AY583363 |
| بروتين الريبوسوم L14 | RpL14 | 7 | EF207954 | 11 | AY769284 |
| بروتين الريبوسوم L18 | RpL18 | 7 | EF207955 ، EF211970 | 11 | AY769287 |
| الريبوسوم Sop2 | Sop2 | 7 | DT663968 ، EF211973 | 11 | AY763110 |
| أقل البعيدة ج | دلل | 7 | DQ445415 | — | — |
| الجين البروتيني للتحكم في نقطة التفتيش الانقسامية (bub3) | بوب 3 | 7 | CX700513 | — | — |
| بروتين بولي كومب سو (ض) 12 | سو (ض) 12 | 7 | DT662097 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S25 | 25 روبية | 8 | EF207956 | 25 | AY769340 |
| chiB (سلائف الكيتيناز) | الفصل | 9 | CX700556 ، EF211966 | 7 | AF052914 |
| متماثل مثبط الريبونوكليز L | RLI | 9 | EF207958 | 7 | AB164193 |
| بروتين الريبوسوم S27 | RpS27 | 9 | EF207957 | 7 | AY769342 |
| الوحدة الفرعية التنظيمية للكينازات المعتمدة على Cyclin | سيكس | 9 | سي اكس 700558 | — | — |
| عامل الاستطالة 1α ب | Ef1a | 10 | AY747994 | 5 | D13338 |
| عامل الاستطالة 1δ | Ef1d | 10 | سي اكس 700886 | 5 | AB046366 |
| مرمم ب | Ptc | 10 | AY745373 | 5 | AADK01000387 |
| بروتين الريبوسوم L13 د | RpL13 | 10 | CO729603 | 5 | AY769282 |
| بروتين الريبوسوم L19 ب | RpL19 | 10 | سي اكس 700796 | 5 | AY769289 |
| بروتين الريبوسوم S11 د | RpS11 | 10 | سي اكس 700450 | ص | AY706955 |
| Opsin1 ب | OPS1 | 11 | AF126751 | 15 | AB047924 |
| بروتين الريبوسوم L5 ب | RpL5 | 11 | CO729889 | 15 | AY769272 |
| بروتين الريبوسوم L7A | RpL7A | 11 | EF207963 | 15 | AY769275 |
| بروتين الريبوسوم L10A ب | RpL10A | 11 | CO729740 | 15 | AY769279 |
| بروتين الريبوسوم P0 ب | RpP0 | 11 | CO729821 | 15 | AJ457827 |
| بروتين الريبوسوم S5 ب | RpS5 | 11 | CO729660 | 15 | AY769319 |
| بروتين الريبوسوم S8 ب | روبية 8 | 11 | CX700851 | 15 | AY769322 |
| بروتين الريبوسوم L8 | RpL8 | 11 | EF207977 ، EF211969 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L30 د | 30 روبية | 11 | CO729949 | — | — |
| البروتين الغني بالجليسين | جي ار بي | 12 | EF207964 ، EF211967 | 8 | AB197877 |
| بيتا توبولين | Btub | 12 | EF207965 ، EF211964 | 20 | AB003287 |
| بروتين الريبوسوم S7 | RpS7 | 12 | EF207966 | 20 | AY769321 |
| بروتين الريبوسوم S20 | 20 روبية | 12 | CX700684 | 20 | AY769336 |
| إينولاس | إينو | 12 | EF207979 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L7 د | RpL7 | 12 | سي اكس 700625 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L27 | RpL27 | 12 | EF207978 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S12 د | روبية 12 | 12 | CX700631 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S16 | روبية 16 | 13 | EF207967 | 14 | AY769332 |
| كالريتيكولين | اتفاقية حقوق الطفل | 13 | EF207968 | 22 | AB090887 |
| بروتين بشرة (EDG84A homolog) | EDG84A | 13 | CO729743 | 22 | AB017550 |
| PCNA | PCNA | 13 | CV526328 | 22 | AB002264 ، AB002265 |
| بروتين الريبوسوم L37 | RpL37 | 13 | DN172717 | 22 | AY769308 |
| بروتين الريبوسوم S4 | RpS4 | 13 | CO729938 | — | — |
| قرمزي ب | الخامس | 13 | AY691422 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L12 | RpL12 | 14 | EF207969 | 19 | AY769281 |
| عامل استطالة الترجمة حقيقية النواة 2 | eEF2 | 14 | سي اكس 700527 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S9 ج | RpS9 | 14 | CX700565 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L22 ج | RpL22 | 15 | CX700470 | 17 | AY769291 |
| بروتين الريبوسوم P40 ج | RpP40 | 15 | سي اكس 700776 | 17 | AB062685 |
| بروتين الريبوسوم S24 | RpS24 | 15 | EF207970 ، EF211972 | 17 | AY578155 |
| عامل بدء حقيقيات النوى 3 ب | eiF3B | 15 | EF207980 | — | — |
| صندوق رأس الشوكة J1 ج | فوكس | 15 | CR974474 | — | — |
| راب جيرانيغيرانيل ترانسفيراز ج | جيرترا | 15 | CR974474 | — | — |
| عامل الاستطالة 1γ | Ef1g | 16 | EF207971 | 18 | AB046361 |
| بروتين هيت شوك hsp21.4 | Hsp21.4 | 17 | EF207972 | 13 | AB195972 |
| بروتين ليم | Mlp | 17 | DT663321 | 13 | AY461436 |
| بروتين الريبوسوم L21 | RpL21 | 17 | CO729978 | 13 | AY769290 |
| بروتين الريبوسوم L31 ج | RpL31 | 17 | CX700740 | 13 | AY769301 |
| ترجمة ADP / ATP | ANT | 17 | EF207974 ، EF211962 | 24 | AY227000 |
| بروتين الريبوسوم L32 | RpL32 | 17 | EF207973 | 24 | AB048205 |
| Sui1 | Sui1 | 17 | CO729706 ، EF211974 | 24 | AY426343 |
| بروتين الريبوسوم L27a | RpL27a | 17 | EF207981 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S10 | RpS10 | 17 | EF207982 | — | — |
| صدفي ج | اس دي | 17 | DQ674429 | — | — |
| بي ام 44 | بي ام 44 | 18 | DT664299 | 23 | AB158647 |
| مثبط لبروتين موت الخلايا المبرمج | الشراء داخل التطبيق | 18 | CV526245 ، EF211968 | 23 | AF281073 |
| بروتين الريبوسوم S30 | 30 روبية | 18 | سي اكس 700724 | 23 | AY769346 |
| Cubitus interruptus ب | ci | 18 | AY429297 | يو | AF529422 |
| 90 كيلو دالتون بروتين الصدمة الحرارية | 90 ساعة | 18 | CO729719 ، EF211960 | يو | AB060275 |
| ألفا توبولين | أتوب | 18 | EF207983 ، EF211963 | — | — |
| ا-جليكوزيل ترانسفيراز د | Ogt | 18 | CV526007 | — | — |
| مشلول ب | موانئ دبي | 19 | AY747899 | 12 | BAAB01102755 |
| بروتين يحتوي على المجال J | JDP | 19 | DT662955 | 12 | AF176014 |
| بروتين الريبوسوم L9 | RpL9 | 19 | EF207975 | 12 | AY769277 |
| بروتين عضلي 20 | النائب 20 | 19 | CO729543 | — | — |
| طليعة إنزيم منشط للبروبينول أوكسيديز | PPAE | 19 | CO729777 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L44 ج | RpL44 | 19 | CX700847 | — | — |
| كاسباس -1 | كاسباس | 20 | EF207976 ، EF211965 | 10 | AF448494 |
| بروتين رابط لهرمون الأحداث العصاري الخلوي | جهبة | 20 | DT661817 | 10 | AF098303 |
| أكتين 1 | يمثل | 20 | EF207985 ، EF211961 | — | — |
| الكالسيوم ATPase | قبعة | 20 | CO729824 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L23A | RpL23A | 20 | EF207984 ، EF211971 | — | — |
| من غير إمتدادات ب | ملائم | 21 (ض) | AY747887 | 1 (ض) | AB024903 |
| ترايوز-فوسفات أيزوميراز ب | TPI | 21 (ض) | AY548151 | 1 (ض) | AY734490 |
تم تعيين المواقع المحفوظة بتنسيق H. melpomene وتقويم العظام فيها ب. موري
| اسم العلامة. | اختصار . | H. melpomene مجموعة الربط. | انضمام GenBank لا. . | ب. موري مجموعة الربط أ . | انضمام GenBank لا. . |
|---|---|---|---|---|---|
| Alanyl-tRNA synthetase | آاتس علاء | 1 | EF207962 | 4 | M55993 |
| دوبا ديكاربوكسيلاز ب | DDC | 1 | AY437802 | 4 | AF372836 |
| بروتين الريبوسوم L3 ب | RpL3 | 1 | EE743523 | 4 | AB024901 |
| بلا أجنحة ج | Wg | 1 | AY745485 | 4 | D14169 |
| بروتين الريبوسوم L6 | RpL6 | 2 | EF207960 | 16 | AY769273 |
| بروتين الريبوسوم P2 | RpP2 | 2 | EF207959 | 16 | AY769269 |
| الجلوتاثيون س-ناقل | ضريبة السلع والخدمات | 3 | EF207961 | 6 | AJ006502 |
| بروتين الريبوسوم L15 د | RpL15 | 3 | DN172764 | 6 | AY769285 |
| مانوز - فوسفات أيزوميراز ج | MPI | 3 | AY332460 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S6 | RpS6 | 4 | EF207950 | 21 | AY769320 |
| بروتين الريبوسوم S15 | RpS15 | 4 | EF207951 | 21 | AY706957 |
| بروتين الريبوسوم S17 | RpS17 | 4 | EF207952 | 21 | AY769333 |
| بروتين الريبوسوم L11 ب | RpL11 | 5 | CO729501 | 3 | AY769280 |
| بروتين الريبوسوم L13A | RpL13A | 5 | EF207949 | 3 | AY769283 |
| منتج الجين المرتبط بالإنزيم المحفز بالـ Ecdysteroid | تعصب | 6 | EF207953 | 9 | AB026110 |
| بروتين الريبوسوم S14 د | RpS14 | 6 | CX700812 | 9 | AY706956 |
| محفور | م | 7 | AY745328 | 2 | M64335 |
| مستتر ج | Inv | 7 | DQ445457 | 2 | M64336 |
| بروتين الريبوسوم S21 | روبية 21 | 7 | DN172654 ، CX700448 | 2 | AY578154 |
| بروتين الريبوسوم S28 | روبية 28 | 7 | EF452418 | 2 | AY583363 |
| بروتين الريبوسوم L14 | RpL14 | 7 | EF207954 | 11 | AY769284 |
| بروتين الريبوسوم L18 | RpL18 | 7 | EF207955 ، EF211970 | 11 | AY769287 |
| الريبوسوم Sop2 | Sop2 | 7 | DT663968 ، EF211973 | 11 | AY763110 |
| أقل البعيدة ج | دلل | 7 | DQ445415 | — | — |
| الجين البروتيني للتحكم في نقطة التفتيش الانقسامية (bub3) | بوب 3 | 7 | CX700513 | — | — |
| بروتين بولي كومب سو (ض) 12 | سو (ض) 12 | 7 | DT662097 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S25 | 25 روبية | 8 | EF207956 | 25 | AY769340 |
| chiB (سلائف الكيتيناز) | الفصل | 9 | CX700556 ، EF211966 | 7 | AF052914 |
| متماثل مثبط الريبونوكليز L | RLI | 9 | EF207958 | 7 | AB164193 |
| بروتين الريبوسوم S27 | RpS27 | 9 | EF207957 | 7 | AY769342 |
| الوحدة الفرعية التنظيمية للكينازات المعتمدة على Cyclin | سيكس | 9 | سي اكس 700558 | — | — |
| عامل الاستطالة 1α ب | Ef1a | 10 | AY747994 | 5 | D13338 |
| عامل الاستطالة 1δ | Ef1d | 10 | سي اكس 700886 | 5 | AB046366 |
| مرمم ب | Ptc | 10 | AY745373 | 5 | AADK01000387 |
| بروتين الريبوسوم L13 د | RpL13 | 10 | CO729603 | 5 | AY769282 |
| بروتين الريبوسوم L19 ب | RpL19 | 10 | سي اكس 700796 | 5 | AY769289 |
| بروتين الريبوسوم S11 د | RpS11 | 10 | سي اكس 700450 | ص | AY706955 |
| Opsin1 ب | OPS1 | 11 | AF126751 | 15 | AB047924 |
| بروتين الريبوسوم L5 ب | RpL5 | 11 | CO729889 | 15 | AY769272 |
| بروتين الريبوسوم L7A | RpL7A | 11 | EF207963 | 15 | AY769275 |
| بروتين الريبوسوم L10A ب | RpL10A | 11 | CO729740 | 15 | AY769279 |
| بروتين الريبوسوم P0 ب | RpP0 | 11 | CO729821 | 15 | AJ457827 |
| بروتين الريبوسوم S5 ب | RpS5 | 11 | CO729660 | 15 | AY769319 |
| بروتين الريبوسوم S8 ب | روبية 8 | 11 | CX700851 | 15 | AY769322 |
| بروتين الريبوسوم L8 | RpL8 | 11 | EF207977 ، EF211969 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L30 د | 30 روبية | 11 | CO729949 | — | — |
| البروتين الغني بالجليسين | جي ار بي | 12 | EF207964 ، EF211967 | 8 | AB197877 |
| بيتا توبولين | Btub | 12 | EF207965 ، EF211964 | 20 | AB003287 |
| بروتين الريبوسوم S7 | RpS7 | 12 | EF207966 | 20 | AY769321 |
| بروتين الريبوسوم S20 | 20 روبية | 12 | CX700684 | 20 | AY769336 |
| إينولاس | إينو | 12 | EF207979 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L7 د | RpL7 | 12 | سي اكس 700625 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L27 | RpL27 | 12 | EF207978 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S12 د | روبية 12 | 12 | CX700631 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S16 | روبية 16 | 13 | EF207967 | 14 | AY769332 |
| كالريتيكولين | اتفاقية حقوق الطفل | 13 | EF207968 | 22 | AB090887 |
| بروتين بشرة (EDG84A homolog) | EDG84A | 13 | CO729743 | 22 | AB017550 |
| PCNA | PCNA | 13 | CV526328 | 22 | AB002264 ، AB002265 |
| بروتين الريبوسوم L37 | RpL37 | 13 | DN172717 | 22 | AY769308 |
| بروتين الريبوسوم S4 | RpS4 | 13 | CO729938 | — | — |
| قرمزي ب | الخامس | 13 | AY691422 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L12 | RpL12 | 14 | EF207969 | 19 | AY769281 |
| عامل استطالة الترجمة حقيقية النواة 2 | eEF2 | 14 | سي اكس 700527 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S9 ج | RpS9 | 14 | CX700565 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L22 ج | RpL22 | 15 | CX700470 | 17 | AY769291 |
| بروتين الريبوسوم P40 ج | RpP40 | 15 | سي اكس 700776 | 17 | AB062685 |
| بروتين الريبوسوم S24 | RpS24 | 15 | EF207970 ، EF211972 | 17 | AY578155 |
| عامل بدء حقيقيات النوى 3 ب | eiF3B | 15 | EF207980 | — | — |
| صندوق رأس الشوكة J1 ج | فوكس | 15 | CR974474 | — | — |
| راب جيرانيغيرانيل ترانسفيراز ج | جيرترا | 15 | CR974474 | — | — |
| عامل الاستطالة 1γ | Ef1g | 16 | EF207971 | 18 | AB046361 |
| بروتين هيت شوك hsp21.4 | Hsp21.4 | 17 | EF207972 | 13 | AB195972 |
| بروتين ليم | Mlp | 17 | DT663321 | 13 | AY461436 |
| بروتين الريبوسوم L21 | RpL21 | 17 | CO729978 | 13 | AY769290 |
| بروتين الريبوسوم L31 ج | RpL31 | 17 | CX700740 | 13 | AY769301 |
| ترجمة ADP / ATP | ANT | 17 | EF207974 ، EF211962 | 24 | AY227000 |
| بروتين الريبوسوم L32 | RpL32 | 17 | EF207973 | 24 | AB048205 |
| Sui1 | Sui1 | 17 | CO729706 ، EF211974 | 24 | AY426343 |
| بروتين الريبوسوم L27a | RpL27a | 17 | EF207981 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S10 | RpS10 | 17 | EF207982 | — | — |
| صدفي ج | اس دي | 17 | DQ674429 | — | — |
| بي ام 44 | بي ام 44 | 18 | DT664299 | 23 | AB158647 |
| مثبط لبروتين موت الخلايا المبرمج | الشراء داخل التطبيق | 18 | CV526245 ، EF211968 | 23 | AF281073 |
| بروتين الريبوسوم S30 | 30 روبية | 18 | سي اكس 700724 | 23 | AY769346 |
| Cubitus interruptus ب | ci | 18 | AY429297 | يو | AF529422 |
| 90 كيلو دالتون بروتين الصدمة الحرارية | 90 ساعة | 18 | CO729719 ، EF211960 | يو | AB060275 |
| ألفا توبولين | أتوب | 18 | EF207983 ، EF211963 | — | — |
| ا-جليكوزيل ترانسفيراز د | Ogt | 18 | CV526007 | — | — |
| مشلول ب | موانئ دبي | 19 | AY747899 | 12 | BAAB01102755 |
| بروتين يحتوي على المجال J | JDP | 19 | DT662955 | 12 | AF176014 |
| بروتين الريبوسوم L9 | RpL9 | 19 | EF207975 | 12 | AY769277 |
| بروتين عضلي 20 | النائب 20 | 19 | CO729543 | — | — |
| طليعة إنزيم منشط للبروبينول أوكسيديز | PPAE | 19 | CO729777 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L44 ج | RpL44 | 19 | CX700847 | — | — |
| كاسباس -1 | كاسباس | 20 | EF207976 ، EF211965 | 10 | AF448494 |
| بروتين رابط لهرمون الأحداث العصاري الخلوي | جهبة | 20 | DT661817 | 10 | AF098303 |
| أكتين 1 | يمثل | 20 | EF207985 ، EF211961 | — | — |
| الكالسيوم ATPase | قبعة | 20 | CO729824 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L23A | RpL23A | 20 | EF207984 ، EF211971 | — | — |
| من غير إمتدادات ب | ملائم | 21 (ض) | AY747887 | 1 (ض) | AB024903 |
| ترايوز-فوسفات أيزوميراز ب | TPI | 21 (ض) | AY548151 | 1 (ض) | AY734490 |
| اسم العلامة. | اختصار . | H. melpomene مجموعة الربط. | انضمام GenBank لا. . | ب. موري مجموعة الربط أ . | انضمام GenBank لا. . |
|---|---|---|---|---|---|
| Alanyl-tRNA synthetase | آاتس علاء | 1 | EF207962 | 4 | M55993 |
| دوبا ديكاربوكسيلاز ب | DDC | 1 | AY437802 | 4 | AF372836 |
| بروتين الريبوسوم L3 ب | RpL3 | 1 | EE743523 | 4 | AB024901 |
| بلا أجنحة ج | Wg | 1 | AY745485 | 4 | D14169 |
| بروتين الريبوسوم L6 | RpL6 | 2 | EF207960 | 16 | AY769273 |
| بروتين الريبوسوم P2 | RpP2 | 2 | EF207959 | 16 | AY769269 |
| الجلوتاثيون س-ناقل | ضريبة السلع والخدمات | 3 | EF207961 | 6 | AJ006502 |
| بروتين الريبوسوم L15 د | RpL15 | 3 | DN172764 | 6 | AY769285 |
| مانوز - فوسفات أيزوميراز ج | MPI | 3 | AY332460 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S6 | RpS6 | 4 | EF207950 | 21 | AY769320 |
| بروتين الريبوسوم S15 | RpS15 | 4 | EF207951 | 21 | AY706957 |
| بروتين الريبوسوم S17 | RpS17 | 4 | EF207952 | 21 | AY769333 |
| بروتين الريبوسوم L11 ب | RpL11 | 5 | CO729501 | 3 | AY769280 |
| بروتين الريبوسوم L13A | RpL13A | 5 | EF207949 | 3 | AY769283 |
| منتج الجين المرتبط بالإنزيم المحفز بالـ Ecdysteroid | تعصب | 6 | EF207953 | 9 | AB026110 |
| بروتين الريبوسوم S14 د | RpS14 | 6 | CX700812 | 9 | AY706956 |
| محفور | م | 7 | AY745328 | 2 | M64335 |
| مستتر ج | Inv | 7 | DQ445457 | 2 | M64336 |
| بروتين الريبوسوم S21 | روبية 21 | 7 | DN172654 ، CX700448 | 2 | AY578154 |
| بروتين الريبوسوم S28 | روبية 28 | 7 | EF452418 | 2 | AY583363 |
| بروتين الريبوسوم L14 | RpL14 | 7 | EF207954 | 11 | AY769284 |
| بروتين الريبوسوم L18 | RpL18 | 7 | EF207955 ، EF211970 | 11 | AY769287 |
| الريبوسوم Sop2 | Sop2 | 7 | DT663968 ، EF211973 | 11 | AY763110 |
| أقل البعيدة ج | دلل | 7 | DQ445415 | — | — |
| الجين البروتيني للتحكم في نقطة التفتيش الانقسامية (bub3) | بوب 3 | 7 | CX700513 | — | — |
| بروتين بولي كومب سو (ض) 12 | سو (ض) 12 | 7 | DT662097 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S25 | 25 روبية | 8 | EF207956 | 25 | AY769340 |
| chiB (سلائف الكيتيناز) | الفصل | 9 | CX700556 ، EF211966 | 7 | AF052914 |
| متماثل مثبط الريبونوكليز L | RLI | 9 | EF207958 | 7 | AB164193 |
| بروتين الريبوسوم S27 | RpS27 | 9 | EF207957 | 7 | AY769342 |
| الوحدة الفرعية التنظيمية للكينازات المعتمدة على Cyclin | سيكس | 9 | سي اكس 700558 | — | — |
| عامل الاستطالة 1α ب | Ef1a | 10 | AY747994 | 5 | D13338 |
| عامل الاستطالة 1δ | Ef1d | 10 | سي اكس 700886 | 5 | AB046366 |
| مرمم ب | Ptc | 10 | AY745373 | 5 | AADK01000387 |
| بروتين الريبوسوم L13 د | RpL13 | 10 | CO729603 | 5 | AY769282 |
| بروتين الريبوسوم L19 ب | RpL19 | 10 | سي اكس 700796 | 5 | AY769289 |
| بروتين الريبوسوم S11 د | RpS11 | 10 | سي اكس 700450 | ص | AY706955 |
| Opsin1 ب | OPS1 | 11 | AF126751 | 15 | AB047924 |
| بروتين الريبوسوم L5 ب | RpL5 | 11 | CO729889 | 15 | AY769272 |
| بروتين الريبوسوم L7A | RpL7A | 11 | EF207963 | 15 | AY769275 |
| بروتين الريبوسوم L10A ب | RpL10A | 11 | CO729740 | 15 | AY769279 |
| بروتين الريبوسوم P0 ب | RpP0 | 11 | CO729821 | 15 | AJ457827 |
| بروتين الريبوسوم S5 ب | RpS5 | 11 | CO729660 | 15 | AY769319 |
| بروتين الريبوسوم S8 ب | روبية 8 | 11 | CX700851 | 15 | AY769322 |
| بروتين الريبوسوم L8 | RpL8 | 11 | EF207977 ، EF211969 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L30 د | 30 روبية | 11 | CO729949 | — | — |
| البروتين الغني بالجليسين | جي ار بي | 12 | EF207964 ، EF211967 | 8 | AB197877 |
| بيتا توبولين | Btub | 12 | EF207965 ، EF211964 | 20 | AB003287 |
| بروتين الريبوسوم S7 | RpS7 | 12 | EF207966 | 20 | AY769321 |
| بروتين الريبوسوم S20 | 20 روبية | 12 | CX700684 | 20 | AY769336 |
| إينولاس | إينو | 12 | EF207979 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L7 د | RpL7 | 12 | سي اكس 700625 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L27 | RpL27 | 12 | EF207978 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S12 د | روبية 12 | 12 | CX700631 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S16 | روبية 16 | 13 | EF207967 | 14 | AY769332 |
| كالريتيكولين | اتفاقية حقوق الطفل | 13 | EF207968 | 22 | AB090887 |
| بروتين بشرة (EDG84A homolog) | EDG84A | 13 | CO729743 | 22 | AB017550 |
| PCNA | PCNA | 13 | CV526328 | 22 | AB002264 ، AB002265 |
| بروتين الريبوسوم L37 | RpL37 | 13 | DN172717 | 22 | AY769308 |
| بروتين الريبوسوم S4 | RpS4 | 13 | CO729938 | — | — |
| قرمزي ب | الخامس | 13 | AY691422 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L12 | RpL12 | 14 | EF207969 | 19 | AY769281 |
| عامل استطالة الترجمة حقيقية النواة 2 | eEF2 | 14 | سي اكس 700527 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S9 ج | RpS9 | 14 | CX700565 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L22 ج | RpL22 | 15 | CX700470 | 17 | AY769291 |
| بروتين الريبوسوم P40 ج | RpP40 | 15 | سي اكس 700776 | 17 | AB062685 |
| بروتين الريبوسوم S24 | RpS24 | 15 | EF207970 ، EF211972 | 17 | AY578155 |
| عامل بدء حقيقيات النوى 3 ب | eiF3B | 15 | EF207980 | — | — |
| صندوق رأس الشوكة J1 ج | فوكس | 15 | CR974474 | — | — |
| راب جيرانيغيرانيل ترانسفيراز ج | جيرترا | 15 | CR974474 | — | — |
| عامل الاستطالة 1γ | Ef1g | 16 | EF207971 | 18 | AB046361 |
| بروتين هيت شوك hsp21.4 | Hsp21.4 | 17 | EF207972 | 13 | AB195972 |
| بروتين ليم | Mlp | 17 | DT663321 | 13 | AY461436 |
| بروتين الريبوسوم L21 | RpL21 | 17 | CO729978 | 13 | AY769290 |
| بروتين الريبوسوم L31 ج | RpL31 | 17 | CX700740 | 13 | AY769301 |
| ترجمة ADP / ATP | ANT | 17 | EF207974 ، EF211962 | 24 | AY227000 |
| بروتين الريبوسوم L32 | RpL32 | 17 | EF207973 | 24 | AB048205 |
| Sui1 | Sui1 | 17 | CO729706 ، EF211974 | 24 | AY426343 |
| بروتين الريبوسوم L27a | RpL27a | 17 | EF207981 | — | — |
| بروتين الريبوسوم S10 | RpS10 | 17 | EF207982 | — | — |
| صدفي ج | اس دي | 17 | DQ674429 | — | — |
| بي ام 44 | بي ام 44 | 18 | DT664299 | 23 | AB158647 |
| مثبط لبروتين موت الخلايا المبرمج | الشراء داخل التطبيق | 18 | CV526245 ، EF211968 | 23 | AF281073 |
| بروتين الريبوسوم S30 | 30 روبية | 18 | سي اكس 700724 | 23 | AY769346 |
| Cubitus interruptus ب | ci | 18 | AY429297 | يو | AF529422 |
| 90 كيلو دالتون بروتين الصدمة الحرارية | 90 ساعة | 18 | CO729719 ، EF211960 | يو | AB060275 |
| ألفا توبولين | أتوب | 18 | EF207983 ، EF211963 | — | — |
| ا-جليكوزيل ترانسفيراز د | Ogt | 18 | CV526007 | — | — |
| مشلول ب | موانئ دبي | 19 | AY747899 | 12 | BAAB01102755 |
| بروتين يحتوي على المجال J | JDP | 19 | DT662955 | 12 | AF176014 |
| بروتين الريبوسوم L9 | RpL9 | 19 | EF207975 | 12 | AY769277 |
| بروتين عضلي 20 | النائب 20 | 19 | CO729543 | — | — |
| طليعة إنزيم منشط للبروبينول أوكسيديز | PPAE | 19 | CO729777 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L44 ج | RpL44 | 19 | CX700847 | — | — |
| كاسباس -1 | كاسباس | 20 | EF207976 ، EF211965 | 10 | AF448494 |
| بروتين رابط لهرمون الأحداث العصاري الخلوي | جهبة | 20 | DT661817 | 10 | AF098303 |
| أكتين 1 | يمثل | 20 | EF207985 ، EF211961 | — | — |
| الكالسيوم ATPase | قبعة | 20 | CO729824 | — | — |
| بروتين الريبوسوم L23A | RpL23A | 20 | EF207984 ، EF211971 | — | — |
| من غير إمتدادات ب | ملائم | 21 (ض) | AY747887 | 1 (ض) | AB024903 |
| ترايوز-فوسفات أيزوميراز ب | TPI | 21 (ض) | AY548151 | 1 (ض) | AY734490 |
التحليل التركيبي:
من بين العلامات المشتقة من cDNA المعينة حديثًا ، كانت 47 علامة متعامدة مع تلك التي تم تعيينها في ب. موري، والتي ، جنبًا إلى جنب مع 25 علامة متعامدة تم تعيينها مسبقًا (Jiggins وآخرون. 2005 بابانيكولاو وآخرون. 2005 جورون وآخرون. 2006 ب) ، نتج عنه رسم 72 علامة تقويمية في كلا النوعين. تمتد هذه العلامات على جميع الكروموسومات البالغ عددها 21 كروموسومًا H. melpomene و 27 من 28 كروموسوم ب. موري (الجدولان 1 و 2). أظهرت هذه العلامات العلاقات التركيبية المحفوظة تمامًا بين النوعين وسمحت بتحديد الكروموسومات المتجانسة التي حددتها المجموعات المحفوظة لمواضع الربط. سقط ثمانية وثلاثون علامة في 15 H. melpomene LGs ، كل منها يتوافق مع كروموسوم واحد متماثل في ب. موري كل من هذه LGs احتوت بين واحد وسبعة علامات متعامدة (الجدول 2).
ملخص مجموعة الارتباط المتماثل وعلامات نمط اللون
| H. melpomene مجموعة الربط. | ب. موري مجموعة الربط. | عدد الجينات المشتركة لكلا النوعين. | H. melpomene علامة نمط اللون أ . |
|---|---|---|---|
| 1 | 4 | 4 | ك |
| 2 | 16 | 2 | — |
| 3 | 6 | 2 | — |
| 4 | 21 | 3 | — |
| 5 | 3 | 2 | — |
| 6 | 9 | 2 | — |
| 7 | 2, 11 | 7 | — |
| 8 | 25 | 1 | — |
| 9 | 7 | 3 | — |
| 10 | 5 ، ص | 6 | مكيف |
| 11 | 15 | 7 | — |
| 12 | 8, 20 | 4 | — |
| 13 | 14, 22 | 5 | — |
| 14 | 19 | 1 | — |
| 15 | 17 | 3 | يب / سب / ن |
| 16 | 18 | 1 | — |
| 17 | 13, 24 | 7 | — |
| 18 | 23 ، يو | 5 | ب / د |
| 19 | 12 | 3 | — |
| 20 | 10 | 2 | — |
| 21 | 1 | 2 | — |
| غير متوفر | 26 | 0 | — |
| المجموع: 21 كروموسوم | المجموع: 28 كروموسوم | المجموع: 72 |
| H. melpomene مجموعة الربط. | ب. موري مجموعة الربط. | عدد الجينات المشتركة لكلا النوعين. | H. melpomene علامة نمط اللون أ . |
|---|---|---|---|
| 1 | 4 | 4 | ك |
| 2 | 16 | 2 | — |
| 3 | 6 | 2 | — |
| 4 | 21 | 3 | — |
| 5 | 3 | 2 | — |
| 6 | 9 | 2 | — |
| 7 | 2, 11 | 7 | — |
| 8 | 25 | 1 | — |
| 9 | 7 | 3 | — |
| 10 | 5 ، ص | 6 | مكيف |
| 11 | 15 | 7 | — |
| 12 | 8, 20 | 4 | — |
| 13 | 14, 22 | 5 | — |
| 14 | 19 | 1 | — |
| 15 | 17 | 3 | يب / سب / ن |
| 16 | 18 | 1 | — |
| 17 | 13, 24 | 7 | — |
| 18 | 23 ، يو | 5 | ب / د |
| 19 | 12 | 3 | — |
| 20 | 10 | 2 | — |
| 21 | 1 | 2 | — |
| غير متوفر | 26 | 0 | — |
| المجموع: 21 كروموسوم | المجموع: 28 كروموسوم | المجموع: 72 |
ملخص مجموعة الارتباط المتماثل وعلامات نمط الألوان
| H. melpomene مجموعة الربط. | ب. موري مجموعة الربط. | عدد الجينات المشتركة لكلا النوعين. | H. melpomene علامة نمط اللون أ . |
|---|---|---|---|
| 1 | 4 | 4 | ك |
| 2 | 16 | 2 | — |
| 3 | 6 | 2 | — |
| 4 | 21 | 3 | — |
| 5 | 3 | 2 | — |
| 6 | 9 | 2 | — |
| 7 | 2, 11 | 7 | — |
| 8 | 25 | 1 | — |
| 9 | 7 | 3 | — |
| 10 | 5 ، ص | 6 | مكيف |
| 11 | 15 | 7 | — |
| 12 | 8, 20 | 4 | — |
| 13 | 14, 22 | 5 | — |
| 14 | 19 | 1 | — |
| 15 | 17 | 3 | يب / سب / ن |
| 16 | 18 | 1 | — |
| 17 | 13, 24 | 7 | — |
| 18 | 23 ، يو | 5 | ب / د |
| 19 | 12 | 3 | — |
| 20 | 10 | 2 | — |
| 21 | 1 | 2 | — |
| غير متوفر | 26 | 0 | — |
| المجموع: 21 كروموسوم | المجموع: 28 كروموسوم | المجموع: 72 |
| H. melpomene مجموعة الربط. | ب. موري مجموعة الربط. | عدد الجينات المشتركة لكلا النوعين. | H. melpomene علامة نمط اللون أ . |
|---|---|---|---|
| 1 | 4 | 4 | ك |
| 2 | 16 | 2 | — |
| 3 | 6 | 2 | — |
| 4 | 21 | 3 | — |
| 5 | 3 | 2 | — |
| 6 | 9 | 2 | — |
| 7 | 2, 11 | 7 | — |
| 8 | 25 | 1 | — |
| 9 | 7 | 3 | — |
| 10 | 5 ، ص | 6 | مكيف |
| 11 | 15 | 7 | — |
| 12 | 8, 20 | 4 | — |
| 13 | 14, 22 | 5 | — |
| 14 | 19 | 1 | — |
| 15 | 17 | 3 | يب / سب / ن |
| 16 | 18 | 1 | — |
| 17 | 13, 24 | 7 | — |
| 18 | 23 ، يو | 5 | ب / د |
| 19 | 12 | 3 | — |
| 20 | 10 | 2 | — |
| 21 | 1 | 2 | — |
| غير متوفر | 26 | 0 | — |
| المجموع: 21 كروموسوم | المجموع: 28 كروموسوم | المجموع: 72 |
اندماج الكروموسومات:
بما يتفق مع الاختلاف في عدد الكروموسوم بينهما ب. موري (28) و H. melpomene (21) ، وجدنا دليلًا على 6 من 10 اندماج كروموسومي متوقع في Heliconiini المشتق (الشكل 2). اقترحت كل حالة أن اثنين من الكروموسومات من الأصناف القاعدية ، كما لا يزال يتم تمثيلها من قبل اثنين من الكروموسومات في ب. موري، قد انصهرت لتشكيل واحدة H. melpomene كروموسوم. كان من الممكن أن تكون الاندماجات الإضافية المتوقعة قد لا يتم اكتشافها إذا كانت قد اشتملت على زوج من الكروموسومات التي اندمجت أيضًا في ب. موري النسب أو متماثل ب. موري 26 كروموسوم الوحيد ب. موري كروموسوم ليس لدينا علامات مشتركة فيه H. melpomene (الجدول 2) ، يندمج إما في كروموسوم تم تحديده بالفعل على أنه مدمج (بمعنى آخر.، انصهار ثلاثي) أو لكروموسوم آخر يظهر حاليًا في تناظر 1: 1 مع ب. موري كروموسوم.
خرائط الارتباط للكروموسومات المندمجة افتراضيًا في H. melpomene بالمقارنة مع خرائط العلامات المحفوظة بتنسيق ب. موري (A – F ، المقابلة لستة كروموسومات مفترضة مدمجة مختلفة في H. melpomene). لاحظ الفرق في المقياس بين الخرائط. عدم وجود أشرطة الموضع لـ RpL13, ptc، و إف 1α في ب. موري يشير LG5 إلى أنه تم تعيين هذه العلامات باستخدام BAC-FISH بدلاً من تعيين ارتباط إعادة التركيب (انظر Yasukochi وآخرون. 2006). عدم وجود أشرطة الموضع لـ روبية 16 في ب. موري LG14 و H. melpomene يشير LG13 إلى عدم وجود تعيين إعادة التركيب في ب. موري ورسم خرائط إعادة التركيب في حضنة مختلفة (الحضنة 44 مقابل الحضنة 33 انظر المواد والطرق) في H. melpomene.
خرائط الارتباط للكروموسومات المندمجة افتراضيًا في H. melpomene بالمقارنة مع خرائط العلامات المحفوظة بتنسيق ب. موري (من A إلى F ، المقابلة لستة كروموسومات مفترضة مدمجة مختلفة في H. melpomene). لاحظ الفرق في المقياس بين الخرائط. عدم وجود أشرطة الموضع لـ RpL13, ptc، و إف 1α في ب. موري يشير LG5 إلى أنه تم تعيين هذه العلامات باستخدام BAC-FISH بدلاً من تعيين ارتباط إعادة التركيب (انظر Yasukochi وآخرون. 2006). عدم وجود أشرطة الموضع لـ روبية 16 في ب. موري LG14 و H. melpomene يشير LG13 إلى عدم وجود تعيين إعادة التركيب في ب. موري ورسم خرائط إعادة التركيب في حضنة مختلفة (الحضنة 44 مقابل الحضنة 33 انظر المواد والطرق) في H. melpomene.
حفظ الترتيب الجيني:
كان للكروموسومات الستة المفترضة التي قمنا بتعيين علامات جديدة لها موضعياً (الشكل 2) طول خريطة مجمعة يبلغ 627 سم ، مقارنةً مع ما يقدر بـ 424 سم لهذه الكروموسومات الستة نفسها باستخدام العلامات المتاحة سابقًا (Jiggins وآخرون. 2005). يرجع هذا إلى حد كبير إلى وظيفة اكتشاف الأخطاء في MapMaker ، مما يؤدي إلى تقدير منخفض بشكل مصطنع لمسافة إعادة التركيب في الخريطة السابقة (انظر المواد والأساليب). وهكذا ، على سبيل المثال ، كان لدى LG7 طول خريطة يبلغ 51.5 سم في الدراسة السابقة ، والذي يزيد إلى 61.4 سم مع مجموعة البيانات الحالية باستخدام اكتشاف الخطأ. ومع ذلك ، بدون اكتشاف الخطأ ، يزيد طول نفس الكروموسوم إلى 98 سم (الشكل 2 أ). لذلك يبدو من المحتمل أن يكون طول إعادة التركيب الإجمالي لـ H. melpomene الجينوم أكبر بكثير مما تم الإبلاغ عنه سابقًا. كشف التعيين أيضًا عن الاتجاه المحتمل لمعظم عمليات اندماج الكروموسومات (الشكل 2) ، بافتراض الحفاظ على ترتيب الجينات على الكروموسومات باستخدام علامتين فقط تم تعيينهما موضعياً. كان الحفاظ على ترتيب الجينات واضحًا في مقارنات H. melpomene كروموسوم 7 ل ب. موري الكروموسوم 2 و H. melpomene كروموسوم 10 إلى ب. موري كروموسوم 5 (الشكل 2 ، A و B). يعتمد الاستنتاج الأخير على المقارنة مع العلامات التي تم تعيينها بواسطة BAC-FISH في ب. موري (ياسوكوتشي وآخرون. 2006 الشكل 2 ب). حدث انعكاس واضح في ترتيب الجينات بين مرمم (ptc) و إف 1α (الشكل 2 ب) ، مما يشير إلى انقلاب الكروموسومات في سلالة واحدة أو أخرى. على الرغم من أن هذه المواقع مرتبطة ارتباطًا وثيقًا ، إلا أن عكس ترتيبها يؤدي إلى انخفاض كبير في الاحتمالية الإجمالية (احتمالية السجل = 2.38 ، ص & lt 0.004 ، من الترتيب المعكوس مقارنةً بالترتيب الموضح في الشكل 2 ب) ، فإن تعيين علامات إضافية لهذه المنطقة سيوفر اختبارًا لهذا الاستنتاج.
مراجع
رينويك ، ج. Annu. القس جينيه. 5, 81–120 (1972).
رينويك ، ج. في علم الوراثة البشرية. وقائع المؤتمر الدولي الرابع لعلم الوراثة البشرية ، 6-11 سبتمبر 1971 (محرران de Grouchy، J.، Ebling، FJG & amp Henderson، IW) 443-444 (Excerpta Medica، Amsterdam، 1972).
ليفيتان ، م. كتاب علم الوراثة البشرية (مطبعة جامعة أكسفورد ، أكسفورد ، 1988).
ساتون ، إم إي. مقدمة في علم الوراثة البشرية (هاركورت بريس جوفانوفيتش ، سان دييغو ، 1988).
طومسون ، MW ، McInnes ، R.R. & amp Willard ، H.F. علم الوراثة في الطب (دبليو بي سوندرز ، فيلادلفيا ، 1991).
روثويل ، ن. فهم علم الوراثة. نهج جزيئي (وايلي ليس ، نيويورك ، 1993).
كونور ، جي إم وأمبير فيرغسون سميث ، ماجستير علم الوراثة الطبية الأساسية (بلاكويل العلمية ، أكسفورد ، 1993).
مولر ، ر. & amp يونغ ، I.D. عناصر إيمري في علم الوراثة الطبية (تشرشل ليفينجستون ، إدنبرة ، 1995).
جورد ، إل بي ، كاري ، جي سي وأمبير وايت ، R.L. علم الوراثة الطبية (موسبي ، سانت لويس ، 1995).
جيليهرتر ، تي دي ، كولينز ، إف إس. & amp Ginsburg، D. مبادئ علم الوراثة الطبية (ويليامز وأمبير ويلكينز ، بالتيمور ، 1998).
ميرفي ، إ. & أمبير تشيس ، جنرال إلكتريك مبادئ الاستشارة الوراثية (الكتاب السنوي الطبي ، شيكاغو ، 1975).
Rieger ، R. ، Michaelis ، A. & amp Green ، M.M. مسرد علم الوراثة وعلم الوراثة الخلوية (Springer Verlag Heidelberg ، نيويورك ، 1976).
أوت ، ج. تحليل الارتباط الجيني البشري (مطبعة جامعة جونز هوبكنز ، بالتيمور ، 1991).
SynteBase / SynteView: أداة لتصور حفظ ترتيب الجينات في جينومات بدائية النواة
خلفية: لقد لوحظ مرارًا وتكرارًا أن ترتيب الجينات يُفقد بسرعة في جينومات بدائية النواة. ومع ذلك ، تم العثور على كتل تخليقية ثابتة عند مقارنة الأنواع البعيدة أكثر أو أقل. هذه الجينات التي تظل متجاورة باستمرار هي جاذبية المرشحين لدراسة تطور الجينوم وتعريف أكثر دقة لدورها الوظيفي. تتطلب مثل هذه الدراسات تصور الكتل المخلقة المحفوظة في عدد كبير من الجينومات في جميع المسافات التصنيفية.
نتائج: بعد مقارنة ما يقرب من 600 جينوم متسلسل بالكامل يشمل شجرة الحياة بدائية النواة بأكملها ، تم تجميع البيانات التركيبية المحسوبة في قاعدة بيانات علائقية ، SynteBase. تم تصميم SynteView لتصور الكتل المخلوطة المحفوظة في عدد كبير من الجينوم بعد اختيار واحد منهم كمرجع. وظائف SynteView مع البيانات المخزنة إما في SynteBase أو في قاعدة بيانات علائقية محلية الصنع للبيانات الشخصية. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن لهذا البرنامج أن يحسب بسرعة ويعرض توزيع الكتل المخلوطة المحفوظة في أزواج من الجينومات. تم تصميم هذه الأداة لتوفير ثروة من المعلومات حول كل جين تقويمي موضعي ، لتكون سهلة الاستخدام وقابلة للتخصيص. من الممكن أيضًا تنزيل تسلسل الجينات التي تنتمي إلى هذه الكتل المخلقة لمزيد من الدراسات. يمكن الوصول إلى SynteView من خلال Java Webstart على http://www.synteview.u-psud.fr.
استنتاج: يجيب SynteBase على الاستفسارات حول حفظ ترتيب الجينات ويصور SynteView النتائج التي تم الحصول عليها بطريقة مرنة وقوية توفر نظرة عامة مقارنة للتخليق المحفوظ في عدد كبير من الجينومات ، بغض النظر عن مسافاتها التصنيفية.
العبث ما هذا
أنا آسف ، لكن أعتقد أنك مخطئ. أنا متأكد. يمكنني إثبات ذلك. أرسل لي بريدًا إلكترونيًا في PM ، سنتحدث.
the Authoritarian message :)
لم يسمع تال